트랜스액션 응답 요소(TAR)
Trans-activation response element (TAR)| 트랜스액션 응답 요소(TAR) | |
|---|---|
 | |
| 식별자 | |
| 기호 | 미르-TAR |
| Alt. 기호 | 타르 |
| Rfam | RF00250 |
| 기타자료 | |
| RNA형 | 진; miRNA |
| 도메인 | 바이러스 |
| 바둑 | GO:0035068 GO:0035195 |
| 그렇게 | SO:0000233 SO:0001244 |
| PDB 구조 | PDBe |
HIV 트랜스액션 응답(TAR) 요소는 바이러스 촉진자의 트랜스액션과 바이러스 복제에 필요한 것으로 알려진 RNA 원소다. TAR 헤어핀은 타트 단백질의 결합 부위의 역할을 하는 역동적인 구조로[1], 이러한 상호작용은 롱 터미널 반복 프로모터의 활동을 자극한다.[2]
추가 분석 결과 TAR은 TAR 스템루프 양쪽 가닥에서 성숙한 마이크로RNA를 생산하는 사전 마이크로RNA인 것으로 나타났다.[3] 이러한 miRNA는 유전자 ERCC1, IER3,[4] CDK9, Bim을 하향 조절하여 감염된 세포가 사멸하는 것을 막는다고 생각된다.[5]
참조
- ^ Lu, Jia; Kadakkuzha, Beena M.; Zhao, Liang; et al. (2011). "Dynamic Ensemble View of the Conformational Landscape of HIV-1 TAR RNA and Allosteric Recognition". Biochemistry. 50 (22): 5042–5057. doi:10.1021/bi200495d. PMID 21553929.
- ^ Kulinski, T; Olejniczak M; Huthoff H; Bielecki L; Pachulska-Wieczorek K; Das AT; Berkhout B; Adamiak RW (2003). "The apical loop of the HIV-1 TAR RNA hairpin is stabilized by a cross-loop base pair". J Biol Chem. 278 (40): 38892–38901. doi:10.1074/jbc.M301939200. PMID 12882959.
- ^ Ouellet DL, Plante I, Landry P, et al. (April 2008). "Identification of functional microRNAs released through asymmetrical processing of HIV-1 TAR element". Nucleic Acids Res. 36 (7): 2353–2365. doi:10.1093/nar/gkn076. PMC 2367715. PMID 18299284.
- ^ Klase Z, Winograd R, Davis J, et al. (2009). "HIV-1 TAR miRNA protects against apoptosis by altering cellular gene expression". Retrovirology. 6: 18. doi:10.1186/1742-4690-6-18. PMC 2654423. PMID 19220914.
- ^ Narayanan, A; Iordanskiy, S; Das, R; Van Duyne, R; Santos, S; Jaworski, E; Guendel, I; Sampey, G; Dalby, E; Iglesias-Ussel, M; Popratiloff, A; Hakami, R; Kehn-Hall, K; Young, M; Subra, C; Gilbert, C; Bailey, C; Romerio, F; Kashanchi, F (5 July 2013). "Exosomes derived from HIV-1-infected cells contain trans-activation response element RNA". The Journal of Biological Chemistry. 288 (27): 20014–20033. doi:10.1074/jbc.m112.438895. PMC 3707700. PMID 23661700.
