릴리바이러스X

Lily virus X
Caudovirales목의 Lilyvirus속과 혼동하지 마십시오.
릴리바이러스X
바이러스 분류 e
(순위 미지정): 바이러스
영역: 리보비리아
왕국: 오르토나비라과
문: 키트리노비리코타
클래스: 알수비리세테스
주문: 타이모비랄레스
패밀리: 알파플렉시바이러스과
속: 포텍스바이러스
종류:
릴리바이러스X

Lily 바이러스 X(LVX)는 Alphaflexiviridae 및 Tymovirales목의 병원성 ssRNA(+) 식물 바이러스이다.

묘사

LVX는 ICTV의 4차 보고서(1982)에 설명되어 있다.그것은 백합에서 주로 발견되지만, 더 많은 식물들이 영향을 받기 쉽고, 바이러스는 기계적으로만 전염되는 것으로 생각됩니다.알려진 벡터는 없지만 살충제 사용은 LVX의 확산을 효과적으로 감소시켰으며, 이 LVX에서 바이러스의 전염이 곤충 [1]매개라는 것을 알 수 있다.이 바이러스의 증상은 아직 알려지지 않았기 때문에 자연감염과 확산 정도를 조사하는 능력을 난독화시킨다.

구조.

이 이미지는 필라멘트 식물 [2]바이러스의 나선형 세그먼트를 보여줍니다.

LVX는 나선형 대칭을 가진 비포장형 바이러스입니다.LVX를 포함한 모든 포텍스 바이러스는 나선 회전당 단백질 [3]서브유닛이 9개 미만인 것으로 알려져 있다.이러한 핵캡시드 형성 패턴은 핵캡시드가 대부분의 식물 바이러스처럼 길고 유연한 필라멘트형 바이러스인 것을 야기한다.다른 포텍스 바이러스(평균 길이 550 nm)와 달리 LVX의 길이는 470 nm, 폭은 13 [4]nm입니다.LVX는 면역골드 라벨링 [5]테스트와 같은 혈청학적 테스트에 의해 백합 무증상 칼라바이러스(LSV)와 구별된다.

게놈

RdRp, TGBp 1/2/3 및 피복단백질을 나타내는 포텍스바이러스 게놈 복제 및 mRNA 합성.

LVX 게놈은 크기가 5.9-7킬로베이스인 단일 가닥(+RNA) 배열로 구성됩니다.게놈에는 5개의 단백질(RdRp, TGBp1, TGBp2, TGBp3, CP)[6]을 코드화하는 3개의 ORF(Open Reading Frame)만 포함되어 있습니다.5' 끝은 상한이고 3' 끝은 폴리아데닐화됩니다.

이러한 단백질은 24kDa, 12kDa, 22kDa이며, 세 번째는 외피 단백질이며, RNA의존성 RNA 중합효소(RdRp)[7]를 코드화한다.24 kDa ORF의 정지 코돈과 12 kDa ORF의 시작 코돈이 서로 겹친다.많은 포텍스 바이러스 게놈이 이 외피 단백질 ORF의 즉시 5'인 작은 ORF를 포함하고 있지만 LVX 게놈에서는 발견되지 않는다.이 ORF는 적어도 6개의 다른 potex virus 게놈에서 확인되었기 때문에 이러한 차이는 놀랍습니다.그러나 LVX와 다른 포텍스바이러스에 의해 암호화된 단백질을 보면 아미노산 배열 사이에 유의미한 유사성이 있었다.LVX의 5' 말단에는 GDD 모티브를 포함한 폴리펩타이드를 코드하는 잘린 ORF가 있다.이 모티브는 또한 다른 포텍스바이러스에 의해 코드된 단백질의 C 말단에서도 발견된다.LVX의 24 kDa 단백질을 검사한 결과 뉴클레오시드 삼인산 결합 모티브(GXXGXGKS/T)가 포함되어 있는 것으로 나타났다.이 모티브는 백합 바이러스 25kDa 단백질뿐만 아니라 감자 바이러스 X와 감자 바이러스 S와 같은 다른 포텍스 바이러스의 25-26kDa 단백질에서도 발견되었다.

