프로세서 1

Proser1
프로세서 1
식별자
에일리어스2810046L04Rik9330161F11프롤린 및 세린 리치 1
외부 IDHomoloGene : 13463 GenCard : [ 1 ]
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

212127

없음

앙상블

ENSMUSG000049504

없음

유니프로트

Q5PRE5

없음

RefSeq(mRNA)

NM_173382

없음

RefSeq(단백질)

NP_775558

없음

장소(UCSC)Chr 3: 53.37 ~53.39 Mb없음
PubMed 검색[1]없음
위키데이터
인간 보기/편집

PROSER1은 인간에서 PROSER1 유전자에 [2]의해 암호화되는 단백질이다.

명명법

PROSER1에는 C13orf23, KIAA2032 및 프롤린 및 세린이 풍부한 단백질 [3]1이라는 여러 별칭이 있습니다.

진

13번 염색체의 PROSER1 위치.

위치

PROSER1은 13q13.3 위치에서 13번 염색체의 음(역) 가닥에 위치한다.이 값은 pter에서 39,009,865개의 베이스 쌍에서 pter에서 39,038,095 bp까지이며 크기는 28,231개의 [5]베이스입니다.PROSER1은 5,185 bp의 프라이머리 비절제 전사 mRNA에 총 13개의 엑손이 있습니다.PROSER1에는 2개의 isoforms가 있으며 모두 5,000bp 범위 [6]내에 있습니다.

유전자 근방

13번 [7]염색체의 STOML3 및 NHLRC3 인접 PROSER1 유전자.

조직 분포

인체 각 부위의 PROSER1 발현 수준을 나타내는 도표.

PROSER1 표현의 발현 시퀀스 태그 매핑은 림프, 배아 조직, 흉선 및 자궁 부위에서 특히 높은 발현을 보입니다.고환, 후두, 신경, 혈액, 지방 조직 [8]부위에서 중간 정도의 발현을 보입니다.Human Protein Atlas에 따르면 PROSER1은 일반적인 세포질 발현을 가지며 모든 RNA 조직 범주에서 발현된다.[9]

호몰로지

패럴로그

PROSER1에는 [10]패럴로그가 없습니다.

맞춤법

PROSER1은 포유동물들 사이에서 보존성이 높다.그것은 물고기, 새, 그리고 일부 무척추동물에서 잘 보존되지 않는 것으로 밝혀졌다.그것은 박테리아, 식물,[11] 곰팡이에서는 발현되지 않는다.아래는 NCBI에서 작성한 맞춤법 표입니다.

라틴어 이름 통칭 발산일(H. sapiens에서) 등록번호 단백질 배열 길이 시퀀스 아이덴티티 시퀀스 유사성
호모 사피엔스 인간 - NP_079414.3 944 아미노산 - -
고릴라고릴라 고릴라 890만년 전 XP_004054459 994 aa 99% 99%
코로부스앙골렌시스팔리아투스 앙골라콜로부스 29.1 MYA XP_011798372 947 aa 97% 97%
난노스팔락스갈릴리 스팔락스 90.9 MYA XP_008847583 916 aa 80% 85%
비단털쥐 중국햄스터 90.9 MYA XP_007626898 912 aa 79% 84%
판데라티그리스알타이카 시베리아 호랑이 97.5 MYA XP_007097793 665 aa 85% 89%
아키노닉스주바투스 치타 97.5 MYA XP_014926409 770 aaa 79% 83%
쯔루시우스카타스 큰돌고래 97.5 MYA XP_004332367 1064 aa 77% 83%
오니토린쿠스 아나티누스 오리너구리과 179.2 MYA XP_00766895 888 aa 69% 74%
킬로니아미다스 푸른바다거북 320.5 MYA XP_007070970 936 aa 75% 83%
아델리아오도리 아델리펭귄 320.5 MYA XP_009318201 938 aa 75% 83%
칼리드리스(철학) 퍼그넥스 러프 320.5 MYA XP_014821534 899 aa 74% 83%
히가시바리 칠거북 320.5 MYA XP_008175998 825 aa 73% 82%
아퀼라 크리새토스 카나덴시스 골든 도글 320.5 MYA XP_011579121 916 aa 73% 81%
엘리게이터시넨시스 중국악어 320.5 MYA XP_014376376 940 aa 72% 81%
히가시카미 일본 도마뱀붙이 320.5 MYA XP_015281837 1053 aa 65% 75%
비단뱀이비타투스 버마 파이썬 320.5 MYA XP_007438154 924 aa 65% 75%
아놀리스카롤리넨시스 캐롤리나 아놀 320.5 MYA XP_008124125 920 aa 64% 75%
크세노푸스 트로피컬리스 서양발톱개구리 355.7 MYA XP_012813331 944 aa 51% 63%
오큘라투스목 얼룩무늬가르 429.6 MYA XP_015197497 885 aa 47% 58%
카로린쿠스밀리 호주귀상어 482.9 MYA XP_007889503 965 aa 64% 75%

단백질

일반 속성

번역된 PROSER1 단백질은 944개의 아미노산 길이입니다.그것의 예상 분자량은 95.7 [12]kdal이다.PROSER1의 등전점은 [13]9입니다.그것은 [14]핵에 국한될 것으로 예측된다.

구성.

이 배열은 프롤린과 세린이 풍부하고 다른 아미노산도 특별히 낮지 않습니다.

도메인

PROSER1에는 pfam14771의 일부인 알 수 없는 기능의 도메인 DUF 4476이 포함되어 있습니다.DUF는 아미노산 26~[2]121에 이른다.DUF 4476의 분자량은 11.1 kdal이다.

PROSER1의 DUF 4476 상세 위치.

이차 구조

PROSER1은 주로 알파 나선, 베타 시트 및 코일로 구성됩니다.단백질은 크게 감겨 있다.DUF는 주로 알파 나선 및 코일로 구성됩니다.단백질 [15]전체에 비해 베타 시트가 약간 적다.

레퍼런스

  1. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  2. ^ "GeneCards". Human Gene Database.
  3. ^ "BioCompare". BioCompare.
  4. ^ "Ensembl". Ensembl.
  5. ^ "GeneCards". Human Gene Database.
  6. ^ "NCBI Gene". NCBI.
  7. ^ "NCBI Gene". NCBI.
  8. ^ "Uniprot". Uniprot.
  9. ^ "Tissue Atlas". The Human Protein Atlas.
  10. ^ "Ensembl". Ensembl.
  11. ^ "Ensembl". Ensembl.
  12. ^ "Uniprot". Uniprot.
  13. ^ "Expasy". Expasy.
  14. ^ "PSORT II Prediction". PSORT II.
  15. ^ "SDSC Biology Workbench". SDSC.