스타인 에어츠

Stein Aerts
스타인 에어츠
Stein-aerts.jpg
국적.벨기에어
모교루벤 대학교
로 알려져 있다유전자조절 및 계산생물학 연구
제목교수님

Stein Aerts는 벨기에의 바이오 엔지니어이자 컴퓨터 생물학자입니다.그는 VIB 및 KU Leuven(University of Leuven)에서[1] 컴퓨터 생물학 연구소를 이끌고 있으며 게놈 규제 [2]코드의 작동에 대한 연구로 여러 상을 받았습니다.

초기 생활과 교육

Aerts는 벨기에 Heusden-Zolder에서 태어나고 자랐으며, Heilig-Hart [3]College에서 중등 교육을 수료했습니다.그는 Leuven 대학에서 생명공학(분자생물학) 석사 학위를 취득한 후 브뤼셀 대학에서 응용 컴퓨터 과학에 관한 고급 연구와 얀센 파마세티카의 IT 프로젝트 어시스턴트 리더로서의 업무를 겸임했습니다.그는 루벤 [4]대학 전기공학부 ESAT-SCD에서 근무하며 공학 박사(생물정보학)를 취득했습니다.

학력

Aerts는 프랑스 마르세유, 루미니 개발생물연구소(IBDML)를 방문해 데니스 티에리, 칼만과 함께 루벤에 있는 VIB의 바셈 하산 연구소에서 초파리 모델 드로소필라 멜라노가스터의 유전자 조절 유전체학 연구를 마쳤다.

2009년, Aerts는 Leuven 대학의 조교수로 임명되어 현재는 전임 교수로 재직하고 있으며, KU Leuven 인간 유전학부의 컴퓨터 생물학 연구소장을 맡고 있습니다.2016년부터 VIB 그룹의 리더로 임명되었습니다.Aerts는 생물정보학 입문, 생물정보학 입문 등 몇 가지 과정을 가르치고 있습니다. 구조 및 비교 유전체학, 생물정보학 및 시스템 생물학: 시퀀스, 구조, 진화, 생물정보학 및 시스템 생물학: 루벤 대학의 표현, 규제 및 네트워크.그의 연구는 단세포,[5] 기계학습 및 높은 처리량 실험 접근법을 조합하여 게놈 규제 코드를 해독하는 데 초점을 맞추고 있습니다.

조사.

조절 유전체학 및 유전자 조절 네트워크에 대한 연구 관심은 신경 발달, 신경 퇴화 및 [6][7]암의 맥락에서 적용되는 광범위한 실험 및 계산 접근방식을 포함한다.

박사학위 연구 기간 동안, 에츠는 유전체 강화제(ModuleSearcher)[8]의 예측을 위한 최초의 생체 정보학 알고리즘 중 하나를 발명했고, 시스 조절 배열 분석(TOUCAN)[9][10][11]과 유전자 우선순위 부여(Endavour)[12]를 위한 몇 가지 생체 정보학 도구를 개발했습니다.다른 과학적 기여는 단일 셀 유전자 규제 네트워크의 분석 및 CISTOPIx 실험 네트워크(13] 및 CISTOPIx 실험) 및 CIST)을 위한 새로운 바이오 프로그래밍 방법을 포함한다[17]).

Aerts는 Fly Cell Atlas 컨소시엄을[18] 공동 설립하고 노화된 Drosophila [19]뇌의 단세포 Atlas를 만들었다.2022년, 컨소시엄은 성체 [20][21]초파리의 단일핵 전사체 지도의 완성을 발표했는데, 그들은 이것이 연구 공동체를 위한 귀중한 자료이자 단세포 [22]분해능에서의 유전자 기능에 대한 연구의 참고 자료로 사용되기를 희망하고 있다.

세포와 조직 지도의 생성은 파리뿐만 아니라 세포형 분해능으로 전체 장기 수준에서 인간의 질병을 모델링하기 위한 생물학적 과정을 연구하는데 도움을 준다.또한 Aerts는 복잡한 질병의 시작과 진행 중에 인간 세포를 추적, 이해 및 목표로 하고 단세포 [23]분해능으로 치료에 대한 반응을 분석하는 것을 목표로 하는 LifeTime이라는 범유럽 연구 컨소시엄의 일부이다.

아웃리치

오픈 사이언스의 옹호자로서 Aerts는 그의 팀이 개발한 데이터와 방법을 오픈 저장소에 저장하거나 오픈 소스 소프트웨어 [24]및 데이터베이스로 자유롭게 사용할 수 있도록 합니다.

