10대 돌연변이 닌자 거북(2003년 TV 시리즈, 시즌 3)

지구는 트리케라톤족이 기습 침공을 감행할 때 공격을 받게 된다.투과 장치로부터의 에너지 흔적을 따라 잔라몬 총리는 허니컷 교수가 지구에 거주하고 있다고 확신하고 그의 병력을 보내 푸지토이드와 접촉한 것으로 생각되는 모든 사람들을 체포한다.거북이들은 포획을 피하기 위해 최선을 다하지만, 두 사람이 포로로 잡혀 센트럴 파크에 잡혀 있을 때 에이프릴과 케이시를 구하러 온다.거북이들은 가까스로 포로를 풀어주고 에이프릴과 케이시를 구하는데 성공하지만 도나텔로는 트리케라톤에게 붙잡힌다.

도나텔로는 잡혀 트리케라톤 모선으로 끌려간다.잔라몬 총리는 도나텔로에게 푸지토이드의 행방에 대해 질문하지만, 돈 의원은 푸지토이드가 더 이상 지구에 존재하지 않는다고 주장한다.트리케라톤 지도자는 베이징시를 성층권으로 공중 부양하면서 지구에 대혼란을 일으키고 있으며, 트리케라톤을 공격하라는 부름을 받은 후에 정의군을 물리치고 있다.한편 도나텔로의 형제는 가까스로 트리케라톤 배를 훔쳐 트리케라톤 모선에 잠입하지만 곧 모선 하수구에 있는 트리케라톤 생도에게 둘러싸인 자신을 발견하게 된다.

거북이를 둘러싼 트리케라톤은 트랙시무스가 이끄는 반항적인 트리케라톤으로 밝혀져 레오나르도, 라파엘, 미켈란젤로가 이들과 동맹을 맺는다.반군 지도자는 잔라몬 총리를 타도하고 트리케라톤 공화국의 대표 정부를 재탄생시키기를 원한다.반군 단체와 함께, 거북이들은 그들의 형제인 도나텔로를 확보하려고 하고, 수상의 지구 공격을 방해한다.반군의 도움으로 거북이들은 도나텔로를 구출하고 지구로 탈출한다.트리케라톤은 양성자를 스캔하여 아무것도 찾지 못하여 푸지토이드가 지구에 없다는 것을 깨닫지만, 푸지토이드가 지구를 떠났을 때의 순간이동 흔적을 발견하게 된다. 그래서 트리케라톤은 그 행성을 위한 새로운 항로를 계획한다.그러나 이 에피소드의 마지막에 푸지토이드는 지구로 돌아온다.

푸지토이드가 실제로 지구를 떠났다고 트리케라톤족에게 설득했음에도 불구하고, 거북이들은 푸지토이드가 돌아왔다는 것을 알고 실망하고 있다.하드 드라이브에서 텔레포탈에 관한 어떤 정보도 지운 그는 트리케라톤에 몸을 바쳐 디후니브 공화국과의 전쟁을 종식시키려 한다.하지만 거북이들은 그들의 친구가 잡히는 것을 허락하지 않는다.

거북이와 허니컷 교수는 수수께끼의 요원 비숍에게 잡힌다.푸기토이드를 드후니브의 블랑크 장군에게 넘겨준 비숍은 거북이들에 대한 의학 실험을 하고, 거북이들은 죽음을 맞이할 것이라고 위협한다.

스플린터, 에이프릴, 케이시는 비숍 요원의 손아귀에서 거북이와 가죽 머리를 구출하고 모두 푸지토이드를 찾기 위해 출발했다.한편, 트래시무스와 그의 반란군은 트리케라톤 프라임 리더를 공격하고, 푸기토이드는 트리케라톤과 드후니브 연방의 전쟁을 끝내기 위해 고군분투한다.

라파엘은 은신처를 찾고 외계인을 찾는 분노한 폭도들이 뉴욕시 골목길을 통해 자신을 뒤쫓을 때 공감의 교훈을 얻는다.한편 스플린터 사부와 미켈란젤로는 초인적인 힘과 초인적인 스피드 능력을 가진 두 명의 고용된 암살자와 싸워야 한다.

