센티모건

Centimorgan

유전학에서 센티모건(약칭 cM) 또는 지도 단위(m.u)유전적 연관성을 측정하는 단위다. 이것은 염색체 위치 사이의 거리(로키 또는 표식자라고도 함)로 정의되며, 단일 세대에서 예상되는 염색체 교차점의 평균 수는 0.01이다. 염색체를 따라 거리를 유추하는 데 종종 사용된다. 그러나 실제 물리적인 거리는 아니다.

물리적 거리와의 관계

이에 대응하는 염기쌍의 수는 게놈(염색체의 다른 영역은 교차점에 대한 서로 다른 예지를 가지고 있다)에 따라 크게 달라지며, 교차하는 감수분열이 일어나는 감수분열난생(여성 생식체의 형성)의 일부인지 아니면 정조세포(남성 생식체의 형성)의 일부인지에 따라서도 달라진다.

1센티모건은 평균적으로 인간의 약 100만 염기쌍에 해당한다.[1][2] 게놈에서 1센티모건에 해당하는 물리적 염색체 거리는 장소마다 다르며, 여성에서 생식세포 형성 중 재결합이 남성보다 훨씬 빈번하기 때문에 남녀 간에도 차이가 있기 때문에 관계는 거칠기만 하다. 콩 외 연구진은 암컷 게놈의 길이가 4460 cM인 반면 수컷 게놈의 길이는 2590 cM에 불과하다고 계산했다.[3] 플라스모디움 팔시파룸은 평균 재결합 거리가 15kb(centimoria)에 이른다. DNA 15kb(15,000 nucleotides)로 분리된 마커는 세대당 0.01의 예상 염색체 교차율을 가진다. 비합성 유전자(다른 염색체에 거주하는 유전자)는 본질적으로 연결되지 않으며, cM 거리는 해당되지 않는다는 점에 유의한다.

재조합 확률과의 관계

표지자 사이의 유전자 재조합은 두 표지자 사이에 홀수 수의 염색체 교차점이 있을 때만 검출되기 때문에 센티모르간 거리는 유전적 재조합의 확률과 정확히 일치하지 않는다. 포아송 분포에 따라 염색체 십자수의 수가 분포하는 J. B. S. Haldane의 지도 함수를 가정하면,[4] d 센티미터의 유전적 거리는 홀수의 염색체 십자수를 발생시키고, 따라서 확률과 함께 검출 가능한 유전적 재조합을 초래할 것이다.

여기서 sinh는 쌍곡 사인 함수다. 재조합 확률은 d의 작은 값에 대해 대략 d/100이며 d가 무한대로 갈 때 50%에 접근한다.

이 공식은 반전될 수 있으며 재결합 확률의 함수로 센티미터 단위로 거리를 제공한다.

어원

이 센티모건은 J. B. S. Haldane에 의해 유전학자 Thomas Hunt Morgan을 기리기 위해 명명되었다.[5] 그러나, 그것의 모회사인 모건은 오늘날 거의 사용되지 않는다.

참고 항목

참조

  1. ^ "Terms and Definitions". Office of Rare Diseases Research. National Institutes of Health. Archived from the original on 2012-07-17.
  2. ^ Harvey Lodish; Arnold Berk; Paul Matsudaira; Chris A. Kaiser; Monty Krieger; Matthew P. Scott; Lawrence Zipursky; James Darnell (2004). Molecular Cell Biology, Fifth Edition. San Francisco: W. H. Freeman. pp. 396. ISBN 0-7167-4366-3. ...in humans 1 centimorgan on average represents a distance of about 7.5x10E5 base pairs
  3. ^ Kong, A (10 June 2002). "A high-resolution recombination map of the human genome". Nature Genetics. 31 (3): 241–7. doi:10.1038/ng917. PMID 12053178.
  4. ^ "Mapping Functions". Department of Plant Sciences. Archived from the original on 2012-03-21.
  5. ^ Haldane, J.B.S. (1919). "The combination of linkage values and the calculation of distances between the loci of linked factors". Journal of Genetics. 8: 299–309. It is suggested that the unit of distance in a chromosome as defined above be termed a "morgan," on the analogy of the ohm, volt, etc. Morgan's unit of distance is therefore a centimorgan. (p. 305)

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