굿즈 버퍼
Good's buffers굿즈 버퍼(Good buffer)는 노먼 굿과 동료들이 1966~1980년 동안 선택하고 기술한 생화학 및 생물학적 연구를 위한 20가지 완충제다.[1][2][3] 일부(MES, ADA, BES, Bien)는 생물학자들이 이전에 간과했던 것으로 알려져 있지만 대부분의 완충제는 굿과 동료들이 처음으로 준비하고 실험한 새로운 zwitterionic 화합물이었다. 굿이 연구하기 전에는 생물학자들이 pH 6에서 8 사이의 수소 이온 완충기를 거의 이용할 수 없었으며, 매우 부적절하고 독성이 있으며 반응성이 없고 비효율적인 완충기를 자주 사용했었다. 많은 굿의 완충기가 현대 생물학 실험실에서 중요한 도구가 되었고 여전히 남아있다.
선정기준
Good는 생물학적 연구에서 가치가 있을 가능성이 높은 몇 가지 기준을 충족한 완충화합물을 식별하기 위해 노력했다.
- pKa: 대부분의 생물학적 반응은 6~8시 사이에 중립 pH에 가깝게 발생하기 때문에 이상적인 버퍼는 이 지역에서 pKa 값을 가지고 있어 그곳에서 최대 버퍼링 용량을 제공할 수 있을 것이다.
- 용해성: 취급의 용이성과 생물학적 시스템이 수성계통 안에 있기 때문에, 물의 용해성이 양호해야 했다. 또한 비극성 용매(고트, 오일 및 유기 용매)에서의 낮은 용해성은 생물학적 시스템의 비극성 구획(세포막 및 기타 세포 구획)에 완충 화합물이 축적되는 것을 방지하는 경향이 있기 때문에 유익한 것으로 간주되었다.
- 막 불침투성: 이상적으로는 완충제가 세포막을 쉽게 통과하지 못할 것이며, 이는 세포 내에 완충 화합물이 축적되는 것을 감소시킬 것이다.
- 최소 염분 효과: 고이온 완충제는 일부 생물학적 시스템에서 문제나 합병증을 일으킬 수 있다.
- 분리에 대한 영향: 매질의 완충농도, 온도, 이온성분이 완충기의 분리에 미치는 영향은 최소한이 있어야 한다.
- 올바른 행동의 양이온 상호작용: 완충제가 양이온 리간드로 콤플렉스를 형성한다면 형성된 콤플렉스는 용해성을 유지해야 한다. 이상적으로는 적어도 일부 완충 화합물은 복합체를 형성하지 않을 것이다.
- 안정성: 버퍼는 화학적으로 안정적이며 효소 분해 및 비전도성 저하에 저항해야 한다.
- 생화학적 불활성: 완충기는 생화학적 반응에 영향을 미치거나 참여해서는 안 된다.
- 광학 흡광도: 버퍼는 일반적으로 사용되는 분광도 측정값에 방해가 되지 않도록 230nm 이상의 파장에서 가시광선이나 자외선을 흡수해서는 안 된다.
- 간편한 준비: 완충제는 값싼 재료로 쉽게 준비하고 정제해야 한다.
굿즈 버퍼 목록
다음 표는 20°C에서의 pKa 값을 나타낸다. 온도의 ca. 0.01에 의해 값이 변화한다.[1][3] 굿의 1966년 원본 종이에는 비교를 위해 두 개의 오래된 버퍼(이탤릭체로 표시됨)가 있었다. 1972년 굿은 버퍼가 3개 더 있는 두 번째 리스트를 발표했고, 1980년에 5개가 더 추가되었다.