멘델크래프트는 에르트 연구소에서 개발한 마인크래프트 모드로, 다양한 종류의 가상 [25]닭을 교배하고 복제할 수 있게 함으로써 아이들에게 DNA, 유전학, 멘델의 법칙에 대해 가르치기 위해 고안된 비디오 게임이다.

어워드

레퍼런스

  1. ^ Aerts, lab. "Stein Aerts Lab - VIB - KULeuven". aertslab.org. Retrieved 2022-05-04.
  2. ^ Marx, Vivien (2019-05-01). "Stein Aerts". Nature Methods. 16 (5): 355. doi:10.1038/s41592-019-0397-8. ISSN 1548-7105. PMID 30971811. S2CID 106411505.
  3. ^ "Limburgse topwetenschapper Stein Aerts: "Eigenlijk is dit een onmogelijke job"". www.hbvl.be (in Flemish). Retrieved 2022-05-03.
  4. ^ "Stein Aerts Lab - VIB - KULeuven". aertslab.org. Retrieved 2022-05-03.
  5. ^ name, Your. "Stein Aerts Lab - VIB - KULeuven". aertslab.org. Retrieved 2022-05-03.
  6. ^ Leuven, K. U. "Computer program detects differences between human cells". phys.org. Retrieved 2022-05-03.
  7. ^ Sterling, John (2022-01-06). / "AI Used to Study Cell Diversity in the Brain of Drosophila melanogaster". GEN - Genetic Engineering and Biotechnology News. Retrieved 2022-05-03.
  8. ^ "ModuleSearcher". gbiomed.kuleuven.be. Retrieved 2022-05-04.
  9. ^ Aerts, Stein; Thijs, Gert; Coessens, Bert; Staes, Mik; Moreau, Yves; De Moor, Bart (2003-03-15). "Toucan: deciphering the cis-regulatory logic of coregulated genes". Nucleic Acids Research. 31 (6): 1753–1764. doi:10.1093/nar/gkg268. ISSN 1362-4962. PMC 152870. PMID 12626717.
  10. ^ Aerts, Stein; Van Loo, Peter; Thijs, Gert; Mayer, Herbert; de Martin, Rainer; Moreau, Yves; De Moor, Bart (2005-07-01). "TOUCAN 2: the all-inclusive open source workbench for regulatory sequence analysis". Nucleic Acids Research. 33 (Web Server issue): W393–396. doi:10.1093/nar/gki354. ISSN 1362-4962. PMC 1160115. PMID 15980497.
  11. ^ "TOUCAN - Regulatory Sequence Analysis - Gene Regulation Bioinformatics". toucan.aertslab.org. Retrieved 2022-05-04.
  12. ^ Aerts, Stein; Lambrechts, Diether; Maity, Sunit; Van Loo, Peter; Coessens, Bert; De Smet, Frederik; Tranchevent, Leon-Charles; De Moor, Bart; Marynen, Peter; Hassan, Bassem; Carmeliet, Peter (May 2006). "Gene prioritization through genomic data fusion". Nature Biotechnology. 24 (5): 537–544. doi:10.1038/nbt1203. ISSN 1087-0156. PMID 16680138. S2CID 2303897.
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  20. ^ Li, Hongjie; Janssens, Jasper; De Waegeneer, Maxime; Kolluru, Sai Saroja; Davie, Kristofer; Gardeux, Vincent; Saelens, Wouter; David, Fabrice P. A.; Brbić, Maria; Spanier, Katina; Leskovec, Jure (2022-03-04). "Fly Cell Atlas: A single-nucleus transcriptomic atlas of the adult fruit fly". Science. 375 (6584): eabk2432. doi:10.1126/science.abk2432. ISSN 1095-9203. PMC 8944923. PMID 35239393.
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  23. ^ Rajewsky, Nikolaus; Almouzni, Geneviève; Gorski, Stanislaw A.; Aerts, Stein; Amit, Ido; Bertero, Michela G.; Bock, Christoph; Bredenoord, Annelien L.; Cavalli, Giacomo; Chiocca, Susanna; Clevers, Hans (November 2020). "LifeTime and improving European healthcare through cell-based interceptive medicine". Nature. 587 (7834): 377–386. Bibcode:2020Natur.587..377R. doi:10.1038/s41586-020-2715-9. ISSN 1476-4687. PMC 7656507. PMID 32894860.
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  25. ^ "MendelCraft". mendelcraft.aertslab.org. Retrieved 2022-05-03.
  26. ^ ULB (25 January 2022). "Francqui Chair 2021 - "Decoding gene regulation in the single-cell era"".
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  28. ^ AstraZenecaFoundation. "Award winners - AZ Foundation & FWO/F.R.S.-FNRS". Retrieved 3 May 2022.