Gene RIF

GeneRIF

GeneRIF 또는 Gen Reference Into Function은 유전자의 기능에 대한 짧은 설명(255자 이하)입니다.GeneRIF는 과학자들이 Entrez Gene 데이터베이스에 기술된 유전자의 기능적 주석을 추가할 수 있는 간단한 메커니즘을 제공합니다.실제로 기능은 상당히 광범위하게 구성되어 있습니다.예를 들어, 질병에서 유전자의 역할을 논하는 GeneRIF, 유전자에 대한 리뷰 기사를 보는 사람을 가리키는 GeneRIF, 유전자의 구조를 논하는 GeneRIF가 있다.단, GeneRIFs는 유전자 기능에 관한 것이다.현재 50만개 이상의 유전자가RIFs는 거의 1000종의 [1]유전자를 위해 만들어졌다.

GeneRIF는 항상 Entrez Gene 데이터베이스의 특정 항목과 관련되어 있습니다.각 GeneRIF는 GeneRIF가 작성한 진술에 대한 증거를 제공하는 과학 출판물의 PubMed ID(문서 식별자의 일종)에 대한 포인터를 가지고 있다.GeneRIF는 종종 PubMed ID에 의해 식별되는 문서에서 직접 추출되며 제목 또는 최종 문장에서 매우 자주 추출된다.

GeneRIF는 보통 NCBI 인덱서에 의해 생산되지만 누구나 GeneRIF를 제출할 수 있습니다.처리하려면 특정 유전자에 대해 유효한 유전자 ID가 존재해야 하며, 그렇지 않으면 Gene 직원이 해당 종에 전체 유전자 ID를 할당해야 합니다.후자의 경우는 NEWENTRY 기호가 있는 Gene의 기록을 통해 구현된다.유전자 ID가 확인되면 제출을 완료하기 위해 필요한 정보는 다음 3종류뿐입니다.

  1. 기능 또는 기능을 설명하는 간결한 문구(길이가 255자 미만, 가급적 논문 제목 재작성 이상)
  2. PubMed에서 인용문의 PubMed ID를 제공함으로써 구현된 기능을 설명하는 발행된 논문
  3. 유효한 전자 메일 주소(기밀로 유지됩니다).

예

여기 Entrez Gene에서 추출한 GeneRIFs가 있습니다.ID 7157, 인간 유전자 TP53.PubMed 문서 식별자가 예제에서 누락되었습니다.구두점 유무와 문장 선두 대문자 유무에 관한 광범위한 변동성에 유의하십시오.

  • p53과 c-erbB-2는 담낭암의 발암에 독립적인 역할을 할 수 있다
  • 내인성 HIPK2의 분해는 기능성 p53 단백질의 존재에 따라 달라집니다.
  • p53 코돈72 대립 유전자는 세포 주기 억제제 p21을 조절함으로써 노인의 세포에서 항암제에 대한 반응에 영향을 미친다.WAF1
  • 로지스틱 회귀 분석에서는 p53과 COX-2가 췌장 발암의 의존적 예측요인으로 나타났으며, p53과 COX-2 사이의 신생물 진행과 상호 관계가 나타났다.

GeneRIFs는 텍스트 장르의 특이한 유형으로 최근 자연어 처리 커뮤니티의 많은 기사의 주제가 되고 있다.

외부 링크

  • GeneRIFS를 설명하는 NCBI의 웹 페이지
  • Mitchell JA, Aronson AR, Mork JG, Folk LC, Humphrey SM, Ward JM (2003). "Gene indexing: characterization and analysis of NLM's GeneRIFs". AMIA Annu Symp Proc: 460–4. PMC 1480312. PMID 14728215.

레퍼런스

  1. ^ "GeneRIF Stats - Gene - NCBI".