유전자 트랩
Gene trapping유전자 트래핑은 유기체의 게놈에 삽입적 돌연변이를 도입하기 위해 사용되는 고투과 접근법이다.
방법
트랩은 업스트림 3의 스플라이스 부위(스플라이스 수용기; SA) 및 다운스트림 전사종료 순서(폴리애데닐화 순서; polyadenylation sequence; polyA)와 나란히 프로모터 없는 리포터 유전자 및/또는 선택 가능한 유전자 표식기로 구성된 유전자 트랩 벡터로 수행된다.
표현된 유전자의 인트론에 삽입되었을 때, 유전자 트랩 카세트는 삽입 지점의 업스트림 엑손(들)이 프레임으로 분할된 융접 성적서의 형태로 해당 유전자의 내생적 촉진자로부터 리포터/선택 가능한 마커 유전자로 옮겨진다. 삽입된 polyadenylation 사이트에서 전사가 조기에 종료되기 때문에 처리된 융접 대본은 잘리고 기능하지 않는 세포 단백질 버전과 리포터/선택 가능한 마커를 암호화한다. 따라서 유전자 트랩은 삽입 현장에서 갇힌 유전자의 발현을 동시에 불활성화하여 보고하고, 분열된 유전자의 신속한 식별을 위한 DNA 태그(gene trap 시퀀스 태그, GTST)를 제공한다.[1][2]
접근
국제진트랩 컨소시엄은 데이터를 중앙집중화하고 있으며 수정된 셀 라인을 공급하고 있다.[3]
참조
- ^ Cobellis, G; Nicolaus, G; et al. (2005). "Tagging genes with cassette-exchange sites". Nucleic Acids Res. 33 (4): e44. doi:10.1093/nar/gni045. PMC 552971. PMID 15741177.
- ^ De-Zolt, S; Schnutgen, F; et al. (2006). "High-throughput trapping of secretory pathway genes in mouse embryonic stem cells". Nucleic Acids Res. 34 (3): 25. doi:10.1093/nar/gnj026. PMC 1369290. PMID 16478711.
- ^ "IGTC, International Gene Trap Consortium". www.genetrap.org. Retrieved 2018-02-11.
추가 읽기
- Gossler A, Joyner AL, Rossant J, Skarnes WC (April 1989). "Mouse embryonic stem cells and reporter constructs to detect developmentally regulated genes". Science. 244 (4903): 463–5. doi:10.1126/science.2497519. PMID 2497519.
- von Melchner H, Ruley HE (August 1989). "Identification of cellular promoters by using a retrovirus promoter trap". Journal of Virology. 63 (8): 3227–33. doi:10.1128/JVI.63.8.3227-3233.1989. PMC 250892. PMID 2545900.
- Friedrich G, Soriano P (September 1991). "Promoter traps in embryonic stem cells: a genetic screen to identify and mutate developmental genes in mice". Genes & Development. 5 (9): 1513–23. doi:10.1101/gad.5.9.1513. PMID 1653172.
- Zambrowicz BP, Friedrich GA, Buxton EC, Lilleberg SL, Person C, Sands AT (April 1998). "Disruption and sequence identification of 2,000 genes in mouse embryonic stem cells". Nature. 392 (6676): 608–11. doi:10.1038/33423. PMID 9560157. S2CID 4329895.
- Wiles MV, Vauti F, Otte J, Füchtbauer EM, Ruiz P, Füchtbauer A, Arnold HH, Lehrach H, Metz T, von Melchner H, Wurst W (January 2000). "Establishment of a gene-trap sequence tag library to generate mutant mice from embryonic stem cells". Nature Genetics. 24 (1): 13–4. doi:10.1038/71622. PMID 10615117. S2CID 29505338.
- Stanford WL, Cohn JB, Cordes SP (October 2001). "Gene-trap mutagenesis: past, present and beyond". Nature Reviews Genetics. 2 (10): 756–68. doi:10.1038/35093548. PMID 11584292. S2CID 11468334.
- Skarnes WC, von Melchner H, Wurst W, Hicks G, Nord AS, Cox T, Young SG, Ruiz P, Soriano P, Tessier-Lavigne M, Conklin BR, Stanford WL, Rossant J (June 2004). "A public gene trap resource for mouse functional genomics". Nature Genetics. 36 (6): 543–4. doi:10.1038/ng0604-543. PMC 2716026. PMID 15167922.
- Hansen J, Floss T, Van Sloun P, Füchtbauer EM, Vauti F, Arnold HH, Schnütgen F, Wurst W, von Melchner H, Ruiz P (August 2003). "A large-scale, gene-driven mutagenesis approach for the functional analysis of the mouse genome". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 100 (17): 9918–22. doi:10.1073/pnas.1633296100. PMC 187885. PMID 12904583.
- Zambrowicz BP, Abuin A, Ramirez-Solis R, Richter LJ, Piggott J, BeltrandelRio H, et al. (November 2003). "Wnk1 kinase deficiency lowers blood pressure in mice: a gene-trap screen to identify potential targets for therapeutic intervention". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 100 (24): 14109–14. doi:10.1073/pnas.2336103100. PMC 283554. PMID 14610273.
- Schnütgen F, De-Zolt S, Van Sloun P, Hollatz M, Floss T, Hansen J, Altschmied J, Seisenberger C, Ghyselinck NB, Ruiz P, Chambon P, Wurst W, von Melchner H (May 2005). "Genomewide production of multipurpose alleles for the functional analysis of the mouse genome". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102 (20): 7221–6. doi:10.1073/pnas.0502273102. PMC 1129123. PMID 15870191.
- Springer PS (July 2000). "Gene traps: tools for plant development and genomics". The Plant Cell. 12 (7): 1007–20. doi:10.2307/3871251. JSTOR 3871251. PMC 149045. PMID 10899970.
외부 링크
 | 스콜리아는 진 트래핑(Q5531570)에 대한 프로필을 가지고 있다. |
