saRNA

saRNA

작은 활성화 RNA(saRNA)는 RNA 활성화(RNAa)로 알려진 과정에서 전사 유전자 활성화를 유도하기 위해 유전자 프로모터를 목표로 하는 작은 이중 가닥 RNA(dsRNA)이다.

작은 간섭 RNA(siRNA)와 마이크로RNA(miRNA)와 같은 작은 dsRNA는 RNA 간섭(RNAi)으로 알려진 진화적으로 보존된 메커니즘의 트리거로 알려져 있습니다.RNAi는 필연적으로 전사를 억제하기 위해 염색질의 리모델링을 통해 유전자 사일런트화를 유도하여 상보적인 mRNA를 분해하거나 단백질 번역을 차단한다.나중에 dsRNA가 전사를 활성화하는 작용도 할 수 있다는 것이 밝혀져 saRNA로 명명되었다. saRNA는 유전자 촉진제에서 선택된 배열을 대상으로 하여 전사/[1][2]후생유전자 수준에서 표적 유전자 발현을 유도한다.

saRNA는 일반적으로 길이가 21개의 뉴클레오티드이며, 각 가닥의 3' 끝에 2개의 뉴클레오티드가 돌출되어 있으며, 일반적인 siRNA와 동일한 구조이다.관심 유전자를 활성화시킬 수 있는 saRNA를 식별하기 위해서는 규칙 세트를[3][4] 따라 여러 saRNA를 1~2kb 프로모터 영역 내에서 설계하고 배양 세포에서 테스트해야 한다.일부 보고서에서, saRNA는 단백질 코딩 [5][6]유전자의 프로모터 배열과 겹치는 비코딩 전사를 목표로 하는 방식으로 설계된다.화학적으로 합성된 saRNA와 짧은 머리핀 RNA(shRNA)로 표현되는 saRNA는 모두 시험관내 생체내 실험에 사용되었다.

saRNA용 온라인 리소스(https://bioinfo.imtech.res.in/manojk/sarna/)가 개발되어 [7]공개되었습니다.

saRNA의 치료적 사용이 제안되었다.그들은 방광종양,[8] [9]간암,[11] 췌장암,[12] 발기부전 등을 치료하기 위해 동물모델로 실험되었다.

2016년에는 saRNA 약물인 MTL-CEBPA에 대한 진행성 간암환자가[13] 참여하는 임상 1상이 개시되었다.2021년 [14]완공을 목표로 하고 있다.

