삽입 시퀀스
Insertion sequence삽입 요소(IS, 삽입 시퀀스 요소 또는 IS 요소라고도 함)는 단순한 트랜스포저블 요소로 기능하는 짧은 DNA 배열입니다.삽입 배열은 두 가지 주요 특징을 가지고 있다: 그것들은 다른 전이 가능 요소들에 비해 작고(일반적으로 길이가 약 700에서 2500 bp), 그리고 전위 활동에 관여하는 단백질만을 코드한다(따라서 그것들은 항생제 내성 유전자와 같은 보조 유전자를 가지고 있는 다른 트랜스포존과는 다르다).이러한 단백질은 일반적으로 효소 반응을 촉매하여 IS가 움직이도록 하는 트랜스포사아제이며, 또한 전위 활성을 자극하거나 억제하는 조절 단백질이다.삽입 시퀀스의 부호화 영역은 일반적으로 반전 반복에 의해 측면으로 배치됩니다.예를 들어 잘 알려진 IS911(1250bp)은 2개의 36bp 역반복단에 의해 측면으로 배치되며 부호화 영역은 부분적으로 중복되는 2개의 유전자가 있어 트랜스포사제(OrfAB)와 조절단백질(OrfA)을 부호화한다.특정 삽입 시퀀스는 ISn 형식으로 명명할 수 있다.여기서 n은 숫자(예를 들어 IS1, IS2, IS3, IS10, IS50, IS911, IS26 등)이다.다만, 이것은 이름 짓기 방식만이 아닙니다.삽입배열은 통상 원핵유전체 맥락에서 논의되지만 Tc1/Mariner 트랜스포저블 원소의 패밀리에 속하는 특정 진핵생물 DNA 배열을 [1]삽입배열로 간주할 수 있다.
삽입배열은 자율적으로 발생하는 것 외에 복합트랜스포존의 일부로서도 발생할 수 있다.복합트랜스포존에서는 항생제 내성유전자(예를 들어 Tn10, Tn5)와 같은 하나 이상의 부속유전자 옆에 2개의 삽입배열이 있다.그럼에도 불구하고, 말단에 삽입 서열을 전달하지 않는 단위 트랜스포존이라고 불리는 다른 종류의 트랜스포존이 존재한다(예: Tn7).
복합 트랜스포존은 분해효소를 위해 측면 삽입 배열에 의존하지 않는다.분해효소는 tns 게놈의 일부이며 측면 반전 반복에서 절단된다.
IS 요소의 전위 빈도는 배양 성장 단계, 배지 조성, 산소 긴장, 성장 규모 및 표적 부위의 구조적 구성(예: 곡률, 특정 모티브의 존재, DNA 구성)[2]을 포함한 여러 매개변수에 의존합니다.
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ Mahillon, Jacques; Chandler, Michael (2020-12-26). "Insertion Sequences". Microbiology and Molecular Biology Reviews. 62 (3): 725–774. doi:10.1128/MMBR.62.3.725-774.1998. ISSN 1092-2172. PMC 98933. PMID 9729608.
- ^ Goncalves GA, Oliveira PH, Gomes AG, Prather KL, Lewis LA, Parzeres DM, Monteiro GA (2014). "Evidence that the insertion events of IS2 transposition are biased towards abrupt compositional shifts in target DNA and modulated by a diverse set of culture parameters" (PDF). Appl Microbiol Biotechnol. 98 (15): 6609–6619. doi:10.1007/s00253-014-5695-6. hdl:1721.1/104375. PMID 24769900. S2CID 9826684.
- 캠벨, 닐 A.와 리스, 제인 B.(2002).생물학(6차호), 페이지 345–346.샌프란시스코:벤자민 커밍스.ISBN 0-8053-6624-5.
- Mahillon Jacques, Chandler Michael (2020). "Insertion sequences". Microbiology and Molecular Biology Reviews. 62 (3): 725–774. doi:10.1128/MMBR.62.3.725-774.1998. PMC 98933. PMID 9729608.
- 프레스콧, 랜싱 M., 할리, 존 P., 클라인, 도널드 A. (2002).미생물학(5일자), 페이지 298–299.뉴욕: 맥그로힐ISBN 0-07-232041-9.
- Shuler, Michael L., Kargi, Fikret.바이오프로세스 엔지니어링: 기본 개념 (2판), 페이지 220.어퍼 새들 리버, 뉴저지주: 프렌티스 홀 PTR.ISBN 0-13-081908-5.