SecY단백질
SecY protein| SecY 단백질/Sec61α | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 단백질 전도 [1]채널의 구조. | |||||||||
| 식별자 | |||||||||
| 기호. | 세컨드Y | ||||||||
| 팜 | PF00344 | ||||||||
| 인터프로 | IPR002208 | ||||||||
| 프로 사이트 | PDOC00612 | ||||||||
| SCOP2 | 1rh5 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3. A.5 | ||||||||
| OPM 슈퍼 패밀리 | 19 | ||||||||
| OPM단백질 | 1rh5 | ||||||||
| 막질 | 165 | ||||||||
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SecY 단백질은 박테리아 Sec 또는 Type II 분비 경로의 주요 막 통과 서브유닛이며, SecYEG 트랜스클로콘으로도 알려진 단백질 분비 ATPase 복합체이다.SecYEG 복합체의 상동물은 진핵생물 및 고세균에서 발견되며, 여기서 하위 단위는 Sec61α로 [2]알려져 있다.
그램 음성세균의 내막을 가로질러 시그널펩타이드를 운반하는 일부 단백질의 분비는 전단백질전달효소 경로를 통해 일어난다.단백질은 전구체로서 세포질에서 생성되며,[3] 그것들을 막 내의 트랜스로카아제 성분으로 유도하기 위해 샤페론 서브유닛을 필요로 한다.여기에서 성숙한 단백질은 외막을 목표로 하거나 주증강 단백질로 남는다.전이효소 단백질 서브유닛은 세균 염색체에 암호화되어 있다.
전이효소 경로는 샤페론 단백질(SecB), ATPase(SecA), 통합막 복합체(SecY, SecE 및 SecG) 및 성숙한 펩타이드의 페리즘으로의 방출을 촉진하는 두 개의 추가 막 단백질(SecD 및 SecF)[3]을 포함한 7개의 단백질로 구성된다.샤페론 단백질[4] SecB는 세균 세포질에서 "이합체의 이합체"로 존재하는 매우 산성인 호모테트라미어 단백질입니다.SecB는 번역 후 전개된 상태로 사전단백질을 유지하며,[5] 이를 말초막 단백질 ATPase SecA를 대상으로 분비한다.
세포질 영역 2, 3 및 TM 도메인 1, 2, 4, 5, 7, 10은 잘 보존되어 있으며, 보존된 세포질 영역은 세포질 분비 인자와 상호작용하는 것으로 생각되며, TM 도메인은 단백질 [6]수출에 참여할 수 있다.SecY는 또한 몇몇 조류의 엽록체 게놈에 암호화되어 있으며, 색조류와 [7]암호조류에 존재하는 엽록체 내질망막(CER)의 두 막을 가로지르는 원핵생물 유사 단백질 수출 시스템에 관여할 수 있다.
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레퍼런스
- ^ Van den Berg B, Clemons WM, Collinson I, Modis Y, Hartmann E, Harrison SC, Rapoport TA (January 2004). "X-ray structure of a protein-conducting channel". Nature. 427 (6969): 36–44. Bibcode:2004Natur.427...36B. doi:10.1038/nature02218. PMID 14661030. S2CID 4360143.
- ^ Auer J, Spicker G, Böck A (June 1991). "Presence of a gene in the archaebacterium Methanococcus vannielii homologous to secY of eubacteria". Biochimie. 73 (6): 683–8. doi:10.1016/0300-9084(91)90048-6. PMID 1764515.
- ^ a b Bieker KL, Phillips GJ, Silhavy TJ (June 1990). "The sec and prl genes of Escherichia coli". Journal of Bioenergetics and Biomembranes. 22 (3): 291–310. doi:10.1007/BF00763169. PMID 2202721. S2CID 10694864.
- ^ Driessen AJ (May 2001). "SecB, a molecular chaperone with two faces" (PDF). Trends in Microbiology. 9 (5): 193–6. doi:10.1016/S0966-842X(01)01980-1. hdl:11370/4e5ebfac-d58c-42db-b42e-01c22d469a82. PMID 11336818.
- ^ Müller JP (July 1999). "Effects of pre-protein overexpression on SecB synthesis in Escherichia coli". FEMS Microbiology Letters. 176 (1): 219–27. doi:10.1016/s0378-1097(99)00239-6. PMID 10418149.
- ^ Suh JW, Boylan SA, Thomas SM, Dolan KM, Oliver DB, Price CW (February 1990). "Isolation of a secY homologue from Bacillus subtilis: evidence for a common protein export pathway in eubacteria". Molecular Microbiology. 4 (2): 305–14. doi:10.1111/j.1365-2958.1990.tb00597.x. PMID 2110998. S2CID 27373166.
- ^ Douglas SE (February 1992). "A secY homologue is found in the plastid genome of Cryptomonas phi". FEBS Letters. 298 (1): 93–6. doi:10.1016/0014-5793(92)80029-G. PMID 1544427. S2CID 22351990.
