SAM-IV 리보스위치
SAM-IV riboswitch |
| S-아데노실메티오닌(SAM) 리보스위치 | |
|---|---|
 | |
| 식별자 | |
| 기호. | SAM-IV |
| Rfam | RF00634 CL00012 |
| 기타 데이터 | |
| RNA형 | Cis-reg; 리보스위치 |
| 도메인 | 박테리아 |
| 그렇게 | 순서:0005836 |
| PDB 구조 | PDBe |
SAM-IV 리보스위치는 많은 메틸화 반응에 사용되는 보조인자 S-아데노실메티오닌(SAM)[1]과 특이적으로 결합하는 리보스위치의 일종이다.원래 생물정보학에 [2]의해 식별된 SAM-IV 리보스위치는 주로 박테리아의 한 목인 방선균류에 한정된다.SAM-IV 리보스위치의 보존된 특징과 실험은 SAM-I 리보스위치라고 불리는 다른 클래스의 SAM 결합 리보스위치와 유사한 SAM 결합 사이트를 공유한다는 것을 의미한다.그러나 이 두 가지 유형의 리보스위치의 발판은 상당히 다른 것으로 보입니다.이러한 리보스위치 유형 간의 구조적 관계가 [3][4]연구되었습니다.
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레퍼런스
- ^ Weinberg Z, Regulski EE, Hammond MC, et al. (2008). "The aptamer core of SAM-IV riboswitches mimics the ligand-binding site of SAM-I riboswitches". RNA. 14 (5): 822–828. doi:10.1261/rna.988608. PMC 2327355. PMID 18369181.
- ^ Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z, et al. (2007). "Identification of 22 candidate structured RNAs in bacteria using the CMfinder comparative genomics pipeline". Nucleic Acids Res. 35 (14): 4809–4819. doi:10.1093/nar/gkm487. PMC 1950547. PMID 17621584.
- ^ Trausch JJ, Xu Z, Edwards AL, Reyes FE, Ross PE, Knight R, Batey RT (May 2014). "Structural basis for diversity in the SAM clan of riboswitches". Proc Natl Acad Sci U S A. 111 (18): 6624–9. doi:10.1073/pnas.1312918111. PMC 4020084. PMID 24753586.
- ^ Zhang K, Li S, Kappel K, Pintilie G, Su Z, Mou TC, Schmid MF, Das R, Chiu W (December 2019). "Cryo-EM structure of a 40 kDa SAM-IV riboswitch RNA at 3.7 Å resolution". Nat Commun. 10 (1): 5511. doi:10.1038/s41467-019-13494-7. PMC 6890682. PMID 31796736.
외부 링크