큰 사냥꾼은 하수구에 살고 있다는 소문난 거대한 악어를 찾아다닌다.그는 거북이들의 은신처에서 살아온 정서적으로 불안정한 레더헤드와 마주친다.

폭력적이고, 외계인을 혐오하는 몇몇 생존자들에 의해 그들의 평화가 깨질 때 그 갱단은 시골에서 휴식을 취하고 있다.라파엘과 도나텔로는 그들을 제지하려 하고, 원자폭탄을 다루려 하고, 에이프릴과 케이시의 관계는 케이시의 과잉보호 어머니의 도착으로 위험에 처하게 된다.악당: H.A.T.E. 10대 돌연변이 닌자 거북이를 바탕으로 #12 "생존주의자"

• 'H.A.T.E'라는 문구는 '외계인들에 대항하는 인간들'을 의미하는데, 이 문구는 실제로 2003년 컬렉션에서 새로운 이름을 가진 'C.R.A.P.'의 한 버전이다.

레오나르도와 미켈란젤로는 캡슐화된 십자군 Nobody를 만나서 그를 도우려고 노력한다...어쨌든 마이키는 해냈어.악당:러핑턴, 발

에이프릴은 거북이들에게 무술을 가르쳐 달라고 부탁하고, 거북이들은 충분한 전문지식 없이 그녀를 훈련시킴으로써 득보다 실이 많을 수 있다는 것을 알고 거절한다.그들은 지난 번에 거북이들이 훨씬 더 어렸을 때 10대 이전 소년을 훈련시키려 했던 것에 대해 그녀에게 말한다.

혼자만의 모험에서, 마이키는 크리스마스에 고아원에 배달될 장난감을 가득 실은 트럭을 훔치려는 시도에서 퍼플 드래곤스를 좌절시키려고 한다.그는 또한 길잃은 새끼고양이를 우연히 만나게 되는데, 새끼고양이는 새끼고양이를 날개 밑으로 데리고 가서 이름을 클렁크라고 부른다.은신처에서, 스플린터와 다른 거북이들은 거대한 잔치를 계획하고 친구들을 모두 초대한다.

• 악당:퍼플 드래곤즈
• #1 "크리스마스 에이리언"을 원작으로 한 미켈란젤로.

거북이들은 외계인 침공 후 허드슨 강에 남겨진 추락한 트리케라톤 배를 탐험한다.여기서 그들은 백스터 스톡맨의 지나치게 열성적인 젊은 견습생 채플린 박사에 의해 고안된 매우 위험한 로봇 3대를 만나게 된다.

엔젤은 거북이들에게 옛 저택 아래 터널을 둘러본 후 실종된 오빠를 찾는 것을 도와달라고 부탁한다.거북이들은 모험을 하고 수백 년 된 불온한 괴물을 만나게 되는데, 이 괴물은 거북이들을 붙잡아 각각의 거북이들이 자신의 가장 큰 두려움에 맞서도록 강요한다.

거북이들은 죽은 줄 알았던 옛 친구를 만나게 되어 무척 기뻐하며, 모두 떠다니는 도시 베이징을 지구 표면으로 다시 낮추기 위해 나섰다.카라이는 입양된 아버지의 뜻을 거스르며, 수백만 명의 무고한 사람들이 죽는 것을 원치 않는 거북이들의 도움을 받고자 하는 반면, 기술력이 강탈당할 위험이 있는 백스터 스톡맨은 박사를 제거하려고 애쓴다.훈의 도움으로 채플린은 풋에서 자신의 지위를 빼앗은 카라이를 없애겠다는 결심을 굳히고 있다.

미켈란젤로의 유감스럽게도, 거북이들은 거대한 지진이 세계를 뒤흔드는 동시에 도나텔로의 결정이 빛을 발하기 시작한 후 지하 도시로 다시 내려가 조사해야 한다.그러나 그들 중 어느 누구도 지구의 역사에 대해 배우려고 하는 것에 대해 준비하지 않는다.

