CHD8

CHD8
사용 가능한 구조물
PDB	직교 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	2CKA, 2DL6
식별자
별칭	CHD8, AUTS18, HELSNF1, 크로모도메인 헬리코아제 DNA 결합 단백질 8
외부 ID	OMIM: 610528 MGI: 1915022 호몰로진: 72405 GeneCard: CHD8
유전자 위치(인간)
쳇.	14번 염색체(인간)
끝	21,456,190 bp
유전자 위치(마우스)
쳇.	14번 염색체(쥐)
끝	52,257,780bp
RNA 표현 패턴
	표현된 상단
	소뇌반구; ; 폐를 끼치다; ; 소뇌; ; 수근신경; ; 콩팥을; ; 고환;
	추가 참조 표현식 데이터
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 온톨로지
분자함수	DNA 결합; 뉴클레오티드 결합; ATP 의존적 활동, DNA에 작용; GO:0008026 헬리카아제 활동; 염색질 제본; 메틸화 히스톤 결합; 무수산에 작용하는 수산화효소 활동; GO:0004003 DNA 헬리코아제 활성; GO:0001948 단백질 결합; 수산화효소 활동; ATP 바인딩; p53 바인딩; 베타 카테닌 바인딩; 히스톤 바인딩; 아르마딜로 반복 도메인 바인딩;
셀룰러 컴포넌트	핵종의; MLL1 복합체; 핵의; 단백질 함유 복합체;
생물학적 과정	전사 규정, DNA-템플링; RNA 중합효소 II에 의한 전사의 음성 조절; Wnt 신호 경로; 전사, DNA-템플릿; 전사의 양성적 조절, DNA-템플링; 두뇌 발달; 소화관 발달; RNA 중합효소 III에 의한 전사의 양성 조절; 표준 Wnt 신호 경로의 음의 규제; RNA 중합효소 II에 의한 전사의 양성 조절; DNA 이중 언더블링; 염색질 조직; Wnt 신호 경로에 대한 음의 규제; 전사의 음성적 조절, DNA-템플링; 표준 Wnt 신호 경로; 세포핵 과정에 대한 부정적인 규제; 자궁 내 배아 발달; 깜짝 반응; 사회적 행동; 억제를 미리 억제하다.; 섬유질 사멸 공정의 음성적 규제;
	출처:아미고 / 퀵고
직교체
	57680
	67772
	ENSG00000100888
	ENSMUSG00000053754
	Q9HCK8
	Q09XV5
	NM_020920; NM_001170629
	NM_001010928; NM_201637
	NP_001164100; NP_065971
	NP_963999
	위키다타
인간 보기/편집	마우스 보기/편집

크로모도메인-헬리카아제-DNA 결합 단백질 8은 인간에서 CHD8 유전자에 의해 암호화된 효소다.^[5]^[6]

함수

유전자 CHD8은 태아발달에 필수적인 염색질 조절 효소인 ^[7]크로모도메인 헬리코아제 DNA 결합 단백질 8을 암호화하고 있다.^[8] CHD8은 ATP 의존 효소다.^[9]

단백질은 ATP에서 ADP로의 가수분해를 담당하는 Snf2 헬리코아제 영역을 포함하고 있다.^[9] CHD8은 뉴클레오솜의 위치를 변경하여 염색체 구조를 개조하여 전사 억제제 역할을 하는 DNA 헬리코아제를 위한 인코딩이다.^[8] CHD8은 Wnt 신호를 부정적으로 조절한다.^[10] Wnt 신호는 척추동물의 초기 발달과 형태생식에 중요하다. CHD8도 링커 히스톤 H1을 모집하여 β-카테닌과 p53 표적 유전자의 억압을 유발한다고 생각된다.^[7] CHD8의 중요성은 P53 유도 사멸이 만연해 5.5일 후에 CHD8 녹아웃 생쥐가 죽은 연구에서 관찰할 수 있다.^[7]

임상적 유의성

이 유전자의 돌연변이는 인간과 쥐의 모델에서 자폐증의^[11] 일부와 연관되어 왔다.^[12]

CHD8의 돌연변이는 β-카테닌 조절 유전자의 상향 조절을 유발할 수 있으며, 이 상향 조절은 자폐아동의 15-35%에서 발생하는 대뇌 과성장을 유발할 수 있다.^[8]

일부 연구는 자폐 스펙트럼 장애(ASD)에서 CHD8의 역할을 규명했다.^[8] CHD8 표현은 인간의 중간 태아 발달 동안 현저하게 증가한다.^[7] 염색질 개조 활동과 전사 규제 기관과의 상호작용은 ASD 항생물학에서 중요한 역할을 하는 것으로 나타났다.^[13] 발달한 포유류 뇌는 ASD 위험 유전자와 관련된 보존된 CHD8 표적 부위를 가지고 있다.^[8] 인간 신경 줄기세포에서 CHD8의 녹다운은 CHD8이 목표로 하는 ASD 위험 유전자의 조절을 잘못하는 결과를 낳는다.^[14]

참조

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000100888 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000053754 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Nagase T, Kikuno R, Nakayama M, Hirosawa M, Ohara O (August 2000). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Research. 7 (4): 273–81. doi:10.1093/dnares/7.4.271. PMID 10997877.
^ "Entrez Gene: CHD8 chromodomain helicase DNA binding protein 8".
^ ^a ^b ^c ^d Nishiyama M, Oshikawa K, Tsukada Y, Nakagawa T, Iemura S, Natsume T, et al. (February 2009). "CHD8 suppresses p53-mediated apoptosis through histone H1 recruitment during early embryogenesis". Nature Cell Biology. 11 (2): 172–82. doi:10.1038/ncb1831. PMC 3132516. PMID 19151705.
^ ^a ^b ^c ^d ^e Ronan JL, Wu W, Crabtree GR (May 2013). "From neural development to cognition: unexpected roles for chromatin". Nature Reviews. Genetics. 14 (5): 347–59. doi:10.1038/nrg3413. PMC 4010428. PMID 23568486.
^ ^a ^b Thompson BA, Tremblay V, Lin G, Bochar DA (June 2008). "CHD8 is an ATP-dependent chromatin remodeling factor that regulates beta-catenin target genes". Molecular and Cellular Biology. 28 (12): 3894–904. doi:10.1128/MCB.00322-08. PMC 2423111. PMID 18378692.
^ Nishiyama M, Skoultchi AI, Nakayama KI (January 2012). "Histone H1 recruitment by CHD8 is essential for suppression of the Wnt-β-catenin signaling pathway". Molecular and Cellular Biology. 32 (2): 501–12. doi:10.1128/MCB.06409-11. PMC 3255766. PMID 22083958.
^ Bernier R, Golzio C, Xiong B, Stessman HA, Coe BP, Penn O, et al. (July 2014). "Disruptive CHD8 mutations define a subtype of autism early in development". Cell. 158 (2): 263–276. doi:10.1016/j.cell.2014.06.017. PMC 4136921. PMID 24998929.
^ Gompers AL, Su-Feher L, Ellegood J, Copping NA, Riyadh MA, Stradleigh TW, et al. (August 2017). "Germline Chd8 haploinsufficiency alters brain development in mouse". Nature Neuroscience. 20 (8): 1062–1073. doi:10.1038/nn.4592. OSTI 1436635. PMC 6008102. PMID 28671691.
^ Sugathan A, Biagioli M, Golzio C, Erdin S, Blumenthal I, Manavalan P, et al. (October 2014). "CHD8 regulates neurodevelopmental pathways associated with autism spectrum disorder in neural progenitors". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111 (42): E4468-77. doi:10.1073/pnas.1405266111. PMC 4210312. PMID 25294932.
^ Cotney J, Muhle RA, Sanders SJ, Liu L, Willsey AJ, Niu W, et al. (March 2015). "The autism-associated chromatin modifier CHD8 regulates other autism risk genes during human neurodevelopment". Nature Communications. 6 (6): 6404. doi:10.1038/ncomms7404. PMC 4355952. PMID 25752243.

외부 링크

UCSC 게놈 브라우저의 인간 CHD8 게놈 위치 및 CHD8 유전자 세부 정보 페이지.
UniProt에 대한 PDB에서 사용할 수 있는 모든 구조 정보 개요: Q9PDBe-KB의 HCK8(크로모도메인-헬리카제-DNA 결합 단백질 8)

추가 읽기

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (June 2002). "Construction of expression-ready cDNA clones for KIAA genes: manual curation of 330 KIAA cDNA clones". DNA Research. 9 (3): 99–106. doi:10.1093/dnares/9.3.99. PMID 12168954.
Epplen C, Epplen JT (January 1994). "Expression of (cac)n/(gtg)n simple repetitive sequences in mRNA of human lymphocytes". Human Genetics. 93 (1): 35–41. doi:10.1007/BF00218910. PMID 7505766. S2CID 22998633.
Sakamoto I, Kishida S, Fukui A, Kishida M, Yamamoto H, Hino S, et al. (October 2000). "A novel beta-catenin-binding protein inhibits beta-catenin-dependent Tcf activation and axis formation". The Journal of Biological Chemistry. 275 (42): 32871–8. doi:10.1074/jbc.M004089200. PMID 10921920.
Kobayashi M, Hanai R (September 2001). "M phase-specific association of human topoisomerase IIIbeta with chromosomes". Biochemical and Biophysical Research Communications. 287 (1): 282–7. doi:10.1006/bbrc.2001.5580. PMID 11549288.
Kobayashi M, Kishida S, Fukui A, Michiue T, Miyamoto Y, Okamoto T, et al. (February 2002). "Nuclear localization of Duplin, a beta-catenin-binding protein, is essential for its inhibitory activity on the Wnt signaling pathway". The Journal of Biological Chemistry. 277 (8): 5816–22. doi:10.1074/jbc.M108433200. PMID 11744694.
Nishiyama M, Nakayama K, Tsunematsu R, Tsukiyama T, Kikuchi A, Nakayama KI (October 2004). "Early embryonic death in mice lacking the beta-catenin-binding protein Duplin". Molecular and Cellular Biology. 24 (19): 8386–94. doi:10.1128/MCB.24.19.8386-8394.2004. PMC 516734. PMID 15367660.
Lin KT, Lu RM, Tarn WY (October 2004). "The WW domain-containing proteins interact with the early spliceosome and participate in pre-mRNA splicing in vivo". Molecular and Cellular Biology. 24 (20): 9176–85. doi:10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC 517884. PMID 15456888.
Ishihara K, Oshimura M, Nakao M (September 2006). "CTCF-dependent chromatin insulator is linked to epigenetic remodeling". Molecular Cell. 23 (5): 733–42. doi:10.1016/j.molcel.2006.08.008. PMID 16949368.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (October 2006). "A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization". Nature Biotechnology. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (November 2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Yuan CC, Zhao X, Florens L, Swanson SK, Washburn MP, Hernandez N (December 2007). "CHD8 associates with human Staf and contributes to efficient U6 RNA polymerase III transcription". Molecular and Cellular Biology. 27 (24): 8729–38. doi:10.1128/MCB.00846-07. PMC 2169411. PMID 17938208.
Thompson BA, Tremblay V, Lin G, Bochar DA (June 2008). "CHD8 is an ATP-dependent chromatin remodeling factor that regulates beta-catenin target genes". Molecular and Cellular Biology. 28 (12): 3894–904. doi:10.1128/MCB.00322-08. PMC 2423111. PMID 18378692.
Caldon CE, Sergio CM, Schütte J, Boersma MN, Sutherland RL, Carroll JS, Musgrove EA (September 2009). "Estrogen regulation of cyclin E2 requires cyclin D1 but not c-Myc". Molecular and Cellular Biology. 29 (17): 4623–39. doi:10.1128/MCB.00269-09. PMC 2725719. PMID 19564413.
Nishiyama M, Oshikawa K, Tsukada Y, Nakagawa T, Iemura S, Natsume T, et al. (February 2009). "CHD8 suppresses p53-mediated apoptosis through histone H1 recruitment during early embryogenesis". Nature Cell Biology. 11 (2): 172–82. doi:10.1038/ncb1831. PMC 3132516. PMID 19151705.
Rodríguez-Paredes M, Ceballos-Chávez M, Esteller M, García-Domínguez M, Reyes JC (May 2009). "The chromatin remodeling factor CHD8 interacts with elongating RNA polymerase II and controls expression of the cyclin E2 gene". Nucleic Acids Research. 37 (8): 2449–60. doi:10.1093/nar/gkp101. PMC 2677868. PMID 19255092.
Yates JA, Menon T, Thompson BA, Bochar DA (February 2010). "Regulation of HOXA2 gene expression by the ATP-dependent chromatin remodeling enzyme CHD8" (PDF). FEBS Letters. 584 (4): 689–93. doi:10.1016/j.febslet.2010.01.022. hdl:2027.42/116349. PMID 20085832. S2CID 9956275.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000100888 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000053754 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid10997877-5] Nagase T, Kikuno R, Nakayama M, Hirosawa M, Ohara O (August 2000). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Research. 7 (4): 273–81. doi:10.1093/dnares/7.4.271. PMID 10997877.

