콜드 쇼크 도메인

Cold-shock domain
CSD
PDB 1h95 EBI.jpg
nmr(10최저 에너지 구조)로 결정된 인간 y-box 단백질 1(yb1)의 단극 dna-dna-cold shock 영역(csd)의 솔루션 구조
식별자
기호CSD
PfamPF00313
PfamCL0021
인터프로IPR002059
프로사이트PDOC00304
SCOP21mjc / SCOPe / SUPFAM
CDDcd04458

분자생물학에서 냉충격 영역(CSD)은 원핵 및 진핵 DNA 결합 단백질에서 발견된 약 70개의 아미노산으로 이루어진 단백질 영역이다.[1][2][3]이 영역의 일부는 RNP-1 RNA 결합 모티브와 매우 유사하다.[4]

대장균이 섭씨 37도에서 10도로 떨어지는 온도에 노출되면 4~5시간 지연 단계가 발생하고 이후 감소된 속도성장이 재개된다.[5]지연단계에서는 냉감 충격영역을 포함하는 13개 정도의 단백질의 발현이 2배~10배 증가한다.[6]소위 '콜드 쇼크' 단백질이라고 불리는 이 단백질은 세포가 최적의 성장 온도보다 낮은 온도에서 생존할 수 있도록 도와주는 쇼크 단백질과 대조적으로 세포가 최적 온도보다 높은 온도에서 생존할 수 있도록 돕는 것으로 생각되며, 이는 아마도 원핵세포염색체와 조직에 의해 이루어질 수 있다.[5]

참조

  1. ^ Doniger J, Landsman D, Gonda MA, Wistow G (April 1992). "The product of unr, the highly conserved gene upstream of N-ras, contains multiple repeats similar to the cold-shock domain (CSD), a putative DNA-binding motif". New Biol. 4 (4): 389–95. PMID 1622933.
  2. ^ Wistow G (April 1990). "Cold shock and DNA binding". Nature. 344 (6269): 823–4. doi:10.1038/344823c0. PMID 2184368. S2CID 4307500.
  3. ^ Jones PG, Inouye M (March 1994). "The cold-shock response--a hot topic". Mol. Microbiol. 11 (5): 811–8. doi:10.1111/j.1365-2958.1994.tb00359.x. PMID 8022259.
  4. ^ Landsman D (June 1992). "RNP-1, an RNA-binding motif is conserved in the DNA-binding cold shock domain". Nucleic Acids Res. 20 (11): 2861–4. doi:10.1093/nar/20.11.2861. PMC 336933. PMID 1614871.
  5. ^ a b Obokata J, Ohme M, Hayashida N (October 1991). "Nucleotide sequence of a cDNA clone encoding a putative glycine-rich protein of 19.7 kDa in Nicotiana sylvestris". Plant Mol. Biol. 17 (4): 953–5. doi:10.1007/bf00037080. PMID 1912512. S2CID 11927654.
  6. ^ Tafuri SR, Wolffe AP (November 1990). "Xenopus Y-box transcription factors: molecular cloning, functional analysis and developmental regulation". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87 (22): 9028–32. doi:10.1073/pnas.87.22.9028. PMC 55094. PMID 2247479.
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