스리니바스 알루루
Srinivas Aluru스리니바스 알루루 | |
|---|---|
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| 시민권 | 미국인의 |
| 모교 | 아이오와 주립 대학교 |
| 수상 | 존 V. 아타나소프 디스커버리상(2017년) IEEE 펠로우(2010) AAAS 펠로우(2010) 스와나자얀티 펠로십(2007-2012) IEEE 컴퓨터 협회 골든 코어 IEEE 컴퓨터 협회 공로 NSF 커리어(1997) |
| 과학 경력 | |
| 필드 | 고성능 컴퓨팅, 데이터 과학, 생물 정보학, 과학 컴퓨팅, 문자열 알고리즘 |
| 기관 | 아이오와 주립 대학교 조지아 공과대학교 |
| 논문 | 분포에 독립적인 계층적 N-body 방법 |
| 박사학위 자문위원 | 존 구스타프슨, G.M. 프라부 |
Srinivas Aluru는 조지아 공대 컴퓨터공학부 교수로, 조지아 공대 데이터공학 및 과학 분야의 학제간 연구소의 공동이사를 맡고 있다.[1][2]그의 주요 연구 분야는 고성능 컴퓨팅, 데이터 과학, 생물정보학 및 시스템 생물학, 과학 컴퓨팅에서의 조합 방법, 끈 알고리즘이다.알루루는 미국과학진흥협회(AAAS)와 전기전자공학연구소(IEEE)의 펠로우다.그는 병렬 알고리즘과 응용분야에서의 연구 기여, 생물정보학 및 계산생물학의 학문간 연구, 특히 이 두 분야의 교차점 연구로 가장 잘 알려져 있다.[3][4]null
교육
알루루는 1989년에 인도 공과대학 마드라스에서 컴퓨터 공학 학사 학위를 마쳤다.그 후 1991년과 1994년에 아이오와 주립대에서 컴퓨터 공학 석사, 박사 학위를 받았다.그의 박사학위 논문은 "분산 독립적 계층적 N-body 방법"[1]이었다.null
직업 및 연구
알루루는 1991년 아메스 연구소에서 연구 보조로 일을 시작했다.박사학위를 취득한 후 잠시 시러큐스 대학에서 초빙교수로 근무하다가 뉴멕시코 주립대학 컴퓨터과학과 조교수로 입사했다.1999년 모교에 복귀해 전기컴퓨터공학부 교수로 재직했다.아이오와 주립대학에서 그는 스탠리 학제간 공학(2006~2009년)과 멜 교수직(2009~2013년)을 역임했다.부서간 생물정보학 프로그램(2005~2007)을 이끌었고 ECE 부서에서 연구 및 대학원 교육 부대표(2003~2006)를 역임했다.조기경력, 중간경력, 우수 연구성과상 등 여러 대학 연구상을 수상했으며, 고성능 컴퓨팅과 생명정보학 분야의 연구를 이끌었다.2013년 조지아 공과대학 전산공학부로 전학했다.[1]null
알루루의 연구는 병렬 알고리즘과 생물정보학, 특히 유전체학에 대한 기여에 초점을 맞추었다.그는 컴퓨터 생물학에서 병렬 방법의 개발과 고투과 DNA 염기서열 분석과 그 응용을 위한 알고리즘과 소프트웨어의 개발을 선도했다.이러한 맥락에서, 그의 그룹의 일부 작업은, 특히 접미사 배열과 대략적인 시퀀스 매칭을 위한 알고리즘을 구성하기 위한 기본적인 문자열 알고리즘의 개발로 이어졌다.그는 또한 최적의 시공간에서 문자열 편집 거리 또는 생물학적 시퀀스 정렬을 계산하는 개방형 문제를 해결했다.그는 메이지 게놈의 염기서열 분석, 메이지에서 새로운 유전자를 찾고 식물에서 성장과 가뭄 대응을 뒷받침하는 유전 메커니즘을 밝혀내는 등 여러 가지 높은 영향 프로젝트에서 도메인 과학자들과 협력했다.[5]null
빅데이터의 초기 개척자인 Aluru는 2012년 연방 빅데이터 1차 투자에서 수상한 8개의 첫 중간 규모 NSF-NIH 빅데이터 프로젝트 중 하나를 주도했다.그는 NITRD와 OSTP가 주도하는 백악관 워크숍에 기여했고 NSF와 DOE가 빅데이터 연구를 만들고 육성하기 위한 노력을 주도했다.그는 미국 남부 16개 주와 워싱턴 DC의 조직 간 빅데이터 파트너십을 키우는 NSF 사우스 빅데이터 지역혁신허브를 만들기 위한 노력을 주도했다.[6]null
수상
선택한 게시물
- Schnable, Patrick S.; Ware, Doreen; Fulton, Robert S.; Stein, Joshua C.; Wei, Fusheng; Pasternak, Shiran; Liang, Chengzhi; Zhang, Jianwei; Fulton, Lucinda (2009-11-20). "The B73 Maize Genome: Complexity, Diversity, and Dynamics". Science. 326 (5956): 1112–1115. Bibcode:2009Sci...326.1112S. doi:10.1126/science.1178534. ISSN 0036-8075. PMID 19965430. S2CID 21433160.
