단백질 G

Protein G
G단백질과 혼동하지 말 것.

단백질 G는 면역글로불린 결합 단백질로, 단백질 A와 매우 유사하지만 결합 특이성이 서로 다른 그룹 C와 G 스트렙토코칼 박테리아에서 발현된다.65kDa(G148단백질G)와 58kDa(C40단백질G)[1] 세포표면 단백질로 팹과 fc 지역에 결합해 항체를 정화하는 데 응용이 발견됐다.토종 분자도 알부민을 결합하지만 혈청 알부민이 항체 발생원의 주요 오염물질이기 때문에 알부민 결합 부위는 단백질 G의 재조합형에서 제거됐다.이 재조합 단백질 G는 불소포자 또는 단일 가닥의 DNA 가닥으로 라벨이 붙어있으며 면역불소화 및 초해상도 이미징에서 이차 항체를 대체하는 데 사용되었다.[2]

기타항체결합단백질

단백질 G 외에도 단백질 A, 단백질 A/G, 단백질 L과 같은 다른 면역글로불린 결합 박테리아 단백질이 면역글로불린을 정화, 고정 또는 검출하는 데 일반적으로 사용된다.이러한 면역글로불린 결합 단백질은 각각 인식되는 항체의 부분과 그것이 결합할 항체의 종류와 종류에 따라 항체 결합 프로파일이 다르다.

단백질 G 접힘, B1 도메인

단백질 G B1 영역의 초기화 시뮬레이션은 앞서 제시된 바와 같이, 이 단백질이 소수성 코어 잔여물의 핵 이벤트를 통해 접기를 시작하고 그 후에 작은 조정이 뒤따른다는 것을 보여준다.[3]접이식 이벤트는 다음과 같다.

  1. 잔류물 W43, Y45 및 F52에 의해 안정화된 β-헤어핀이 형성된다.
  2. 잔류물 F30, α-헬릭스 및 β-헤어핀 사이의 잔여 접촉부
  3. 잔류물 L5 및 F52에서 시작되는 β-시트 핵이 발생한다.
  4. 마지막 핵 잔류물인 Y3는 β-시트의 중심부를 형성하여 구상 단백질을 생성하는데 도움이 된다.

단백질 G1 영역은 (일명 GB1) 용액 실험(예: NMR) 중에 다른 영역을 용액에 보관하기 위해 퓨전 단백질의 일부로 자주 사용된다.이전에 풀리지 않았던 많은 도메인들이 GB1 도메인의 융합에 의해 수용 가능해졌다.[4]도메인 길이는 56개(약 8kDa)이다.SDS-PAGE gels에서 GB1 도메인은 8kDa에 불과함에도 불구하고 약 13.5kDa로 실행된다.[5]

참조

  1. ^ Sjobring U, Bjorck L, Kastern W, et al. (1991). "Streptococcal protein G. Gene structure and protein binding properties". J Biol Chem. 266 (1): 399–405. doi:10.1016/S0021-9258(18)52448-0. PMID 1985908.
  2. ^ Schlichthaerle, Thomas; Ganji, Mahipal; Auer, Alexander; Wade, Orsolya Kimbu; Jungmann, Ralf (2018). "Bacterial-derived antibody binders as small adapters for DNA-PAINT microscopy". ChemBioChem. 20 (8): 1032–1038. doi:10.1002/cbic.201800743. hdl:21.11116/0000-0003-E68E-A. ISSN 1439-7633. PMID 30589198. S2CID 58547594.
  3. ^ Kmiecik S, Kolinski A (Feb 2008). "Folding pathway of the b1 domain of protein G explored by multiscale modeling". Biophys J. 94 (3): 726–36. Bibcode:2008BpJ....94..726K. doi:10.1529/biophysj.107.116095. PMC 2186257. PMID 17890394.
  4. ^ Cheng, Yuan; Patel, Dinshaw J. (2004). "An efficient system for small protein expression and refolding". Biochemical and Biophysical Research Communications. 317 (2): 401–405. doi:10.1016/j.bbrc.2004.03.068. PMC 4693640. PMID 15063772.
  5. ^ Hartl MJ, Mayr F, Rethwilm A, Wöhrl BM (2010). "Biophysical and enzymatic properties of the simian and prototype foamy virus reverse transcriptases". Retrovirology. 7: 5. doi:10.1186/1742-4690-7-5. PMC 2835651. PMID 20113504.{{cite journal}}: CS1 maint : 복수이름 : 작성자 목록(링크)