아웃론

Outron

아웃론은 최종 RNA 제품이 성숙하는 동안 특별한 형태의 RNA 스플라이싱에 의해 제거되는 유전자의 1차 대본의 5의 끝에 있는 뉴클레오티드 시퀀스다.[1]인트론 시퀀스가 유전자 내부에 위치하는 반면, 아웃트론 시퀀스는 유전자 외부에 있다.[2]

특성.

아웃론은 G+C 함량[3] 및 스플라이스 수용체 사이트와 같은 유사한 특성을 가진 인트론 유사 시퀀스로, 트랜스 스플라이스 수용체 사이트는 트랜스 스플라이싱 신호다.[4][5]이러한 전이 부위는 기본적으로 업스트림 기증자(5') 이음 부위가 없는 수용자(3') 이음 부위로 정의된다.

In eukaryotes such as euglenozoans, dinoflagellates, sponges, nematodes, cnidarians, ctenophores, flatworms, crustaceans, chaetognaths, rotifers, and tunicates, the length of spliced leader (SL) outrons range from 30 to 102 nucleotides (nt), with the SL exon length ranging from 16 to 51 nt, and the full SL RNA length ranging from 46 to 141 nt.[3]

처리.

표준 시스 분할에서, 업스트림 위치에 있는 기증자 스플라이스 부지는 동일한 RNA 이전 분자의 다운스트림 위치에 위치한 수용자 부지와 함께 필요하다.대조적으로 SLtrans-splicing은 outron에 3'이어 맞추기 수용 사이트에 대한 5의 기증자 접속 사이트(GU 다이 뉴클레오타이드)은 SLRNA.[3]게다가, 미숙한 mRNA의 outron branchpoint 아데노신 —은intron-like porti며 상호 작용하는 다운 스트림 polypyrimidine 지역 —에 의해 있고 별도의 RNA분자에 의존하고 있다.에SL RNA의 Branched byproducts를 형성하는 것으로, 인트론 스플라이싱 중에 형성된 라소 구조를 연상시킨다.그 후 핵 기계는 SL RNA 시퀀스를 프리 mRNA의 3㎛ 트랜스-스플라이스 수용체 사이트(AG dinucleotide)로 전분해하여 이 'Y' 분기 구조를 해결한다.[2]

아웃론이 처리될 때, SL 엑손은 폴리시스트로닉 프리-mRNA의 각 개방된 판독 프레임에 인접한 구별되고, 손상되지 않은 다운스트림 수용자 사이트로 전이되어 뚜렷한 성숙한 캡슐화된 대본이 된다.[6][7][8]

참고 항목

참조

  1. ^ Conrad, Richard; Fen Liou, Ruey; Blumenthal, Thomas (1993-02-25). "Functional analysis of a C. elegans trans-splice acceptor". Nucleic Acids Research. 21 (4): 913–919. doi:10.1093/nar/21.4.913. ISSN 0305-1048. PMC 309224. PMID 8451190.
  2. ^ a b Stover, Nicholas A.; Kaye, Michelle S.; Cavalcanti, Andre R. O. (2006-01-10). "Spliced leader trans-splicing". Current Biology. 16 (1): R8–R9. doi:10.1016/j.cub.2005.12.019. ISSN 0960-9822. PMID 16401417.
  3. ^ a b c Lasda, Erika L.; Blumenthal, Thomas (2011-05-01). "Trans-splicing". Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. 2 (3): 417–434. doi:10.1002/wrna.71. PMID 21957027.
  4. ^ "Oxford reference — Outron". Retrieved 26 September 2019.
  5. ^ "The MISO Sequence Ontology Browser — Outron (SO:0001475)". Retrieved 26 September 2019.
  6. ^ Clayton, Christine E. (2002-04-15). "Life without transcriptional control? From fly to man and back again". The EMBO Journal. 21 (8): 1881–1888. doi:10.1093/emboj/21.8.1881. ISSN 1460-2075. PMC 125970. PMID 11953307.
  7. ^ Blumenthal, Thomas; Gleason, Kathy Seggerson (February 2003). "Caenorhabditis elegans operons: form and function". Nature Reviews Genetics. 4 (2): 110–118. doi:10.1038/nrg995. ISSN 1471-0056. PMID 12560808.
  8. ^ Lei Q, Li C, Zuo Z, Huang C, Cheng H, Zhou R (March 2016). "Evolutionary Insights into RNA trans-Splicing in Vertebrates". Genome Biology and Evolution. 8 (3): 562–77. doi:10.1093/gbe/evw025. PMC 4824033. PMID 26966239.