LVX는 또한 24kDa 단백질의 추정 포텍스바이러스 서브게놈 프로모터 배열(GTTAAGTT---GAA) 상류(5')를 포함한다.이 배열은 또한 유사한 바이러스, 특히 백합 무증상 바이러스에서 외피 단백질의 시작 코돈 상류에서 발견됩니다.연구진은 LVX에 감염된 백합 잎을 보고 유전자의 하위 RNA의 존재를 발견했다.이 RNA들은 길이가 약 2000에서 850 뉴클레오티드로 추정된 아유전체 촉진제와 일치했다.이를 통해 24kDa 단백질과 22kDa 단백질(코트 단백질) 모두에 전달 물질로 기능할 가능성이 있는 것으로 파악됐다.LVX 배열에서 12kDa ORF와 22kDa(코트 단백질) ORF 사이에는 변환되지 않은 영역이 있다.다른 potexvirus 시퀀스의 경우 이 영역은 각각 7kDa 및 11kDa ORF를 포함하지만 LVX 시퀀스의 이 영역에는 중단 없는 판독 프레임이 있습니다.이 판독 프레임은 뉴클레오티드 위치 1236에서 시작하여 위치 1646에서 끝납니다.이 영역이 번역될 경우, 암호화된 단백질은 위에서 언급한 7kDa 및 11kDa 단백질과 유사하여 LVX의 외피 단백질 ORF 내에서 18개의 뉴클레오티드가 종료된다.게놈에 개시 코돈이 없기 때문에 이 LVX ORF의 번역은 번역되지 않습니다.

Triple Gen Block 1(TGBp1)은 다기능 단백질이다.RdRp 기능을 위해 이중 가닥 RNA를 분리하여 RNA 헬리케이스 역할을 함으로써 바이러스 RNA의 번역을 촉진하는 역할을 한다.게다가, 그것은 바이러스 RNA의 [8]축적에 대한 면역 방어인 RNA 간섭을 억제하는 역할을 할 수 있다.TGBp1은 플라스모데스마타를 통해 바이러스 게놈을 인접한 식물 세포로 직접 전달해 숙주의 세포벽 [9]장벽을 우회함으로써 효율적인 번식을 가능하게 한다.TGBp1은 또한 플라스모데스말 크기 제외 한계를 증가시켜 바이러스 게놈이 한 세포에서 다른 세포로 더 쉽게 전달되도록 한다.마지막으로, 그것은 RNA 사일런싱을 억제하여 숙주가 RNA 게놈을 비활성화하는 것을 막습니다.

TGBp2 및 TGBp3는 부착 및 진입에 관여하는 막결합 단백질이다.TGBp3는 TGBp2 서브게놈 mRNA의 리크 스캔을 통해 발현된다.TGBp2 ORF에는 변환 개시 시에 리보솜에 의해 건너뛸 수 있는 약한 개시 코돈이 있습니다.이 경우 40S 리보솜 서브유닛은 TGBp3의 개시 코돈을 만나 변환을 시작할 때까지 스캔을 계속한다.

CP는 TGBp1, 바이러스 mRNA와 함께 리보핵단백질 복합체를 형성하는 LVX의 외피 단백질이다.

"LVX의 뉴클레오티드 배열은 다른 모든 포텍스 [10]바이러스에서 공통적으로 볼 수 있는 외피 단백질 시스트론에 대한 5'의 작은 열린 판독 범위를 분명히 결여하고 있기 때문에 포텍스 바이러스들 사이에서 독특한 것으로 보입니다."또한 게놈의 TGBp3 영역에는 정상적인 시작 코돈이 [11]없었다.5' 비부호화 영역은 GGAAAA로 시작하지만, 다른 포텍스 바이러스의 경우 모두 GAAA로 [12]시작할 수 있습니다.LVX 코드 배열의 계통학적 분석 결과 LVX는 Strawberry 순한 황색 가장자리 [13]바이러스와 가장 밀접한 관련이 있는 것으로 밝혀졌다.

"릴리 바이러스 X(LVX) 및 포텍스 바이러스의 다른 구성원의 완전한 코드 배열의 정렬된 뉴클레오티드 배열에 대한 계통수.포크의 값은 데이터 부트스트래핑 후 이 그룹화가 발생한 트리의 비율을 나타냅니다(70%를 초과하는 경우에만 표시).척도 막대는 [14]베이스당 대체 수를 나타냅니다."

