CspA mRNA 5′ UTR

CspA mRNA 5′ UTR
cspA 5' UTR
cspA RNA의 5' UTR의 보존된 2차 구조
식별자
기호.cspA 5'UTR
RfamRF01766
기타자료
RNA형Cis-reg; 온도 조절기;
도메인장내세균
PDB 구조물PDBe

cspA mRNA 5' UTR은 cspA 유전자의 비번역 영역으로, 대장균과 같은 장내세균에서 저온 충격 반응에 중요합니다. 5' UTR 요소는 온도에 따라 cspA의 발현을 조절하는 RNA 온도계 역할을 합니다.[1] cspA 단백질은 온도를 조절함으로써 항상성의 중요한 기능을 수행합니다.

5' UTR은 cspA의 이 영역 내의 돌연변이가 37°C에서 전사체의 안정성을 상당히 증가시켰을 때 처음에 중요한 것으로 의심되었습니다.[2]

cspA mRNA의 2차 구조는 온도에 따라 변하며, 37°C에서는 낮은 온도보다 전사체가 불안정하고 덜 효율적으로 번역됩니다.[3] 다른 RNA 온도계(예: FourU)와 달리, 2차 구조는 유전자 발현에 영향을 미치기 위해 헤어핀이 녹는 것에 의존하지 않습니다. 대신 20°C 미만의 온도에서 cspA의 5' UTR에 있는 ncRNA의 시스 조절 영역은 Shine-Dalgarno 서열과 AUG 시작 코돈을 더 접근 가능한 방식으로 리보솜에 제공합니다. mRNA 형태를 변화시키는 정확한 메커니즘은 아직 알려져 있지 않습니다.[1] 그리고 cspA 단백질은 상당히 많은 양으로 생성되어 콜드쇼크 시 세포의 단백체의 2% 이상을 차지합니다.[4] cspA 단백질은 스트레스 반응을 매개하는 시그마 인자의 생성을 조절하는 Hfq와 결합합니다.[5]

참고 항목

참고문헌

  1. ^ a b Giuliodori AM, Di Pietro F, Marzi S, et al. (January 2010). "The cspA mRNA is a thermosensor that modulates translation of the cold-shock protein CspA". Mol. Cell. 37 (1): 21–33. doi:10.1016/j.molcel.2009.11.033. PMID 20129052.
  2. ^ Yamanaka K, Mitta M, Inouye M (October 1999). "Mutation analysis of the 5' untranslated region of the cold shock cspA mRNA of Escherichia coli". J. Bacteriol. 181 (20): 6284–6291. doi:10.1128/JB.181.20.6284-6291.1999. PMC 103761. PMID 10515916.
  3. ^ Breaker RR (January 2010). "RNA switches out in the cold". Mol. Cell. 37 (1): 1–2. doi:10.1016/j.molcel.2009.12.032. PMC 5315359. PMID 20129048.
  4. ^ Brandi A, Spurio R, Gualerzi CO, Pon CL (March 1999). "Massive presence of the Escherichia coli 'major cold-shock protein' CspA under non-stress conditions". EMBO J. 18 (6): 1653–1659. doi:10.1093/emboj/18.6.1653. PMC 1171252. PMID 10075935.
  5. ^ Hankins JS, Denroche H, Mackie GA (May 2010). "Interactions of the RNA-binding protein Hfq with cspA mRNA, encoding the major cold shock protein". J. Bacteriol. 192 (10): 2482–2490. doi:10.1128/JB.01619-09. PMC 2863566. PMID 20233932.

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외부 링크