브루스 도널드

Bruce Donald

브루스 랜들 도널드(Bruce Randall Donald, 1958년 출생)는 미국의 컴퓨터 과학자 겸 컴퓨터 생물학자다.그는 제임스 B이다. 듀크 대학의 컴퓨터 과학 및 생화학 듀크 교수.그는 로보틱스, 마이크로 전자기계 시스템즈(MEMS), 기하학 및 물리적 알고리즘과 컴퓨터 기하학 등 컴퓨터 과학 분야와 단백질 설계, 단백질 구조 결정, 컴퓨터 화학 등 구조 분자 생물학과 생화학 분야에도 수많은 공헌을 했다.

전기

도날드는 1980년에 예일 대학교에서 러시아어 언어와 문학에서 학사 학위를 받았다.After working at the Laboratory for Computer Graphics and Spatial Analysis in the Graduate School of Design at Harvard University, he then attended MIT EECS, where he received his S.M. in EECS (1984) and Ph.D. in Computer Science (1987) under the supervision of professor Tomás Lozano-Pérez in the MIT AI Lab (Artificial Intelligence Laboratory).[1]1987년 코넬대 컴퓨터과학부 조교수로 입사했다.

코넬에서 도날드는 1993년에 종신 재직권을 받았고 1998년까지 코넬 대학교 컴퓨터 과학 부교수로 재직했다.스탠포드 대학에서 안식년(1994~1996)을 지내던 그는 폴 알렌의 연구개발과 기술 인큐베이터 인터벌 리서치 주식회사(1995~1997)에서 일했는데, 그곳에서 톰 응고와 함께 임베디드 제약 그래픽을 공동 발명했다.[2][3]다트머스로 이적한 후 도날드는 2006년 다트머스 대학교로 이사할 때까지 조안 P.와 에드워드 J. 폴리 1933 다트머스 대학교 컴퓨터 사이언스 교수였다.현재 도날드는 제임스 B이다. 듀크대 컴퓨터과학, 화학, 생화학 듀크대 교수, 듀크대 의과대학의 트리니티 예술과학과, 듀크대 의학센터.도날드는 2006년부터 2012년까지 윌리엄과 수 그로스 교수로 임명되었고, 제임스 B로 임명되었다. 2012년 듀크 교수.[4]

그는 컴퓨터 기계 협회(ACM)의 펠로우로 IEEE의 펠로우다.이전에는 구겐하임 펠로(2001~2002년)로 국립과학재단 총장 영탐사상(1989~1994년)을 받았다.2015년 도날드는 계산 분자 생물학에 기여한 공로로 미국과학진흥협회(AAAS)의 회원으로 선출되었다.[5]

일

도널드의 초기 연구는 로봇 모션 기획과 분산 조작 분야였다.[6]이후 그는 MEMS와 마이크로 로보틱스에 수많은 기여를 했으며, 60 µm x 250 µm x 10 µm 크기의 MEMS 마이크로 로봇을 설계했다.[7]

최근, 그는 구조 분자 생물학의 분야에 대한 연구를 수행했다; 주로 NMR 데이터로부터 단백질 설계와 단백질 구조 결정.그는 습식 실험실에서 실험적으로 성공적으로 실험된 단백질 설계를 위한 수많은 알고리즘을 개발했다.[8]단백질 설계 알고리즘은 앙상블과 지속적으로 유연한 로타머와 등뼈를 사용함으로써 설계 과정에 추가적인 분자 유연성을 포함시키려 한다.도날드는 또한 생물학적으로 중요한 단백질의 구조를 결정하기 위한 알고리즘을 개발했다.예를 들어, 그의 부분군 알고리즘 CRANS(Acta Crystalogr)가 있다.D. 2004; J. 비올.비결정학적 대칭성과 일치하는 교차 회전 피크를 식별하는 Chem. 2003)은 Cryptosporidium hominis에서 효소 디하이드로폴레이트 환원효소-시미딜산 신타아제(DHFR-TS)의 구조 결정에 사용되었는데, 이는 Cryptosporidium 생물학의 중요한 진보였다.그는 NMR 데이터에서 구조 정보를 추출하기 위해 많은 알고리즘과 계산 프로토콜을 설계했고, 그 정보를 구상 단백질과 대칭 호모올리거머의 구조를 계산하는데 사용했다.그의 알고리즘의 뚜렷한 특징은 데이터를 적게 사용하고 시간과 공간에 복잡성 이론적 보증을 제공한다는 것이다(예: B. R. Donald와 J. Martin 참조)."소량 2극 결합 구속조건을 이용한 자동 NMR 할당 및 단백질 구조 결정"NMR Spectroscopy 2009; 55(2):101-127.도날드는 MIT 출판사(2011년)가 펴낸 교과서인 구조분자생물학에서 구조분자생물학알고리즘에 관한 알고리즘의 저자다.

학생들

도날드는 많은 학생들과 포스트닥들을 감독했고, 그들 중 많은 학생들은 현재 MIT, 카네기-멜론 대학, 워싱턴 대학교, 시애틀 대학교, 매사추세츠 대학교, 다트머스 대학교, 듀크 대학교, 미들베리 칼리지, 토론토 대학교와 같은 유명한 대학의 교수들이다.단체들의 경쟁NIAID, NIST, IBM, Sandia National Laboratories.[9]

참고 항목

출판물

도날드는 100개가 넘는 출판물의 저자다.대표적인 선택 사항:

참조

  1. ^ "Bruce Donald's Vita" (PDF).
  2. ^ "System for Image Manipulation and Animation Using Embedded Constraint Graphics. J. T. Ngo and B. R. Donald. U.S. Patent #5,933,150, issued August 3, 1999" (PDF).
  3. ^ "Accessible Animation and Customizable Graphics via Simplicial Configuration Modeling. T. Ngo, D. Cutrell, J. Dana, B. R. Donald, L. Loeb, and S. Zhu. Proc. ACM SIGGRAPH (New Orleans) July, 2000, pp. 403-410" (PDF).
  4. ^ 듀크, 듀크 대학 보도 자료, 2012년 5월 발표
  5. ^ 브루스 R. 도날드는 2015년 12월 듀크 대학 의학 센터의 생화학부 AAAS의 펠로우로 선출되었다.
  6. ^ Donald, Bruce R. (September 4, 1989). Error Detection and Recovery in Robotics. Springer-Verlag. ISBN 9780387969091 – via ACM Digital Library.
  7. ^ Donald, Bruce R.; Levey, Christopher; Paprotny, Igor (2008). "Planar Microassembly by Parallel Actuation of MEMS Microrobots". Journal of Microelectromechanical Systems. 17 (4): 789–808. doi:10.1109/JMEMS.2008.924251. S2CID 12040410.
  8. ^ Frey, Kathleen M; Ivelin Georgiev; Bruce R. Donald; Amy C. Anderson (3 August 2010). "Predicting resistance mutations using protein design algorithms" (PDF). PNAS. 107 (31): 13707–13712. Bibcode:2010PNAS..10713707F. doi:10.1073/pnas.1002162107. PMC 2922245. PMID 20643959. Retrieved 30 January 2012.
  9. ^ "Donald Lab at Duke University". www2.cs.duke.edu.

외부 링크