버퍼 | pka | 추가된 날짜 |
---|---|---|
메스 | 6.15 | 1966 |
비스트리스 메탄 | 6.60 | |
ADA | 6.62 | 1966 |
비스트리스프로판 | 6.80 | |
파이프 | 6.82 | 1966 |
ACES | 6.88 | 1966 |
모포 | 6.95 | 1980 |
염화콜라민 | 7.10 | 1966 |
MOPS | 7.15 | 1972 |
BES | 7.17 | 1966 |
테스 | 7.5 | 1966 |
헤페스 | 7.55 | 1966 |
딥소 | 7.6 | 1980 |
MOBS | 7.6 | |
아세타미도글리신 | 7.7 | 1966 |
탭소 | 7.6 | 1980 |
차 | 7.8 | |
팝소 | 7.85 | 1980 |
헵소 | 7.9 | 1980 |
EPS | 8.0 | |
헵시 | 8.1 | 1972 |
트리시언 | 8.15 | 1966 |
트리스 | 8.2 | 1966 |
글리시나미드 | 8.2 | 1966 |
글리실글리신 | 8.2 | 1966 |
햅스 | 8.3 | |
바이칼 | 8.35 | 1966 |
탭스 | 8.55 | 1972 |
AMPB | 8.8 | |
CHES | 9.3 | |
캡소 | 9.6 | |
앰프 | 9.7 | |
캡스 | 10.4 | |
CABS | 10.7 |
모든 완충제는 산성군(아세트산, 인산염, 설폰산염 ..)이나 기본군(아미노, 피리딜 ..)을 포함하고 있기 때문에 그 기능을 달성한다. 그 결과 생물학적으로 중요한 이온 Na+, K+, Mg2+, Ca로2+ 콤플렉스를 형성할 수 있고, 금속 이온에 포함된 금속 이온을 놓고 경쟁할 수 있다. 사실, Good는 "유니버설 생물학적 불활성에 대한 탐구가 헛된 것일 수도 있다"고 말했다.
Piperazine 함유 버퍼(PIPES, HEPEES, POPSO, EPPS)는 활성산소를 형성할 수 있으므로 생화학에서 redox 프로세스에 대한 연구에서는 피해야 한다.[4][5]
트리젠은 플라빈에 의해 광산화되므로, 햇빛에 플라보네 효소의 활성을 감소시킨다. ADA, POPSO, PARES의 유리산은 물에 잘 녹지 않지만 모노소듐염으로서 매우 녹는다. ADA는 260nm 이하에서 자외선을 흡수하고, ACES는 230nm 이하에서 흡수한다.
수년간 많은 굿즈 버퍼의 pKsa 및 기타 열역학 값을 철저히 조사하여 재평가하였다.[6] 일반적으로 노먼 굿과 그의 동료들은 생물학적 연구에 zwitterionic buffers를 사용할 가능성과 이득에 대해 과학계의 관심을 끌었다. 이후 AMPSO, CABS, CHES, CAPSO, CAPSO 등 다른 zwitterionic 화합물들이 생물학적 맥락에서 사용하기 위해 조사되었다.
참고 항목
참조
- ^ a b Good, Norman E.; Winget, G. Douglas; Winter, Wilhelmina; Connolly, Thomas N.; Izawa, Seikichi; Singh, Raizada M. M. (1966). "Hydrogen Ion Buffers for Biological Research". Biochemistry. 5 (2): 467–477. doi:10.1021/bi00866a011. PMID 5942950.
- ^ Good, Norman E.; Izawa, Seikichi (1972). "Hydrogen ion buffers". Methods Enzymol. 24: 53–68. doi:10.1016/0076-6879(72)24054-x. PMID 4206745.
- ^ a b Ferguson, W. J.; Braunschweiger, K. I.; Braunschweiger, W. R.; Smith, J. R.; McCormick, J. J.; Wasmann, C. C.; Jarvis, N. P.; Bell, D. H.; Good, N. E. (1980). "Hydrogen Ion Buffers for Biological Research". Anal. Biochem. 104 (2): 300–310. doi:10.1016/0003-2697(80)90079-2. PMID 7446957.
- ^ Grady, J. K.; Chasteen, N. D.; Harris, D. C. (1988). "Radicals from "Good's" buffers". Anal. Biochem. 173 (1): 111–115. doi:10.1016/0003-2697(88)90167-4. PMID 2847586.
- ^ Kirsch, M.; Lomonosova, E. E.; Korth, H.-G.; Sustmann, R.; de Groot, H. (1998). "Hydrogen peroxide formation by reaction of peroxynitrite with HEPES and related tertiary amines. Implications for a general mechanism". J. Biol. Chem. 273 (21): 12716–12724. doi:10.1074/jbc.273.21.12716. PMID 9582295.
- ^ Goldberg, R.; Kishore, N.; Lennen, R. (2002). "Thermodynamic Quantities for the Ionization Reactions of Buffers" (PDF). J. Phys. Chem. Ref. Data. 31 (2): 231–370. Bibcode:2002JPCRD..31..231G. doi:10.1063/1.1416902. Archived from the original (PDF) on 2008-10-06.