작은 카잘체 특이 RNA 17
Small Cajal body specific RNA 17| 소형 카잘체특이RNA17 | |
|---|---|
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| 식별자 | |
| 기호. | 스카나17 |
| Alt. 기호 | snoU12-22 |
| Rfam | RF00492 |
| 기타 데이터 | |
| RNA형 | 진, snRNA, snoRNA, scaRNA |
| 도메인 | 진핵생물 |
| 가세요 | GO:0006396 GO:0015030 GO:0005730 |
| 그렇게 | SO:0000275 |
| PDB 구조 | PDBe |
소형 카할 신체 특이 RNA 17(U12-22 scaRNA라고도 함)은 카할 신체에 국재하는 소형 핵 RNA의 한 종류로, 전사된 RNA 중합효소 II의 스플라이소좀 RNA U1, U2, U4, U5 및 U12의 [1][2]변형을 유도하기 위해 제안되었다.
완전한 인간 U12-22/U4-8 scaRNA는 2개의 탠덤 C/D 박스 도메인(Term U12-22 및 U4-8)으로 구성됩니다.5' 및 3' C/D 도메인은 각각 U12의 잔류 [1]U22와 U4 snRNA의 잔류 C8의 2'O-리보스 메틸화를 유도할 것으로 예상된다.이 패밀리는 3' C/D 박스는 Small Cajal body 특이 RNA 18로 나타나므로 5' C/D 박스 도메인(U12-22)만을 포함한다.3' C/D 도메인(U4-8)도 Darzacq에 의해 이전에 복제되어 U91로 [3]불렸으며, 이 snRNA의 더블렛(U12-22/U4-8)과 싱글렛(U4-8) 형태 모두 Hela 세포에서 정제되었다.[1] U12-22/U4-8 형태의 더블렛은 핵소체에 국재하는 것으로 나타났으며, U4-8 단일 도메인은 핵소체에 축적되는 것으로 보인다.[1] 인간에서 U12-88/U4-8의 게놈 위치는 유전자 간이며 정제된 전사물은 RNA 중합효소 [1]II에 의해 독립적으로 전사된다는 것을 암시하는 메틸화 구아노신 캡을 포함하는 것으로 나타났다.
레퍼런스
- ^ a b c d e Tycowski KT, Aab A, Steitz JA (November 2004). "Guide RNAs with 5' caps and novel box C/D snoRNA-like domains for modification of snRNAs in metazoa". Current Biology. 14 (22): 1985–95. doi:10.1016/j.cub.2004.11.003. PMID 15556860.
- ^ Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
- ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (June 2002). "Cajal body-specific small nuclear RNAs: a novel class of 2'-O-methylation and pseudouridylation guide RNAs". The EMBO Journal. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093/emboj/21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.
외부 링크
- Rfam의 작은 Cajal 신체 특이 RNA 17 페이지
