WDR53

WDR53
WDR53 구조장랩, 미시간 대학교

WD 리피트 포함 단백질 53(WDR53)은 WDR53 유전자가 암호화한 단백질로 인간 게놈 프로젝트에 의해 인간 게놈에서 확인됐지만 현재 그 기능을 이해하기 위한 실험 절차가 부족했다.그것은 호모 사피엔스의 3q29 위치에 있는 3번 염색체에 위치해 있다.이것은 다양한 기능(신호 변환, 전사 조절, 아포토시스 등)과 연계된 WD40 반복 영역뿐만 아니라 짧은 상향 및 하류 미번역 영역을 가지고 있다.

표현

H. 사피엔스에서, 그것은 다른 조직들에서 [1]거의 추적할 수 없는 낮은 발현과 함께 고환의 조직들에서 매우 발현되는 것으로 나타났다.

진

WDR53은 1701개의 베이스 [2]쌍을 가진 mRNA를 전사합니다.이 유전자는 3번 염색체의 음의 가닥에 있으며 4개의 [3]엑손이 있다.mRNA는 Genomatix의 GXP_2341이라는 프로모터를 가지고 있으며 길이는 [4]1253bp이다.

mRNA

WDR53은 6개의 다른 mRNA 제품에 번갈아 스플라이스할 수 있습니다.

단백질

WDR53에서 번역된 단백질은 358개의 [5]아미노산으로 인코딩된 7개의 식별 가능한 WD40 영역을 포함합니다.단백질 제품은 38.99kDa이다.[6]

서브셀룰러 현지화

WDR53에 의해 형성된 원뿔형

WDR53은 [7]세포핵에 국소화될 것으로 예측되어 왔다.이 단백질은 심지어 하나의 핵 국재 신호를 가지고 있다.

구조.

WDR53의 2차 구조는 주로 나선형이 [8]거의 없는 루프와 스트랜드 간의 교대로 예측되어 왔다.이러한 WD40 영역은 다른 [9]진핵생물뿐만 아니라 인간 게놈의 여러 다른 유전자에 보존된 세 번째 프로펠러와 같은 구조로 접힙니다.이 일곱 번의 반복은 중심 우울증이 다른 단백질의 결합점 역할을 하는 원추형 모양으로 형성된다.

상호작용 단백질

WDR53과 상호작용하는 단백질로는 WDR5와 MCPH1의 두 가지가 있습니다.이들 단백질 각각은 WDR53과 관련성이 높은 영역을 가지고 있으며, 두 단백질 모두 고환에서 발현되어 진정한 [10][11]연관성이 있을 가능성을 강화한다.

번역 후 수정을 나타내는 단백질 지도.

번역 후 수정

WDR53은 인산화, 수모일화 및 글리코실화와 같은 단백질 변형을 거친다.

호몰로지

WD40의 반복은 많은 진핵생물에 걸쳐 보존되기 때문에 WDR53은 애플과 같은 식물계의 특정 구성원에게도 많은 진핵생물에 보존된다.

유기체 간 피브리노겐과 시토크롬-C에 대한 WDR53의 돌연변이율
맞춤법
유기체 등록 번호 아이덴티티 비율 호모 사피엔스와의 차이(MYA)
밍크웨일 XP_007171665 89 94
태즈메이니아 데빌 XP_003763726 75 160
중국악어 XP_006037148 69 320
킹 코브라 ETE62634 62 320
아메리카 황소개구리 PIO13894 54 353
제브라피시 XP_001339961.1 48 432
가시관 불가사리 XP_022093401 35 627
이스턴 오이스터 XP_022289021 30 794
사과 AFV94635 26 1624

레퍼런스

  1. ^ "WDR53 WD repeat domain 53 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. NCBI. Retrieved 5 February 2018.
  2. ^ "WD repeat-containing protein 53 isoform a [Homo sapiens] - Protein - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2018-02-19.
  3. ^ "WD repeat-containing protein 53 isoform a [Homo sapiens] - Protein - NCBI".
  4. ^ 제노마딕스의 엘도라도
  5. ^ "WD repeat-containing protein 53 isoform a [Homo sapiens] - Protein - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2018-02-19.
  6. ^ "WDR53 - WD repeat-containing protein 53 - Homo sapiens (Human) - WDR53 gene & protein". www.uniprot.org. Retrieved 2018-05-06.
  7. ^ "aGE251ffc52e51822bf2e9b6375a5787012 WoLFPSORT output". wolfpsort.hgc.jp. Retrieved 2018-05-06.
  8. ^ "Protein Predictions". predictprotein.org. 2018-05-06. Retrieved 2018-05-11.
  9. ^ Smith, Temple F; Gaitatzes, Chrysanthe; Saxena, Kumkum; Neer, Eva J (1999-05-01). "The WD repeat: a common architecture for diverse functions". Trends in Biochemical Sciences. 24 (5): 181–185. doi:10.1016/S0968-0004(99)01384-5. ISSN 0968-0004. PMID 10322433.
  10. ^ "WDR5 WD repeat domain 5 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI".
  11. ^ "MCPH1 microcephalin 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI".