트랜스 스플링

Trans-splicing

트랜스 스플리싱(trans-splicing)은 서로 다른 두 개의 1차 RNA 대본에서 나온 엑손들이 끝에서 끝까지 결합되어 결합되는 RNA 처리의 특별한 형태다.이것은 보통 진핵생물에서 발견되고 스플라이소솜에 의해 매개되지만, 일부 박테리아와 고고학자는 tRNA에 대한 "반 유전자"를 가지고 있다.[1]null

게닉 트랜스 스플리싱

"정상"(cis-splicing)은 단일 분자를 처리하는 반면, 트랜스 스플리싱은 복수의 개별적인 사전 mRNA로부터 단일 RNA 대본을 생성한다.이 현상은 돌연변이 유전자 생산물을 다루는 분자 치료에 이용될 수 있다.[2]게닉 트랜스 스플리싱은 RNA 다양성의 변동을 허용하고 단백질의 복잡성을 증가시킨다.[3]null

온코제네시스

정상 인간 세포에서 트랜스 스플리싱을 통해 일부 융합 대본이 발생하는 반면, 트랜스 스플리싱은 특정 인공 융합 대본을 만드는 메커니즘이 될 수도 있다.[1][4][5]null

SL 트랜스 스플라이싱

스플라이즈 리더(SL) 트랜스 스플리싱은 특정 미생물, 특히 키네토플라스틱 계열의 양성자들이 유전자를 표현하기 위해 사용한다.이들 유기체에서, 뚜껑이 있는 스플라이스 리더 RNA는 전사되고, 동시에, 유전자는 긴 폴리시스트론 속에 전사된다.[6]캡을 씌운 스플라이스 리더는 각 유전자에 전이되어 단역학 캡과 폴리아데닐화 대본을 생성한다.[7]이 초기의 진핵생물은 인트론을 거의 사용하지 않으며, 그들이 가지고 있는 이음매는 그들의 구조 조립에서 특이한 변화를 보여준다.[7][8]그들은 또한 캡핑에 전문화된 역할을 가진 여러 개의 eIF4E ISO 양식을 보유하고 있다.[9]null

일부 다른 진핵생물들, 특히 디노플라겔라테스, 스펀지, 네마토드, 신나리아인, 크세노포스, 편충류, 갑각류, 차오각류, 회전식 및 튜네이트들 중 일부는 SL 트랜스 분할을 거의 자주 사용한다.[1][10]튜니케이트 시오나 장내염에서 SL 트랜스 스플링의 범위는 트랜스 스플라이드 대 비트랜스플라이드 유전자의 이항 및 재래식 분류보다는 빈번하게 그리고 드물게 트랜스 스플라이드 유전자를 인식하는 정량적 관점으로 더 잘 설명된다.[11]null

SL 변환은 피연산자의 폴리시스트로닉 대본을 개별 5'캡 mRNA로 분해하는 데 기능한다.이 처리 과정은 특이치가 개방된 판독 프레임에 인접한 비장애인 다운스트림 수용자 사이트로 전이될 때 달성된다.[12][13]null

참고 항목

참조

  1. ^ a b c Lei Q, Li C, Zuo Z, Huang C, Cheng H, Zhou R (March 2016). "Evolutionary Insights into RNA trans-Splicing in Vertebrates". Genome Biology and Evolution. 8 (3): 562–77. doi:10.1093/gbe/evw025. PMC 4824033. PMID 26966239.
  2. ^ Iwasaki R, Kiuchi H, Ihara M, Mori T, Kawakami M, Ueda H (July 2009). "Trans-splicing as a novel method to rapidly produce antibody fusion proteins". Biochemical and Biophysical Research Communications. 384 (3): 316–21. doi:10.1016/j.bbrc.2009.04.122. PMID 19409879.
  3. ^ Lasda, Erika L.; Blumenthal, Thomas (2011). "Trans-splicing". WIREs RNA. 2 (3): 417–434. doi:10.1002/wrna.71. ISSN 1757-7012.
  4. ^ Li H, Wang J, Mor G, Sklar J (September 2008). "A neoplastic gene fusion mimics trans-splicing of RNAs in normal human cells". Science. 321 (5894): 1357–61. Bibcode:2008Sci...321.1357L. doi:10.1126/science.1156725. PMID 18772439. S2CID 13605087.
  5. ^ Rickman DS, Pflueger D, Moss B, VanDoren VE, Chen CX, de la Taille A, et al. (April 2009). "SLC45A3-ELK4 is a novel and frequent erythroblast transformation-specific fusion transcript in prostate cancer". Cancer Research. 69 (7): 2734–8. doi:10.1158/0008-5472.CAN-08-4926. PMC 4063441. PMID 19293179.
  6. ^ Campbell DA, Sturm NR, Yu MC (February 2000). "Transcription of the kinetoplastid spliced leader RNA gene". Parasitology Today. 16 (2): 78–82. doi:10.1016/s0169-4758(99)01545-8. PMID 10652494.
  7. ^ a b Liang XH, Haritan A, Uliel S, Michaeli S (October 2003). "trans and cis splicing in trypanosomatids: mechanism, factors, and regulation". Eukaryotic Cell. 2 (5): 830–40. doi:10.1128/EC.2.5.830-840.2003. PMC 219355. PMID 14555465.
  8. ^ Günzl A (August 2010). "The pre-mRNA splicing machinery of trypanosomes: complex or simplified?". Eukaryotic Cell. 9 (8): 1159–70. doi:10.1128/EC.00113-10. PMC 2918933. PMID 20581293.
  9. ^ Freire ER, Sturm NR, Campbell DA, de Melo Neto OP (October 2017). "The Role of Cytoplasmic mRNA Cap-Binding Protein Complexes in Trypanosoma brucei and Other Trypanosomatids". Pathogens. 6 (4): 55. doi:10.3390/pathogens6040055. PMC 5750579. PMID 29077018.
  10. ^ Lasda EL, Blumenthal T (2011-05-01). "Trans-splicing". Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. 2 (3): 417–34. doi:10.1002/wrna.71. PMID 21957027. S2CID 209567118.
  11. ^ Matsumoto J, Dewar K, Wasserscheid J, Wiley GB, Macmil SL, Roe BA, et al. (May 2010). "High-throughput sequence analysis of Ciona intestinalis SL trans-spliced mRNAs: alternative expression modes and gene function correlates". Genome Research. 20 (5): 636–45. doi:10.1101/gr.100271.109. PMC 2860165. PMID 20212022.
  12. ^ Clayton, Christine E. (2002-04-15). "Life without transcriptional control? From fly to man and back again". The EMBO Journal. 21 (8): 1881–1888. doi:10.1093/emboj/21.8.1881. ISSN 1460-2075. PMC 125970. PMID 11953307.
  13. ^ Blumenthal, Thomas; Gleason, Kathy Seggerson (February 2003). "Caenorhabditis elegans operons: form and function". Nature Reviews Genetics. 4 (2): 110–118. doi:10.1038/nrg995. ISSN 1471-0056. PMID 12560808. S2CID 9864778.

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