녹농균 클로로라피스

Pseudomonas chlororaphis
녹농균 클로로라피스
과학적 분류 edit
도메인: 박테리아
망울: 프로테오박테리아
클래스: 감마프로테오박테리아
순서: 녹모나스목
패밀리: 녹조마과
속: 녹모나스
종군: 녹농균 클로로라피스군
종:
P. 클로로라피스
이항식 이름
녹농균 클로로라피스
(Guignard and Saubageau 1894년)
베르게이 외 1930년
유형 변형률
ATCC 9446

CCUG 552 B
CFBP 2132
CIP 63.22
DSM 50083
HAMBI 2011
JCM 2778
LMG 5004
NBRC 3904
NCCB 76041 및 37027
NCTC 13002
VKM B-1246

동의어

바실러스 클로로라피스 기냐르와 쇼바게아우 1894

필로모나스 클로로라피스는 농업과 원예에서 토양 접종제로 쓰이는 세균이다. 페나진 형태의 항생제 생산을 통해 특정 곰팡이 식물 병원균에 대한 바이오콘트롤제 역할을 할 수 있다.[1] 16S rRNA 분석에 기초해 비슷한 종을 집단에 배치했다.[2]

2020년 비교 유전체학 및 계통생성 연구에서는 전체 녹농균에서 494개의 완전한 게놈을 분석했는데, 그 중 43개가 P. 클로로라피스 변종이다.[3] 본 연구에서 P. 클로로라피스의 종은 그 유일성과 평균 뉴클레오티드 아이덴티티의 기준에 기초하여 결정되었다. 이 종은 더 넓은 P. 형광종 콤플렉스 안에 있다.[3][4][5] 이 종의 변종의 단백질 수와 GC 함량은 각각 5599–6401(평균: 6076)과 61.9–64%(평균: 62.8%) 사이였다.[3] 또한 43 P. 클로로라피스 프로테오메트에는 3587개의 핵심 단백질이 들어 있었으며(종의 모든 변종에서 공유됨), 11개의 핵심 단백질은 그 그룹에 특정되어 있어서 필로모나스속 다른 모든 변종에 존재하지 않았다.[3] 이러한 11개 집단 고유의 핵심 단백질 중 2개는 홀린 계열 박테리오신과 미토마이신 유사 생합성 단백질이며 다른 뿌리-콜로나이저에 대해 경쟁적 우위를 부여할 수 있다.[3]

필로모나스 클로로라피스군

Phyomonas cloraphis는 그것의 이름을 Phyomonas속 내의 하위그룹에 빌려준다. P. clororaphis 하위 그룹의 다른 멤버는 P. aurantiaca, P. aureofaciens, P. fragi, P. lundensis, P. taetrolens이다.[2]

참조

  1. ^ Chin-A-Woeng TF, et al. (2000). "Root colonization by phenazine-1-carboxamide-producing bacterium Pseudomonas chlororaphis PCL1391 is essential for biocontrol of tomato foot and root rot". Mol Plant Microbe Interact. 13 (12): 1340–5. doi:10.1094/MPMI.2000.13.12.1340. PMID 11106026.
  2. ^ a b Anzai; Kim, H; Park, JY; Wakabayashi, H; Oyaizu, H; et al. (Jul 2000). "Phylogenetic affiliation of the pseudomonads based on 16S rRNA sequence". Int J Syst Evol Microbiol. 50 (4): 1563–89. doi:10.1099/00207713-50-4-1563. PMID 10939664.
  3. ^ a b c d e Nikolaidis, Marios; Mossialos, Dimitris; Oliver, Stephen G.; Amoutzias, Grigorios D. (2020-07-24). "Comparative Analysis of the Core Proteomes among the Pseudomonas Major Evolutionary Groups Reveals Species-Specific Adaptations for Pseudomonas aeruginosa and Pseudomonas chlororaphis". Diversity. 12 (8): 289. doi:10.3390/d12080289. ISSN 1424-2818.
  4. ^ Mulet, Magdalena; Lalucat, Jorge; García-Valdés, Elena (March 2010). "DNA sequence-based analysis of the Pseudomonas species". Environmental Microbiology. 12 (6): 1513–1530. doi:10.1111/j.1462-2920.2010.02181.x. PMID 20192968.
  5. ^ Scales, Brittan S.; Dickson, Robert P.; LiPuma, John J.; Huffnagle, Gary B. (October 2014). "Microbiology, Genomics, and Clinical Significance of the Pseudomonas fluorescens Species Complex, an Unappreciated Colonizer of Humans". Clinical Microbiology Reviews. 27 (4): 927–948. doi:10.1128/CMR.00044-14. ISSN 0893-8512. PMC 4187640. PMID 25278578.

외부 링크


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