- Ko, Pang; Aluru, Srinivas (2003-06-25). Space Efficient Linear Time Construction of Suffix Arrays. Combinatorial Pattern Matching. Lecture Notes in Computer Science. Springer, Berlin, Heidelberg. pp. 200–210. doi:10.1007/3-540-44888-8_15. ISBN 978-3540448884.
- Huang, Xiaoqiu; Wang, Jianmin; Aluru, Srinivas; Yang, Shiaw-Pyng; Hillier, LaDeana (2003-09-01). "PCAP: A Whole-Genome Assembly Program". Genome Research. 13 (9): 2164–2170. doi:10.1101/gr.1390403. ISSN 1088-9051. PMC 403719. PMID 12952883.
- Kim, Dong Kyue; Sim, Jeong Seop; Park, Heejin; Park, Kunsoo (2003-06-25). Linear-Time Construction of Suffix Arrays. Combinatorial Pattern Matching. Lecture Notes in Computer Science. Springer, Berlin, Heidelberg. pp. 186–199. CiteSeerX 10.1.1.458.3655. doi:10.1007/3-540-44888-8_14. ISBN 978-3540448884.
- Yu, Xiaofei; Li, Lei; Zola, Jaroslaw; Aluru, Maneesha; Ye, Huaxun; Foudree, Andrew; Guo, Hongqing; Anderson, Sarah; Aluru, Srinivas (2011-02-01). "A brassinosteroid transcriptional network revealed by genome-wide identification of BESI target genes in Arabidopsis thaliana". The Plant Journal. 65 (4): 634–646. doi:10.1111/j.1365-313X.2010.04449.x. ISSN 1365-313X. PMID 21214652.
- Aluru, Srinivas (2005-12-21). Handbook of Computational Molecular Biology. CRC Press. ISBN 9781420036275.
- Yang, X.; Chockalingam, S. P.; Aluru, S. (2013-01-01). "A survey of error-correction methods for next-generation sequencing". Briefings in Bioinformatics. 14 (1): 56–66. doi:10.1093/bib/bbs015. ISSN 1467-5463. PMID 22492192.
- Aluru, Srinivas (2005). "Space efficient linear time construction of suffix arrays". Journal of Discrete Algorithms. 3 (2–4): 143–156. doi:10.1016/j.jda.2004.08.002.
- Yang, X.; Dorman, K. S.; Aluru, S. (2010-10-15). "Reptile: representative tiling for short read error correction". Bioinformatics. 26 (20): 2526–2533. doi:10.1093/bioinformatics/btq468. ISSN 1367-4803. PMID 20834037.
- Ott, Michael; Zola, Jaroslaw; Stamatakis, Alexandros; Aluru, Srinivas (2007). "Large-scale maximum likelihood-based phylogenetic analysis on the IBM Blue Gene/L". Proceedings of the 2007 ACM/IEEE conference on Supercomputing - SC '07. p. 1. doi:10.1145/1362622.1362628. ISBN 9781595937643. S2CID 16113442.
- Kalyanaraman, A. (2003-06-01). "Efficient clustering of large EST data sets on parallel computers". Nucleic Acids Research. 31 (11): 2963–2974. doi:10.1093/nar/gkg379. ISSN 0305-1048. PMC 156714. PMID 12771222.
- Rajko, S.; Aluru, S. (December 2004). "Space and time optimal parallel sequence alignments". IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems. 15 (12): 1070–1081. doi:10.1109/TPDS.2004.86. ISSN 1045-9219. S2CID 1183248.
참조
 | 스콜리아는 Srinivas Aluru의 작가 프로필을 가지고 있다. |
- ^ a b c d "Srinivas Aluru's Home". www.cc.gatech.edu. Retrieved 2017-12-03.
- ^ "Georgia Tech Meets Big Data Challenges by Uniting Under New Institute". www.news.gatech.edu. Retrieved 2017-12-03.
- ^ "NSF Announces Interagency Progress on Administration's Big Data Initiative NSF - National Science Foundation". www.nsf.gov. Retrieved 2017-12-03.
- ^ "News - Video - Srinivas Aluru of Iowa State University works at the intersection of the life sciences and big data. NSF - National Science Foundation". www.nsf.gov. Retrieved 2017-12-03.
- ^ "Researchers detail genetic mechanisms that govern growth and drought response in plants". Retrieved 2017-12-03.
- ^ "Georgia Tech and UNC's RENCI to Lead Major Effort that Applies Big Data Solutions to Regional Challenges College of Computing". www.cc.gatech.edu. Retrieved 2017-12-03.
- ^ "Aluru, Srinivas". AAAS - The World's Largest General Scientific Society. 2016-08-29. Retrieved 2017-12-03.
