WDR57

SNRNP40
사용 가능한 구조
PDB	Ortholog 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	3JCR
식별자
에일리어스	SNRNP40, 40K, HPRP8BP, PRP8BP, PRPF8BP, SPF38, WDR57, 소형 핵리보핵단백질 U5 서브유닛 40
외부 ID	OMIM: 607797 MGI: 1913835 HomoloGene: 3538 GeneCard: SNRNP40
유전자 위치(인간)
크르.	1번 염색체(인간)
끝.	31,296,788 bp
유전자 위치(마우스)
크르.	4번 염색체(쥐)
끝.	130,283,819 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	신경절 융기; ; 소뇌 반구; ; 뇌하수체 전엽; ; 경골 신경; ; 복부 피부; ; 좌측 자궁관; ; 자궁경관; ; 우측 자궁관; ; 비장; ; 직장;
	상단 표시 위치:
	신경절 융기; ; 신경관; ; 간뇌; ; 골수; ; 흉선; ; 정자 세포; ; 이차 난모세포; ; 노른자낭; ; 거울; ; 태반;
	추가 참조 표현식 데이터
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	단백질 결합; RNA결합;
셀룰러 컴포넌트	sno(s)RNA함유 리보핵단백질복합체; U5 snRNP; 촉매제2단계 스플라이세오솜; 스플라이소좀복합체; 전촉매성 스플라이소좀; 핵; 핵소체; 세포; 핵반점; U2형 촉매 2단계 스플라이세오솜;
생물학적 과정	RNA 스플라이싱, 에스테르 교환 반응을 통해; mRNA 스플라이싱, 스플라이싱 경유; mRNA 처리; RNA 처리; RNA 스플라이싱;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	9410
	66585
	ENSG000060688
	ENSMUSG000074088
	Q96DI7
	Q6PE01
	NM_004814
	NM_025645
	NP_004805
	NP_079921
	위키데이터
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WDR57로도 알려진 WD 반복 도메인 57(U5 snRNP 특이적)은 호모 사피엔스, 갈루스, 판 트로글로디테스, 카누스 친숙한 카누스,^[5] 보소루스, 무스 근육, 그리고 라투스 노르베기치쿠스를 포함한 많은 유기체에서 발견되는 유전자이다.

기능.

이 유전자는 U5 소핵 리보핵단백질(snRNP) 입자의 성분을 암호화한다.U5 snRNP는 프리메신저 ^[5]RNA에서 인트론의 제거를 촉매하는 다단백질 복합체인 스플라이세오솜의 일부이다.

상호 작용

WDR57은 PRPF8^[6]^[7] 및 EFTUD2와 ^[6]^[7]상호작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG000060688 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000074088 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ ^a ^b "Entrez Gene: WDR57 WD repeat domain 57 (U5 snRNP specific)".
^ ^a ^b Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Molecular Systems Biology. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ ^a ^b Achsel T, Ahrens K, Brahms H, Teigelkamp S, Lührmann R (Nov 1998). "The human U5-220kD protein (hPrp8) forms a stable RNA-free complex with several U5-specific proteins, including an RNA unwindase, a homologue of ribosomal elongation factor EF-2, and a novel WD-40 protein". Molecular and Cellular Biology. 18 (11): 6756–66. doi:10.1128/mcb.18.11.6756. PMC 109259. PMID 9774689.

추가 정보

Turner IA, Norman CM, Churcher MJ, Newman AJ (Dec 2004). "Roles of the U5 snRNP in spliceosome dynamics and catalysis". Biochemical Society Transactions. 32 (Pt 6): 928–31. doi:10.1042/BST0320928. PMID 15506927.
Neubauer G, King A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (Sep 1998). "Mass spectrometry and EST-database searching allows characterization of the multi-protein spliceosome complex". Nature Genetics. 20 (1): 46–50. doi:10.1038/1700. PMID 9731529. S2CID 585778.
Achsel T, Ahrens K, Brahms H, Teigelkamp S, Lührmann R (Nov 1998). "The human U5-220kD protein (hPrp8) forms a stable RNA-free complex with several U5-specific proteins, including an RNA unwindase, a homologue of ribosomal elongation factor EF-2, and a novel WD-40 protein". Molecular and Cellular Biology. 18 (11): 6756–66. doi:10.1128/mcb.18.11.6756. PMC 109259. PMID 9774689.
Makarov EM, Makarova OV, Achsel T, Lührmann R (May 2000). "The human homologue of the yeast splicing factor prp6p contains multiple TPR elements and is stably associated with the U5 snRNP via protein-protein interactions". Journal of Molecular Biology. 298 (4): 567–75. doi:10.1006/jmbi.2000.3685. PMID 10788320.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (Apr 2002). "Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis". RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017/S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Jordanova A, Irobi J, Thomas FP, Van Dijck P, Meerschaert K, Dewil M, Dierick I, Jacobs A, De Vriendt E, Guergueltcheva V, Rao CV, Tournev I, Gondim FA, D'Hooghe M, Van Gerwen V, Callaerts P, Van Den Bosch L, Timmermans JP, Robberecht W, Gettemans J, Thevelein JM, De Jonghe P, Kremensky I, Timmerman V (Feb 2006). "Disrupted function and axonal distribution of mutant tyrosyl-tRNA synthetase in dominant intermediate Charcot-Marie-Tooth neuropathy". Nature Genetics. 38 (2): 197–202. doi:10.1038/ng1727. PMID 16429158. S2CID 16668375.
Liu S, Rauhut R, Vornlocher HP, Lührmann R (Jul 2006). "The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP". RNA. 12 (7): 1418–30. doi:10.1261/rna.55406. PMC 1484429. PMID 16723661.
Higa LA, Wu M, Ye T, Kobayashi R, Sun H, Zhang H (Nov 2006). "CUL4-DDB1 ubiquitin ligase interacts with multiple WD40-repeat proteins and regulates histone methylation". Nature Cell Biology. 8 (11): 1277–83. doi:10.1038/ncb1490. hdl:10397/34293. PMID 17041588. S2CID 22180568.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Molecular Systems Biology. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG000060688 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000074088 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: WDR57 WD repeat domain 57 (U5 snRNP specific)".

[pmid17353931-6] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Molecular Systems Biology. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid9774689-7] Achsel T, Ahrens K, Brahms H, Teigelkamp S, Lührmann R (Nov 1998). "The human U5-220kD protein (hPrp8) forms a stable RNA-free complex with several U5-specific proteins, including an RNA unwindase, a homologue of ribosomal elongation factor EF-2, and a novel WD-40 protein". Molecular and Cellular Biology. 18 (11): 6756–66. doi:10.1128/mcb.18.11.6756. PMC 109259. PMID 9774689.

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