비베이스

Beebase
영국 국립 벌 단위의 웹사이트인 BeeBase는 국립 벌 단위를 참조하십시오.

BeeBase는 유럽 꿀벌인 Apis mellifera와 관련된 데이터를 일부 병원균 및 다른 종과 함께 보여주는 온라인 생물정보학 데이터베이스입니다.이것은 꿀벌 게놈 배열 [1]컨소시엄과 공동으로 개발되었습니다.2020년에 그것은 보관되었고 Hymenoptera Genome Database로 대체되었다.

데이터.

이 사이트는 다음과 같은 병원균과 함께 아피멜리페라의 게놈 서열을 호스트한다.

다음 두 종이 추가로 분석 중입니다.

2007년 2월, BeeBase는 GMOD(Generic Model Organism Database) 프로젝트의 모듈인 GBrowser 기반의 게놈 뷰어와 CMAP 기반의 비교 지도 뷰어로 구성되었습니다.게놈 뷰어는 알려진 꿀벌 유전자, 예측 유전자 세트(Ensubbl, NCBI, EMBL-Heidelberg), STS 마커(Solignac 및 Hunt 연결 지도), 꿀벌 표현 시퀀스 태그(EST), 초파리, 모기 및 기타 곤충과 전이성 요소를 포함했다.꿀벌 비교 지도 뷰어는 지도에서 공통되는 마커를 강조 표시하여 연계 지도와 물리 지도(게놈 조립체)를 표시하였다.

BeeBase의 향후 개선 계획에는 QTL 뷰어와 유전자 발현 데이터베이스가 있습니다.게놈 배열은 이러한 다양한 데이터 유형을 연결하는 참조가 될 것입니다.

BeeBase에서 이용할 수 있는 생물학적 데이터와 서비스는 다음과 같습니다.

  • DNA 및 단백질 배열 데이터
  • 공식 벌 유전자 세트(Beebase에서 개발 및 호스트)
  • 게놈 브라우저
  • 링크 맵
  • BLAST를 사용하여 꿀벌 게놈을 검색하는 서버

Beebase는 Baylor College of Medicine Human Genome Sequencing [2]Center와 협력하여 벌 게놈 커뮤니티 주석을 구성했습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c BeeBase 웹사이트 - http://hymenopteragenome.org/beebase/
  2. ^ Elsik, C. G.; Worley, K. C.; Zhang, L.; Milshina, N. V.; Jiang, H.; Reese, J. T.; Childs, K. L.; Venkatraman, A.; Dickens, C. M.; Weinstock, G. M.; Gibbs, R. A. (25 October 2006). "Community annotation: Procedures, protocols, and supporting tools". Genome Research. 16 (11): 1329–1333. doi:10.1101/gr.5580606.

외부 링크

「 」를 참조해 주세요.


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