레플리케이션

LVX는 알려진 벡터는 없지만 곤충에 의한 기계적 접종을 통해 퍼지고 세포 안으로 들어갈 가능성이 높다.LVX의 복제는 다른 ssRNA(+) 바이러스와 마찬가지로 세포의 세포질에서 발생합니다.일단 바이러스가 숙주 세포에 들어가면, 바이러스는 코팅되지 않고 바이러스 게놈 RNA를 세포질로 방출한다.그런 다음 바이러스 모노시스트론 RNA는 5'-근위 ORF에 의해 코드화된 RNA 의존성 RNA 중합효소로 변환된다.LVX의 복제는 단백질 TGBp1에 [15]의해 조직된 바이러스 공장에서 발생합니다.TGBp1은 호스트의 액틴과 엔도메인을 재배치하여 헬리컬 배열의 어셈블리를 만듭니다.이 나선 구조들은 바이러스가 더 [16]효율적으로 복제할 수 있는 지역을 만드는 숙주 내막으로 둘러싸여 있다.

ssRNA(+) 바이러스의 복제는 dsRNA(+) 바이러스를 생성하며, 이후 더 많은 LVX mRNA와 ssRNA(+) 게놈을 만들기 위해 추가로 전사 및 복제됩니다.바이러스의 하위 유전자 프로모터는 sgRNA의 번역으로 이어져 캡시드와 이동 단백질을 형성한다.이것들은 비리온 구조를 배열하고 바이러스 게놈을 정리하는데 사용된다.그런 다음 새로운 바이러스 입자를 생산하고 조립할 수 있습니다.LVX의 트리플 유전자 블록 단백질의 도움으로, 완성된 입자들은 다른 [17]숙주 세포들을 감염시키기 위해 플라스모데즈마타 사이의 장거리 및 더 짧은 세포간 공간을 통과할 수 있습니다.

관련 질병

LVX에는 관련된 질병이 없습니다.

증상

LVX의 자연 숙주 범위인 Lilium Formosanum에서 발생하는 두드러진 증상은 알려져 있지 않지만, Yang(1997)은 LVX에 감염된 백합이 비감염 표본보다 더 느리게 자라고 더 작은 경향이 있다는 것을 발견했다.테트라고니아 테트라고니오이데스 및 체노포듐 무랄레와 같은 다른 감수성 식물의 기계적 접종은 엽록소 국소 병변을 [18]초래한다.

트로피즘

자연에서는 볼 수 없지만 LVX가 Lilium Formosanum [19]이외의 여러 식물을 감염시킬 수 있다는 것이 실험실 테스트에 의해 밝혀졌다.그 밖에 감염되기 쉬운 것으로 판명된 종은 다음과 같습니다.[20]

  • 츄노포디움카피타툼
  • 츄노포디움쥐알레
  • 키노우치노우아
  • 곰프레나글로보사
  • 호모사쿠라
  • 니코티아나 벤타미아나
  • 니코티아나 클리블랜드
  • 테트라고니아테트라고니오이데스

LVX는 백합 식물의 모든 조직을 감염시킬 수 있다.비리온은 숙주 식물의 모든 부분에서 세포병리학적으로 검출되었으며, 약 5%의 핵산과 95%의 단백질을 함유하고 있으며 지질 [21]함량은 없다.살충제에 의해 바이러스의 확산이 억제되었지만 미네랄 오일 [22]스프레이에 의한 감염은 아니었기 때문에 곤충 벡터를 통한 기계적 접종 방식이 될 것으로 예상된다.

