트랜스포자아제-2 RNA 모티브
Transposase-2 RNA motif |
| 트랜스포자아제-2 | |
|---|---|
 | |
| 식별자 | |
| 기호. | 트랜스포자아제-2 |
| Rfam | RF03015 |
| 기타 데이터 | |
| RNA형 | 진; sRNA |
| 그렇게 | 순서:0001263 |
| PDB 구조 | PDBe |
트랜스포사제-2 RNA 모티브는 생물정보학에서 [1]발견한 보존된 RNA 구조이다.
이 RNA들은 보통 트랜스포존의 주요 성분인 트랜스포지아제를 코드하는 유전자 근처에 위치해 있습니다.많은 종류의 트랜스포존이 역반복에 인접해 발견되는데, 이는 단순한 RNA 2차 구조로 오인될 수 있다.따라서 트랜스포자아제-2 RNA는 트랜스포자 복제의 부작용을 반영할 수 있으며 별도의 RNA를 부호화하지 않는다.그러나 RNA 배열의 일관성(예를 들어, 모든 RNA는 자르지 않고 완전한 2차 구조를 가진다)은 트랜스포존 관련 반복의 전형적이지 않다.트랜스포자아제-2 RNA가 RNA로서 기능한다고 가정하면, 그들은 트랜스포자아제 유전자를 조절하는 시스 조절 요소로서 기능할 수도 있고, 다른 방법으로 트랜스포자아제의 생물학에 참여하는 작은 RNA로서 트랜스포자 내에서 작동할 수도 있다.
트랜스포자아제-2 모티브 RNA는 두 가지 다른 세균 필라에서 발견됩니다.방선균과 바실로타.비록 두 개의 엽서에 그들의 존재가 그들이 매우 분산되어 있고 매우 오래된 기원을 가지고 있다는 것을 암시할 수 있지만, 트랜스포존과의 연관성에 비추어 볼 때, 이러한 RNA의 광범위한 분포는 비교적 최근의 수평 유전자 이동의 결과일 가능성이 높다.
레퍼런스
- ^ Weinberg Z, Lünse CE, Corbino KA, Ames TD, Nelson JW, Roth A, Perkins KR, Sherlock ME, Breaker RR (October 2017). "Detection of 224 candidate structured RNAs by comparative analysis of specific subsets of intergenic regions". Nucleic Acids Res. 45 (18): 10811–10823. doi:10.1093/nar/gkx699. PMC 5737381. PMID 28977401.