[entrez-6] "Entrez Gene: CHD8 chromodomain helicase DNA binding protein 8".

[Nature_Cell-7] Nishiyama M, Oshikawa K, Tsukada Y, Nakagawa T, Iemura S, Natsume T, et al. (February 2009). "CHD8 suppresses p53-mediated apoptosis through histone H1 recruitment during early embryogenesis". Nature Cell Biology. 11 (2): 172–82. doi:10.1038/ncb1831. PMC 3132516. PMID 19151705.

[nature_neural_development-8] Ronan JL, Wu W, Crabtree GR (May 2013). "From neural development to cognition: unexpected roles for chromatin". Nature Reviews. Genetics. 14 (5): 347–59. doi:10.1038/nrg3413. PMC 4010428. PMID 23568486.

[atp-9] Thompson BA, Tremblay V, Lin G, Bochar DA (June 2008). "CHD8 is an ATP-dependent chromatin remodeling factor that regulates beta-catenin target genes". Molecular and Cellular Biology. 28 (12): 3894–904. doi:10.1128/MCB.00322-08. PMC 2423111. PMID 18378692.

[wnt_signaling-10] Nishiyama M, Skoultchi AI, Nakayama KI (January 2012). "Histone H1 recruitment by CHD8 is essential for suppression of the Wnt-β-catenin signaling pathway". Molecular and Cellular Biology. 32 (2): 501–12. doi:10.1128/MCB.06409-11. PMC 3255766. PMID 22083958.

[11] Bernier R, Golzio C, Xiong B, Stessman HA, Coe BP, Penn O, et al. (July 2014). "Disruptive CHD8 mutations define a subtype of autism early in development". Cell. 158 (2): 263–276. doi:10.1016/j.cell.2014.06.017. PMC 4136921. PMID 24998929.

[12] Gompers AL, Su-Feher L, Ellegood J, Copping NA, Riyadh MA, Stradleigh TW, et al. (August 2017). "Germline Chd8 haploinsufficiency alters brain development in mouse". Nature Neuroscience. 20 (8): 1062–1073. doi:10.1038/nn.4592. OSTI 1436635. PMC 6008102. PMID 28671691.

[CHD8_Autism-13] Sugathan A, Biagioli M, Golzio C, Erdin S, Blumenthal I, Manavalan P, et al. (October 2014). "CHD8 regulates neurodevelopmental pathways associated with autism spectrum disorder in neural progenitors". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111 (42): E4468-77. doi:10.1073/pnas.1405266111. PMC 4210312. PMID 25294932.

[autism_CHD8_regulates-14] Cotney J, Muhle RA, Sanders SJ, Liu L, Willsey AJ, Niu W, et al. (March 2015). "The autism-associated chromatin modifier CHD8 regulates other autism risk genes during human neurodevelopment". Nature Communications. 6 (6): 6404. doi:10.1038/ncomms7404. PMC 4355952. PMID 25752243.

[1]

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