레퍼런스

  1. ^ Asjes, C.J.(1991)네덜란드 식물 경로 저널 97(3), 129-138의 광물유, 합성 피레트로이드 및 네매티시드에 의한 백합 속 튤립 파괴 바이러스, 백합 증상 없는 바이러스 및 백합 바이러스 X의 공기 전달 현장 확산 제어.
  2. ^ Kendall, A., 맥도날드, M., Bianc, W., Bowles, T., Baumgarten, S. C., Shi, J., … Stubbs, G. (2008)유연한 필라멘트 식물 바이러스의 구조.바이러스학 저널, 82(19), 9546~9554.
  3. ^ Kendall, A., 맥도날드, M., Bianc, W., Bowles, T., Baumgarten, S. C., Shi, J., … Stubbs, G. (2008)유연한 필라멘트 식물 바이러스의 구조.바이러스학 저널, 82(19), 9546~9554.
  4. ^ 스톤, O.M. (1980년)외떡잎식물에서 나온 두 개의 새로운 포텍스 바이러스.액타 호트 110, 59-63
  5. ^ 양, T. (1997년)Lilium Sp.의 세포학적 특성 및 바이러스 검출(박사 논문).플로리다 게인스빌 플로리다 대학입니다
  6. ^ Memelink, J., van der Blugt, C.I.M., Linthorst, H.J.M., Derks, A.F.L.M., Asjes, C.J., Bol, J.F.(1990).백합식물의 칼라바이러스(무증상 바이러스)와 포텍스바이러스(무증상 바이러스)의 게놈 사이의 상동성.일반 바이러스학 저널, 71, 917-924.
  7. ^ Memelink, J., van der Blugt, C.I.M., Linthorst, H.J.M., Derks, A.F.L.M., Asjes, C.J., Bol, J.F.(1990).백합식물의 칼라바이러스(무증상 바이러스)와 포텍스바이러스(무증상 바이러스)의 게놈 사이의 상동성.일반 바이러스학 저널, 71, 917-924.
  8. ^ 루비츠베르초, J. (2005)Potexvirus의 새로운 세포간 전송 모델.분자 식물-미생물 상호작용, 18(4), 283-290.
  9. ^ 루비츠베르초, J. (2005)Potexvirus의 새로운 세포간 전송 모델.분자 식물-미생물 상호작용, 18(4), 283-290.
  10. ^ 양, T. (1997년)Lilium Sp.의 세포학적 특성 및 바이러스 검출(박사 논문).플로리다 게인스빌 플로리다 대학입니다
  11. ^ Chen, J., Shi, Y.-H., Adams, M.J., Chen, J.P. (2005년)릴리 바이러스 X(genus Potex virus) 분리체의 게놈 RNA의 완전한 배열.바이러스학 아카이브, 150(4), 825-832.
  12. ^ Chen, J., Shi, Y.-H., Adams, M.J., Chen, J.P. (2005년)릴리 바이러스 X(genus Potex virus) 분리체의 게놈 RNA의 완전한 배열.바이러스학 아카이브, 150(4), 825-832.
  13. ^ Chen, J., Shi, Y.-H., Adams, M.J., Chen, J.P. (2005년)릴리 바이러스 X(genus Potex virus) 분리체의 게놈 RNA의 완전한 배열.바이러스학 아카이브, 150(4), 825-832.
  14. ^ Chen, J., Shi, Y.-H., Adams, M.J., Chen, J.P. (2005년)릴리 바이러스 X(genus Potex virus) 분리체의 게놈 RNA의 완전한 배열.바이러스학 아카이브, 150(4), 825-832.
  15. ^ 양, T. (1997년)Lilium Sp.의 세포학적 특성 및 바이러스 검출(박사 논문).플로리다 게인스빌 플로리다 대학입니다
  16. ^ 루비츠베르초, J. (2005)Potexvirus의 새로운 세포간 전송 모델.분자 식물-미생물 상호작용, 18(4), 283-290.
  17. ^ 양, T. (1997년)Lilium Sp.의 세포학적 특성 및 바이러스 검출(박사 논문).플로리다 게인스빌 플로리다 대학입니다
  18. ^ 스톤, O.M. (1980년)외떡잎식물에서 나온 두 개의 새로운 포텍스 바이러스.액타 호트 110, 59-63
  19. ^ 스톤, O.M. (1980년)외떡잎식물에서 나온 두 개의 새로운 포텍스 바이러스.액타 호트 110, 59-63
  20. ^ Phillips, S (1986). "Lily X potexvirus". Plant Viruses Online. Archived from the original on December 8, 2015. Retrieved December 7, 2015.
  21. ^ 스톤, O.M. (1980년)외떡잎식물에서 나온 두 개의 새로운 포텍스 바이러스.액타 호트 110, 59-63
  22. ^ Asjes, C.J.(1991)네덜란드의 광유, 합성 피레트로이드, 네마티시드에 의한 백합 속 튤립 파쇄 바이러스, 백합 무증상 바이러스 및 백합 바이러스 X의 공중 전파 제어.네덜란드 식물 경로 저널, 97(3), 129-138.

외부 링크