HIV 개그 스템 루프 3(GSL3)

HIV gag stem loop 3 (GSL3)
HIV 개그 스템 루프 3(GSL3)
RF00376.jpg
HIV_GSL3의 예측된 2차 구조와 배열 보존
식별자
기호.HIV_GSL3
RfamRF00376
기타 데이터
RNA형시스레그
도메인바이러스
그렇게SO:0000233
PDB 구조PDBe

HIV Gag Stem Loop 3(GSL3)은 Retroviral Psi 패키징 요소의 2차 구조 컴포넌트이며 psi 인식 엘리먼트라고도 합니다.이 도메인은 RNA 패키징에 중요한 역할을 하며, 정제되지 않은 HIV-1 [1][2][3]게놈의 5' 미번역 영역에 위치합니다.GSL3는 HIV-1 게놈 RNA의 특정 포장을 지시하는 것으로 알려져 있다.GSL3의 결실은 바이러스 RNA 포장 및 이합체화의 감소를 가져오지만, 돌연변이 연구는 그것이 레트로바이러스 [4][5]RNA의 캡슐화를 제거하지는 않는다는 것을 보여주었다.

제약의 진보

NCp7과의 상호작용

RNA 캡슐화는 단백질 NCp7에 의한 psi 인식 요소의 검출을 포함한다.NCp7은 염기성 잔류물로 연결된 두 개의 연속된 아연 핑거를 포함합니다.이들의 기능은 개시 부위(역전사가 발생하는 [6]곳)에 대한 프라이머 tRNA의 어닐링을 활성화하는 것이다.이 프로세스 중에 GSL3는 특히 NCp7과 대화합니다.현재 HIV/AIDS 치료에 사용되는 의약품은 레트로 바이러스의 복제 사이클에서 기본적인 프로세스를 억제하고 있습니다.이 상호작용은 잠재적인 억제 지점이다.

억제 배위자

납 화합물의 예시입니다.상세한 것에 대하여는, 을 참조해 주세요.

억제제 개발은 아직 초기 단계에 머물러 있다.측면 상호작용과 잠재적으로 유해한 입체 이성질체의 존재를 제한하기 위해 단순한 분자 구조와 저분자량을 가진 화합물을 합성하는 도전은 계산적 [7]접근과 높은 처리량 접근 모두를 필요로 한다.2-(5-니트로퀴놀린-8-일) 티오) 잠재적 납 화합물은 오른쪽에 표시되어 있다.이중 및 단일 가닥 RNA에 대한 GSL3의 루프 구조에 대해서는 선택적이다.이는 HIV가 표적으로 삼은 세포에서 방출될 경우 스템루프를 차단하여 [7]NCp7과의 생산적인 상호작용을 제한한다는 것을 의미한다.

레퍼런스

  1. ^ Amarasinghe GK, De Guzman RN, Turner RB, Chancellor KJ, Wu ZR, Summers MF (2000). "NMR structure of the HIV-1 nucleocapsid protein bound to stem-loop SL2 of the psi-RNA packaging signal. Implications for genome recognition". J. Mol. Biol. 301 (2): 491–511. doi:10.1006/jmbi.2000.3979. PMID 10926523.
  2. ^ Darlix, JL; Lapadat-Tapolsky, M; de Rocquigny, H; Roques, BP (Dec 8, 1995). "First glimpses at structure-function relationships of the nucleocapsid protein of retroviruses". Journal of Molecular Biology. 254 (4): 523–537. doi:10.1006/jmbi.1995.0635. PMID 7500330.
  3. ^ Dietz J, Koch J, Kaur A, Raja C, Stein S, Grez M, Pustowka A, Mensch S, Ferner J, Möller L, Bannert N, Tampé R, Divita G, Mély Y, Schwalbe H, Dietrich U (2008). "Inhibition of HIV-1 by a peptide ligand of the genomic RNA packaging signal Psi". ChemMedChem. 3 (5): 749–755. doi:10.1002/cmdc.200700194. PMID 18205165.
  4. ^ Damgaard, CK; Andersen, ES; Knudsen, B; Gorodkin, J; Kjems, J (Feb 13, 2004). "RNA interactions in the 5' region of the HIV-1 genome". Journal of Molecular Biology. 336 (2): 369–379. doi:10.1016/j.jmb.2003.12.010. PMID 14757051.
  5. ^ Advances in Hiv-1 Assembly and Release. Springer Verlag. ISBN 978-1-4614-7728-0.
  6. ^ Morellet N, Jullian N, De Rocquigny H, Maigret B, Darlix JL, Roques BP (1992). "Determination of the structure of the nucleocapsid protein NCp7 from the human immunodeficiency virus type 1 by 1H NMR". EMBO J. 11 (8): 3059–3065. PMC 556789. PMID 1639074.
  7. ^ a b c Warui, DM; Baranger, AM (May 10, 2012). "Identification of small molecule inhibitors of the HIV-1 nucleocapsid-stem-loop 3 RNA complex". Journal of Medicinal Chemistry. 55 (9): 4132–4141. doi:10.1021/jm2007694. PMID 22480197.