게놈 참조 컨소시엄

Genome Reference Consortium

게놈레퍼런스 컨소시엄(GRC)은 게놈 지도 작성, 염기서열 분석, 정보학 등에 관한 전문지식을 갖춘 학·연구기관들의 국제 집합체로서, 레퍼런스 게놈의 대표성을 향상시키기 위해 결성되었다. 인간 참조가 처음 설명될 당시, 일부 지역은 알려진 순서대로 "갑"을 남기면서 기존 기술로 분석에 완강히 반대한다는 것이 분명했다. 참조집합을 개선하는 주된 이유는 모든 게놈 연구의 기초가 되는 기초석이기 때문이다(예: 1000 게놈 프로젝트).

GRC는 과학계의 다양한 그룹과 상호작용하는 협력적 노력이지만,[1] 주요 회원 기관은 다음과 같다.

초기에는 인간과 쥐의 참조 게놈에 초점을 맞추었지만, 2010년 중반에는 제브라피쉬 게놈 서열의 완전한 유지와 개선도 GRC에 추가되었다.[2] 컨소시엄의 목표는 현재 잘못 표기된 참조의 적은 수의 지역을 수정하여 가능한 한 많은 잔여 간격을 좁히고 필요한 경우 구조적으로 변형된 로키의 대체 어셈블리를 생산하는 것이다.

2019년 9월 현재 인간·마우스·제브라피쉬·치킨의 주요 조립품 출시는 각각 GRCh38, GRCm38, GRCz11, GRCg6a이다. 주요 조립품 릴리스는 고정된 주기를 따르지 않지만, [3]게놈 패치 형태의 조립품 업데이트는 조립품의 오류를 수정하거나 대체 로키를 추가한다. 이 어셈블리는 엔상블, NCBI, UCSC 게놈 브라우저를 포함한 다양한 게놈 브라우저 및 데이터베이스에 표시된다.

저명인사

외부 링크

Institute 홈 페이지

참조

  1. ^ "GRC and Collaborators". Genome Reference Consortium. Retrieved 19 October 2012.
  2. ^ "Zebrafish genome joins GRC". GRC Blog (GenomeRef). Retrieved 19 October 2012.
  3. ^ Church, DM; Schneider, VA; Graves, T; Auger, K; Cunningham, F; Bouk, N; Chen, HC; Agarwala, R; McLaren, WM; Ritchie, GR; Albracht, D; Kremitzki, M; Rock, S; Kotkiewicz, H; Kremitzki, C; Wollam, A; Trani, L; Fulton, L; Fulton, R; Matthews, L; Whitehead, S; Chow, W; Torrance, J; Dunn, M; Harden, G; Threadgold, G; Wood, J; Collins, J; Heath, P; Griffiths, G; Pelan, S; Grafham, D; Eichler, EE; Weinstock, G; Mardis, ER; Wilson, RK; Howe, K; Flicek, P; Hubbard, T (July 2011). "Modernizing reference genome assemblies". PLoS Biology. 9 (7): e1001091. doi:10.1371/journal.pbio.1001091. PMC 3130012. PMID 21750661.
  4. ^ "NLM In Focus: Meet NCBI's Deanna Church, Genome Finisher". Infocus.nlm.nih.gov. Archived from the original on 3 July 2013. Retrieved 6 December 2014.