거북이들은 악마의 마법사인 사반티 로메로가 암흑시대로의 유배에서 벗어나려 할 때, 사악한 악마 마법사의 계획을 저지하기 위해, 견습생인 레네와 모험을 바라며 시간을 보내게 된다.

• 악당: 사반티 로메로, 얼티밋 드라코.
• 10대 돌연변이 닌자 거북이 #8에 근거한다.

슈레더가 미국 정부가 보유하고 있는 외계인 기술을 얻기 위해 보낸 카라이는 슈레더가 가지고 있는 모든 외계인 기술을 대가로 그녀를 돌려주겠다고 제안하는 비숍 요원에 의해 붙잡힌다.슈레더는 대신 망신을 당한 훈을 보내 훈이 경멸하는 소녀를 구하게 한다.도둑들 사이에 불명예가 충분하지 않다는 듯 스톡맨은 거북이들을 유인해 전투에도 참가시킨다.

Ultimate Dimyo의 아들과 드라코는 한 개체로 합병되어, 동시대의 타임 스셉터와 함께 거북이의 은신처에 도착한다.이 괴물은 복수를 위해 거북이와 스플린터를 현실의 다른 면에 걸쳐 분리한다.미켈란젤로는 10대 돌연변이 닌자 거북이들이 놀라운 능력을 가진 슈퍼히어로들이 있는 세상인, 꿈이 실현되기 위해 다중우주를 가로지르는 자신을 발견한다.그러나 그가 슈퍼터틀즈의 적군이 누구인지 알게 되면 그의 기쁨은 갑자기 끝난다.악당:얼티밋 드라코, 슬리버

라파엘은 다른 외계 종들이 높은 곳에서 열리는 대회에서 거대한 오토바이를 경주하는 행성에 던져진다.라프는 그의 동료들에게 명예롭게 경주하는 법을 가르치려고 한다.이 크로스오버 에피소드는 피터 레어드와 짐 로슨의 실제 만화 시리즈인 "Planet Racers"에 바탕을 두고 있다.

도나텔로는 시간이 지남에 따라 음울하고 디스토피아적인 미래로 내동댕이쳐지고, 슈레더는 전체주의적인 통제를 행사한다.돈 씨는 자신이 30년 동안 죽었다고 믿는 감정적으로 굳어진 가족과 친구들을 찾아 슈레더의 본부에 대한 최후의 공격을 계획해야 한다.

레오나르도는 자신의 오랜 친구인 우사기를 포함한 의인화된 사무라이 동물들을 만나는 차원처럼 현실의 모든 측면을 가로질러 봉건적인 일본으로 보내진 자신을 발견한다.이 크로스오버 에피소드는 사카이 스탄의 실제 만화 시리즈인 '우사기 요짐보'를 원작으로 한 것이다.

레오나르도는 가족을 찾기를 바라며 우사기와 함께 다임요의 도움을 받기 위해 배틀 넥서스로 이동하지만, 결국 말하기는 훨씬 쉬운 것으로 드러났다.

비숍 요원은 스플린터 마스터를 잡아서 돌연변이 쥐의 DNA를 추출해낸다.거북이, 허니컷 교수, 그리고 가죽헤드는 비숍의 실험실을 침입하여 세계의 "안전"을 위한 비숍의 계획이 얼마나 무서운지를 발견한다.

슈레더는 지구를 떠날 준비를 하고 정복과 대량 살인에 대한 그의 계획을 다른 행성에 퍼뜨린다.뉴욕시의 시민들은 우트롬의 본국 트리케라톤 침공 이후 도시 보수를 위한 오로쿠 사키의 금전적 원조가 위태로워지는 것을 축하하면서, 거북이들과 동맹국들은 비숍 요원과 그의 라저 경비대와 함께 슈레더의 본부로 몰래 들어가 무슨 수를 써서라도 그가 지구를 떠나는 것을 막아야 한다고 결정한다.

슈레더의 손에 대패한 뒤 슈레더의 우주선에 탑승한 거북이와 스플린터는 적군을 저지하기 위해 어려운 결정을 내려야 한다.