Yfr1

Yfr1
시아노박테리아 기능성 RNA 1
Yfr1 secondary structure.jpg
Yfr1의 예측된 2차 구조 및 배열 보존
식별자
기호.Yfr1
레네.RF01116
기타 데이터
RNA형; sRNA
도메인박테리아
그렇게순서:0001263
PDB 구조PDBe

Yfr1시아노박테리아 [1]내 RNA에 대한 게놈 기반 비교 검사로 확인된 시아노박테리아 기능성 RNA다.추가 분석에 따르면 RNA는 잘 보존되고 시아노박테리아에서 [2]고도로 발현된다.그리고 여러 스트레스[3] 조건 하에서 성장에 필요하다 후속 실험과 결합된 생물 정보학 연구는 Yfr1이 리보솜 결합 [4]부위에서 염기쌍에 의한 안티센스 상호작용에 의해 단백질 PMM1119와 PMM1121의 번역을 억제한다는 것을 보여주었다.

「 」를 참조해 주세요.

참조

  1. ^ Axmann IM, Kensche P, Vogel J, Kohl S, Herzel H, Hess WR (2005). "Identification of cyanobacterial non-coding RNAs by comparative genome analysis". Genome Biol. 6 (9): R73. doi:10.1186/gb-2005-6-9-r73. PMC 1242208. PMID 16168080.
  2. ^ Voss B, Gierga G, Axmann IM, Hess WR (2007). "A motif-based search in bacterial genomes identifies the ortholog of the small RNA Yfr1 in all lineages of cyanobacteria". BMC Genomics. 8: 375. doi:10.1186/1471-2164-8-375. PMC 2190773. PMID 17941988.
  3. ^ Nakamura T, Naito K, Yokota N, Sugita C, Sugita M (2007). "A cyanobacterial non-coding RNA, Yfr1, is required for growth under multiple stress conditions". Plant Cell Physiol. 48 (9): 1309–1318. doi:10.1093/pcp/pcm098. PMID 17664182.
  4. ^ Richter AS, Schleberger C, Backofen R, Steglich C (2010). "Seed-based INTARNA prediction combined with GFP-reporter system identifies mRNA targets of the small RNA Yfr1". Bioinformatics. 26 (1): 1–5. doi:10.1093/bioinformatics/btp609. PMC 2796815. PMID 19850757.

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