합성트랜스포손
Composite transposon |
복합트랜스포존은 트랜스포제 효소가 인식할 수 있는 역순의 반복 순서에 의해 옆으로 단백질 코딩 DNA 세그먼트를 가지고 있다는 점에서 단순한 트랜스포존 및 삽입 시퀀스(IS) 요소와 기능이 유사하다. 그러나 복합 트랜스포존에는 정확한 복제품이 될 수도 있고 아닐 수도 있는 두 개의 분리된 IS 요소가 측면에 있다. 각각의 IS 원소가 개별적으로 이동하는 대신에, 한 IS 원소에서 다른 원소로 확장되는 DNA의 전체 길이는 하나의 완전한 단위로 전치된다. 복합 트랜스포존은 항생제 내성을 부여한 하나 이상의 유전자를 가지고 있는 경우가 많다.
포유류 게놈에서 SINE에 의해 측면 배치됨
두 SING이 측면에 동시에 작용하여 DNA 배열을 방해할 수 있다. 이것은 소 베타 글로빈 유전자의 업스트림 710 bp DNA 염기서열에 대해 보고되었다.[1] DNA 배열은 합성 유전체 염기서열로 확인된 복합 트랜스포존을 형성하며, 여기서 동원된 염기서열은 콘티그 NW_0093315.1 뉴클레오티즈 #1085432–1086142의 소 염색체 2에서 찾을 수 있고, 원래 염기서열은 콘티그 NW_001501789.2 뉴클레오티즈 #109의 소 염색체에서 찾을 수 있다.6679–1097389. 유사한 복합 트랜스포존이 다른 소 게놈 지역과 다른 포유류 게놈에 존재할 가능성이 높다. 적절한 알고리즘으로 탐지할 수 있다.
참고 항목
참조
- ^ Zelnick CR, Burks DJ, Duncan CH (December 1987). "A composite transposon 3' to the cow fetal globin gene binds a sequence specific factor". Nucleic Acids Res. 15 (24): 10437–53. doi:10.1093/nar/15.24.10437. PMC 339954. PMID 2827124.
