RybB RNA

RybB RNA
RybB RNA
RF00110.jpg
RybB의 예측된 2차 구조 및 배열 보존
식별자
기호.RybB
RfamRF00110
기타 데이터
RNA형진; sRNA
도메인박테리아
그렇게SO:0000655
PDB 구조PDBe

RybB는 대장균의 [1]대형 스크린에서 작은 비코드 RNA로 확인되었다.이 짧은 RNA의 기능은 생체 내 표적 mRNA 붕괴의 전사체 접근과 운동 분석을 사용하여 연구되었다.RybB는 엔벨로프 응력 [2]응답 유도 시 여러 주요 옴프 mRNA의 붕괴를 선택적으로 가속하는 인자로 확인되었다.이 RNA는 Hfq 단백질에 결합하는 것으로 나타났다.

살모넬라균에서는 RybB와 STM2391(fadL), STM1070(ompA), STM2267(ompC), STM1572(oMPD), STM0999(oMPF), STM1473(oMPNo)의 직접적인 상호작용이 실험적으로 확인되었다.

대장균에서 RybB와 b0805(fiu), b0721(sdhC), b2215(ompC), b1256(ompW), b2594(rluD) 및 b0081(mRAZ)[7][8][9][10]의 직접적인 상호작용이 실험적으로 확인되었다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Wassarman, KM; Repoila F; Rosenow C; Storz G; Gottesman S (2001). "Identification of novel small RNAs using comparative genomics and microarrays". Genes Dev. 15 (13): 1637–1651. doi:10.1101/gad.901001. PMC 312727. PMID 11445539.
  2. ^ Papenfort, K; Pfeiffer V; Mika F; Lucchini S; Hinton JC; Vogel J (2006). "SigmaE-dependent small RNAs of Salmonella respond to membrane stress by accelerating global omp mRNA decay". Mol. Microbiol. 62 (6): 1674–1688. doi:10.1111/j.1365-2958.2006.05524.x. PMC 1804206. PMID 17427289.
  3. ^ Papenfort K, Bouvier M, Mika F, Sharma CM, Vogel J (2010). "Evidence for an autonomous 5′ target recognition domain in an Hfq-associated small RNA". Proc Natl Acad Sci U S A. 107 (47): 20435–20440. Bibcode:2010PNAS..10720435P. doi:10.1073/pnas.1009784107. PMC 2996696. PMID 21059903.
  4. ^ Bouvier M, Sharma CM, Mika F, Nierhaus KH, Vogel J (2008). "Small RNA binding to 5′ mRNA coding region inhibits translational initiation". Mol Cell. 32 (6): 827–837. doi:10.1016/j.molcel.2008.10.027. PMID 19111662.
  5. ^ Balbontín R, Fiorini F, Figueroa-Bossi N, Casadesús J, Bossi L (2010). "Recognition of heptameric seed sequence underlies multi-target regulation by RybB small RNA in Salmonella enterica". Mol Microbiol. 78 (2): 380–394. doi:10.1111/j.1365-2958.2010.07342.x. PMID 20979336. S2CID 43670213.
  6. ^ Wright, PR (2012). hIntaRNA - Comparative prediction of sRNA targets in prokaryotes (Diploma). Albert-Ludwigs-Universität Freiburg.
  7. ^ Gogol EB, Rhodius VA, Papenfort K, Vogel J, Gross CA (2011). "Small RNAs endow a transcriptional activator with essential repressor functions for single-tier control of a global stress regulon". Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (31): 12875–12880. Bibcode:2011PNAS..10812875G. doi:10.1073/pnas.1109379108. PMC 3150882. PMID 21768388.
  8. ^ Desnoyers G, Massé E (2012). "Noncanonical repression of translation initiation through small RNA recruitment of the RNA chaperone Hfq". Genes Dev. 26 (7): 726–739. doi:10.1101/gad.182493.111. PMC 3323883. PMID 22474262.
  9. ^ Johansen J, Rasmussen AA, Overgaard M, Valentin-Hansen P (2006). "Conserved small non-coding RNAs that belong to the sigmaE regulon: role in down-regulation of outer membrane proteins". J Mol Biol. 364 (1): 1–8. doi:10.1016/j.jmb.2006.09.004. PMID 17007876.
  10. ^ Wright PR, Richter AS, Papenfort K, Mann M, Vogel J, Hess WR, Backofen R, Georg J (2013). "Comparative genomics boosts target prediction for bacterial small RNAs". Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (37): E3487–E3496. Bibcode:2013PNAS..110E3487W. doi:10.1073/pnas.1303248110. PMC 3773804. PMID 23980183.

외부 링크

Stub icon

이 분자 또는 세포 생물학 기사는 엉터리이다.위키피디아를 확장함으로써 위키피디아를 도울 수 있습니다.