레퍼런스

  1. ^ Li, Long-Cheng; Okino, Steven T.; Zhao, Hong; Pookot, Deepa; Place, Robert F.; Urakami, Shinji; Enokida, Hideki; Dahiya, Rajvir (2006-11-14). "Small dsRNAs induce transcriptional activation in human cells". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103 (46): 17337–17342. Bibcode:2006PNAS..10317337L. doi:10.1073/pnas.0607015103. ISSN 0027-8424. PMC 1859931. PMID 17085592.
  2. ^ Janowski, Bethany A.; Younger, Scott T.; Hardy, Daniel B.; Ram, Rosalyn; Huffman, Kenneth E.; Corey, David R. (2007-03-01). "Activating gene expression in mammalian cells with promoter-targeted duplex RNAs". Nature Chemical Biology. 3 (3): 166–173. doi:10.1038/nchembio860. ISSN 1552-4450. PMID 17259978. S2CID 10716220.
  3. ^ Huang, Vera; Qin, Yi; Wang, Ji; Wang, Xiaoling; Place, Robert F.; Lin, Guiting; Lue, Tom F.; Li, Long-Cheng (2010-01-01). "RNAa is conserved in mammalian cells". PLOS ONE. 5 (1): e8848. Bibcode:2010PLoSO...5.8848H. doi:10.1371/journal.pone.0008848. ISSN 1932-6203. PMC 2809750. PMID 20107511.
  4. ^ Wang, Ji; Place, Robert F.; Portnoy, Victoria; Huang, Vera; Kang, Moo Rim; Kosaka, Mika; Ho, Maurice Kwok Chung; Li, Long-Cheng (2015-03-11). "Inducing gene expression by targeting promoter sequences using small activating RNAs". Journal of Biological Methods. 2 (1): 14. doi:10.14440/jbm.2015.39. ISSN 2326-9901. PMC 4379447. PMID 25839046.
  5. ^ Voutila, Jon; Sætrom, Pål; Mintz, Paul; Sun, Guihua; Alluin, Jessica; Rossi, John J; Habib, Nagy A; Kasahara, Noriyuki (2012-08-01). "Gene Expression Profile Changes After Short-activating RNA-mediated Induction of Endogenous Pluripotency Factors in Human Mesenchymal Stem Cells". Molecular Therapy: Nucleic Acids. 1 (8): e35. doi:10.1038/mtna.2012.20. ISSN 2162-2531. PMC 3437803. PMID 23344177.
  6. ^ Matsui, Masayuki; Chu, Yongjun; Zhang, Huiying; Gagnon, Keith T.; Shaikh, Sarfraz; Kuchimanchi, Satya; Manoharan, Muthiah; Corey, David R.; Janowski, Bethany A. (2013-12-01). "Promoter RNA links transcriptional regulation of inflammatory pathway genes". Nucleic Acids Research. 41 (22): 10086–10109. doi:10.1093/nar/gkt777. ISSN 1362-4962. PMC 3905862. PMID 23999091.
  7. ^ Dar, Showkat Ahmad; Kumar, Manoj (July 2018). "saRNAdb: Resource of Small Activating RNAs for Up-regulating the Gene Expression". Journal of Molecular Biology. 430 (15): 2212–2218. doi:10.1016/j.jmb.2018.03.023. PMID 29625201. S2CID 4936884.
  8. ^ Kang, Moo Rim; Yang, Glen; Place, Robert F.; Charisse, Klaus; Epstein-Barash, Hila; Manoharan, Muthiah; Li, Long-Cheng (2012-10-01). "Intravesical delivery of small activating RNA formulated into lipid nanoparticles inhibits orthotopic bladder tumor growth". Cancer Research. 72 (19): 5069–5079. doi:10.1158/0008-5472.CAN-12-1871. ISSN 1538-7445. PMID 22869584.
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  10. ^ Huan, Hongbo; Wen, Xudong; Chen, Xuejiao; Wu, Lili; Liu, Weihui; Habib, Nagy A.; Bie, Ping; Xia, Feng (2016-01-01). "C/EBPα Short-Activating RNA Suppresses Metastasis of Hepatocellular Carcinoma through Inhibiting EGFR/β-Catenin Signaling Mediated EMT". PLOS ONE. 11 (4): e0153117. Bibcode:2016PLoSO..1153117H. doi:10.1371/journal.pone.0153117. ISSN 1932-6203. PMC 4822802. PMID 27050434.
  11. ^ Yoon, Sorah; Huang, Kai-Wen; Reebye, Vikash; Mintz, Paul; Tien, Yu-Wen; Lai, Hong-Shiee; Sætrom, Pål; Reccia, Isabella; Swiderski, Piotr (2016-03-17). "Targeted Delivery of C/EBPα -saRNA by Pancreatic Ductal Adenocarcinoma-specific RNA Aptamers Inhibits Tumor Growth In Vivo". Molecular Therapy. 24 (6): 1106–16. doi:10.1038/mt.2016.60. ISSN 1525-0024. PMC 4923325. PMID 26983359.
  12. ^ Wang, Tao; Li, Mingchao; Yuan, Huixin; Zhan, Yin; Xu, Hua; Wang, Shaogang; Yang, Weiming; Liu, Jihong; Ye, Zhangqun (2013-08-01). "saRNA guided iNOS up-regulation improves erectile function of diabetic rats". The Journal of Urology. 190 (2): 790–798. doi:10.1016/j.juro.2013.03.043. ISSN 1527-3792. PMID 23523927.
  13. ^ "First-in-Human Safety and Tolerability Study of MTL-CEBPA in Patients With Advanced Liver Cancer - Full Text View - ClinicalTrials.gov". clinicaltrials.gov. Retrieved 2016-06-12.
  14. ^ Sarkar, Debashis; Plummer, Ruth; Meyer, Tim; Sodergren, Mikael H.; and 32 further, co-authors (2020). "MTL-CEBPA, a Small Activating RNA Therapeutic Upregulating C/EBP-α, in Patients with Advanced Liver Cancer: A First-in-Human, Multicenter, Open-Label, Phase I Trial". Clinical Cancer Research. 26 (15): 3936–3946. doi:10.1158/1078-0432.CCR-20-0414. PMID 32357963. Retrieved 29 January 2021.

추가 정보

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