이미지 시토메트리 표준

ICS(Image Cytometry Standard)는 생명과학 현미경 검사에 사용되는 디지털 다차원 이미지 파일 형식이다.그것은 이미지 데이터뿐만 아니라 획득 중 광학을 설명하는 현미경 파라미터도 저장한다.

ICS는 P. Dean, L. Mascio, D.에서 처음 제안되었다.Ow, D. Sudar, J. Mullikin, 이미지 세포측정 데이터 파일에 대한 제안 표준, Cytometry, n. 11, 페이지 561-569, 1990 [1].

원래 ICS 파일 형식은 실제로 .ics 확장자를 가진 텍스트 헤더 파일과 다른 파일, 훨씬 크고 실제 이미지 데이터와 .ids 확장자를 가진 두 개의 별도 파일을 사용한다.이렇게 하면 헤더 파일에 액세스할 수 있는 상태에서 데이터를 압축할 수 있다.반면, 새로운 ICS2 파일 형식은 헤더와 데이터가 함께 있는 하나의 .ics 파일만 사용한다.

.ics는 2-파일 형식의 텍스트 파일로 탭으로 구분된 필드와 뉴라인 문자로 끝나는 줄이 있다.새로운 ICS2 형식에서 이 텍스트 헤더는 이진 데이터 앞에 있다.

ICS 형식은 다음을 저장할 수 있다.

• 다차원 및 다채널 데이터
• 8, 16, 32 또는 64비트 정수, 32 또는 64비트 부동 소수점 및 부동 소수점 복합 데이터 이미지
• 영상 형성과 직접 관련된 모든 현미경 파라미터
• 자유 형식의 논평

외부 링크

• LGPL v2.1 라이센스에 따라 공개된 ICS 파일 리더/라이터 라이브러리의 출처: https://github.com/svi-opensource/libics현재 버전은 2021년 8월 18일 발매된 1.6.5이다.
• Python 인터페이스와 libics 연결: 파이리브
• ImageJ용 ICS 오프너.
• Fiji용 Bio-Formats_(소프트웨어) / ImageJ.