LSM7

LSM7
LSM7
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스LSM7, YNL147W, LSM7 호몰로그, U6 소형 핵 RNA 및 mRNA 분해 관련
외부 IDOMIM: 607287 MGI: 1913344 HomoloGene: 6781 GeneCard: LSM7
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_016199

NM_025349
NM_001359148
NM_001359149
NM_001359150

RefSeq(단백질)

NP_057283

NP_079625
NP_001346077
NP_001346078
NP_001346079

장소(UCSC)Chr 19: 2.32 ~2.33 MbChr 10: 80.69 ~80.69 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

U6 snRNA 관련 Sm 유사 단백질 LSm7LSM7 [5][6][7]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.

기능.

Sm 단백질 패밀리와의 배열 상동성을 기반으로 다양한 유기체에서 Sm 유사 단백질이 확인되었다(SNRPD2; MIM 601061 참조).Sm 유사 단백질은 루프로 접히는 가변 길이의 링커에 의해 분리된 2개의 영역으로 구성된 Sm 배열 모티브를 포함한다.Sm 유사 단백질은 tri-snRNP 입자에 존재하는 안정적인 헤테로머를 형성하는 것으로 생각되며, 이는 mRNA 전 스플라이싱에 중요하다.[OMIM [7]제공]

상호 작용

LSM7은 TACC1[8][9]LSM2[10][11]대화하는 으로 나타났습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000130332 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000035215 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Achsel T, Brahms H, Kastner B, Bachi A, Wilm M, Lührmann R (Oct 1999). "A doughnut-shaped heteromer of human Sm-like proteins binds to the 3'-end of U6 snRNA, thereby facilitating U4/U6 duplex formation in vitro". The EMBO Journal. 18 (20): 5789–802. doi:10.1093/emboj/18.20.5789. PMC 1171645. PMID 10523320.
  6. ^ Ingelfinger D, Arndt-Jovin DJ, Lührmann R, Achsel T (Dec 2002). "The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci". RNA. 8 (12): 1489–501. doi:10.1017/S1355838202021726 (inactive 28 February 2022). PMC 1370355. PMID 12515382.{{cite journal}}: CS1 유지 : 2022년 2월 현재 DOI 비활성화 (링크)
  7. ^ a b "Entrez Gene: LSM7 LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)".
  8. ^ Conte N, Delaval B, Ginestier C, Ferrand A, Isnardon D, Larroque C, Prigent C, Séraphin B, Jacquemier J, Birnbaum D (Nov 2003). "TACC1-chTOG-Aurora A protein complex in breast cancer". Oncogene. 22 (50): 8102–16. doi:10.1038/sj.onc.1206972. PMID 14603251.
  9. ^ Conte N, Charafe-Jauffret E, Delaval B, Adélaïde J, Ginestier C, Geneix J, Isnardon D, Jacquemier J, Birnbaum D (Aug 2002). "Carcinogenesis and translational controls: TACC1 is down-regulated in human cancers and associates with mRNA regulators". Oncogene. 21 (36): 5619–30. doi:10.1038/sj.onc.1205658. PMID 12165861.
  10. ^ Lehner B, Sanderson CM (Jul 2004). "A protein interaction framework for human mRNA degradation". Genome Research. 14 (7): 1315–23. doi:10.1101/gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
  11. ^ Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (Jan 2004). "Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region". Genomics. 83 (1): 153–67. doi:10.1016/S0888-7543(03)00235-0. PMID 14667819.

추가 정보