FightAIDS@Home

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FightAIDS@홈 스크린세이버

Fight AIDS@Home ('집에서 에이즈 퇴치')는 스크립스 연구소의 Olson 연구소에서 운영하는 분산 컴퓨팅 프로젝트입니다.인터넷에 연결된 가정용 컴퓨터에서 실행되며 2013년 7월부터는 Android 스마트폰과 [1]태블릿에서도 실행됩니다.생물의학 소프트웨어 시뮬레이션 기술을 사용하여 HIV/AIDS의 확산을 치료하거나 예방하는 방법을 모색하는 것을 목표로 하고 있습니다.

방법들

올슨의 목표는 HIV 단백질 분해효소인데, HIV 단백질 분해효소는 바이러스를 차단하면 바이러스의 성숙을 막는 핵심 분자 기계이다.따라서 "단백질 억제제"로 알려진 이러한 차단제는 에이즈의 시작을 피하고 수명을 연장하는 방법입니다.Olson Laboratory는 HIV 단백질 분해 효소를 차단하는 적절한 형태와 화학적 특성을 가진 새로운 후보 약물을 식별하기 위해 계산 방법을 사용하고 있습니다.이 일반적인 접근법은 구조 기반 약물 설계라고 불리며, 국립 보건원의 국립 종합 의학 연구소에 따르면, 이미 에이즈를 앓고 있는 사람들의 삶에 극적인 영향을 미치고 있다.

FightAIDS@Home은 특정 분자가 HIV-1 단백질 분해 효소에 얼마나 잘 결합하는지 테스트하는 AutoDock VINA 소프트웨어를 사용합니다.

2015년 10월 파이팅AIDS@Home Phase 2는 계산 집약적인 BEDAM(Binding Energy Distribution Analysis Method)을 사용하여 "Phase [2]1에서 생성된 방대한 수의 결과로부터 상위 후보를 보다 철저하게 평가하기 위해" 시작되었습니다.

역사

원래는 Entropia가 제공하는 분산 컴퓨팅 소프트웨어 인프라스트럭처를 사용하여 구현되었습니다.하지만 2003년 5월 이후로AIDS@Home은 Entropia와 [3]관련되지 않았으며, 2005년 11월 21일 World Community Grid로 이전하여 [4]Entropia 소프트웨어를 포기하였습니다.

Scripps Research Institute는 Fight의 결과에 대한 첫 번째 동료 평가 과학 논문을 발표했습니다.2007년 4월 21일, [5]AIDS@Home.이 백서에서는 지금까지의 결과가 향후의 Fight의 효율 향상에 주로 사용된다고 설명하고 있습니다.AIDS@Home 계산.[6]

2010년 2월 3일, 이 프로젝트는 완전히 새로운 종류의 에이즈 퇴치제를 가능하게 하는 두 가지 화합물을 발견했다고 발표했다: "에이즈 바이러스의 원인인 인간 면역 결핍 바이러스에 의해 사용되는 효소의 새로운 결합 부위에 작용하는 두 가지 화합물.이번 발견은 기존 치료법을 강화하고, 이 질병의 내약품성 변종을 치료하며, 바이러스 내 약물 내성의 진화를 늦추기 위한 새로운 종류의 항HIV 약물 개발의 토대를 마련했습니다."

시스템 요건

Fight를 실행하기 위한 최소 시스템 요건AIDS@home:[7]

기억 250 MB
하드 드라이브 50 MB
컴퓨터 그래픽스 선택적.
인터넷 접속

분산 컴퓨팅을 사용하면 모든 컴퓨터가 프로젝트를 가속화할 수 있습니다.또한 계산 프로세스는 백그라운드에서 최소 우선순위로 실행되도록 설정할 수 있기 때문에 프로그램이 설치되어 있는 머신의 성능에 거의 영향을 주지 않습니다.

출판물

  • Chang, Max W.; Lindstrom, William; Olson, Arthur J.; Belew, Richard K. (2007). "Analysis of HIV Wild-Type and Mutant Structures via in Silico Docking against Diverse Ligand Libraries" (PDF). J. Chem. Inf. Model. 47 (3): 1258–1262. doi:10.1021/ci700044s. PMID 17447753.
  • Perryman, A.; Santiago, D.; Forli, S.; Santos-Martins, D.; Olson, A. (2014), "Virtual screening with AutoDock Vina and the common pharmacophore engine of a low diversity library of fragments and hits against the three allosteric sites of HIV integrase: participation in the SAMPL4 protein–ligand binding challenge", Journal of Computer-Aided Molecular Design, 28 (4): 429–441, doi:10.1007/s10822-014-9709-3, PMC 4053500, PMID 24493410

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ FightAIDS@Home, retrieved 4 October 2015
  2. ^ FightAIDS@Home - Phase 2, retrieved 4 October 2015
  3. ^ "Worthy Cause: Fight AIDS At Home Computer Project". FuturePundit. 2003-12-01. Retrieved 2007-08-08.
  4. ^ "FightAIDS@Home". The Scripps Research Institute. Archived from the original on 2019-10-08. Retrieved 2007-08-08.
  5. ^ Chang, Max W.; William Lindstrom; Arthur J. Olson; Richard K. Belew (2007-04-21). "Analysis of HIV Wild-Type and Mutant Structures via in Silico Docking against Diverse Ligand Libraries". J. Chem. Inf. Model. 47 (3): 1258–1262. doi:10.1021/ci700044s. PMID 17447753. Retrieved 2007-07-30.
  6. ^ "FightAIDS@Home News Volume 3" (PDF). The Scripps Research Institute. 2007-05-10. Retrieved 2007-07-30.
  7. ^ "System Requirements". Help. World Community Grid. Retrieved 2015-10-04.

외부 링크