폴리토미
Polytomy |
계통수의 내부 노드를 (i) 뿌리나무에 있고 (ii) 뿌리나무에 있으며, (ii) 뿌리나무에 있으며, (ii) 뿌리나무에 있으며, 4개 이상의 [1][2]가지에 부착되어 있는 경우, 폴리토미 /pɪlət/mi/ 또는 다분화라고 한다.멀티퍼케이션을 포함하는 트리는 멀티퍼큐레이션트리로 설명할 수 있습니다.
연질 폴리토미 vs 경질 폴리토미
폴립토미에는 부드러운 폴립토미와 단단한 [3][4]폴립토미의 두 종류가 있습니다.
연질 폴리토미는 계통 발생 정보가 불충분한 결과이다. 혈통은 서로 다르지만, 즉 이러한 혈통 중 일부는 다른 혈통보다 더 가까운 친척이며, 이용 가능한 데이터는 이를 인식할 수 없다.대부분의 폴리토미는 부드러우며, 더 나은 데이터를 사용할 [5]수 있다면 이분법의 전형적인 트리로 분해될 것이다.
반면 하드 폴리티토미는 세 개 이상의 혈통으로 이루어진 진정한 발산 현상을 나타낸다.
적용들
다지절제술에 대한 해석은 계통수에 나타나는 개인에 따라 다르다.
종다세포종
계통수의 계통이 종(種)을 나타내는 경우, 폴리토미는 3종 이상의 동시 종([6]種)을 나타낸다.예를 들어 급속히 범위를 넓히거나 매우 범독성이 강한 종이 다른 지역에서 주변 분화를 겪는 등 특정 상황에서 흔할 수 있다.
한 예로 드로소필라 시물란 종 콤플렉스를 들 수 있다.여기서, 조상은 동시에 두 개의 섬을 식민지로 만들었지만 독립적으로 두 개의 동등하게 오래되었지만 서로 다르게 진화한 딸 종을 만들어 낸 것으로 보인다.
분자 폴리토미
특정 유전자의 DNA 배열 데이터에서 계통수를 재구성하면 3개 이상의 표본 유전자가 조상 유기체의 단일 유전자로 조상을 추적했을 때 경질 다지절제술이 발생한다.이와는 대조적으로, 연성 다지절제술은 유한한 시간 지속시간을 가진 유전자 나무의 가지에서 유래하지만 치환이 [7]일어나지 않았다.
경질 폴리토미 인식
| 이 섹션은 어떠한 출처도 인용하지 않습니다.(2019년 11월 (이 및 ) |
DNA 염기서열 진화는 보통 복잡한 표현형 특성들의 진화보다 훨씬 더 빠르기 때문에, 유전자 계통이 서로 짧은 시간 동안 갈라지는 반면, 전체 조상 집단을 고려한다면 실제 유기체는 변하지 않을 수도 있다.개체군의 어떤 개체군이 유전적으로 유사하다면, 특히 혈통 분류가 광범위하게 진행되지 않았다면, 단단한 폴리토미는 각 개별 유기체의 전체 게놈을 고려한다면 실제로 희귀하거나 존재하지 않을 수 있지만, 전체 종이 유전적인 수준이라면 오히려 개체군에 널리 퍼질 수 있다.이종 교배 개체군으로 간주됩니다(종 개념 참조).
"동시에 발생하는 특정 또는 계통 발산 사건"은 세대 단위로 측정된 진화 시간을 의미한다. 이는 새로운 특성(예: 생식계점 돌연변이)이 전달될 수 있는 유일한 수단이기 때문이다.실제로 경질 폴리토미아와 연질 폴리토미아를 구별하는 능력은 제한되어 있다.예를 들어, 백만 년 당 약 1%의 돌연변이 DNA 배열의 킬로베이스가 분석되면, 같은 10만 년 이내에 같은 조상으로부터 갈라진 혈통은 어느 것이 먼저 갈라졌는지 확실하게 구별할 수 없다.
창시자 효과와 유전적 표류는 다른 진화의 속도를 초래할 수 있다.이는 분자시계 알고리즘을 쉽게 혼동하여 단단한 폴리토미(polytomies)를 인식할 수 없게 한다.
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ Hancock, John M.; Zvelebil, Marketa J., eds. (2004-07-15). Dictionary of Bioinformatics and Computational Biology. Hoboken, NJ, USA: John Wiley & Sons, Inc. doi:10.1002/0471650129. ISBN 978-0-471-65012-6.
- ^ Drummond, Alexei J.; Bouckaert, Remco R. (2015). Bayesian Evolutionary Analysis with BEAST. Cambridge: Cambridge University Press. doi:10.1017/cbo9781139095112. ISBN 978-1-139-09511-2.
- ^ Purvis, A.와 T. Garland, Jr. 1993.연속형 문자의 비교 분석에서의 폴리토미.계통생물학 42:569~575.
- ^ Slowinski, Joseph B. (2001-04-01). "Molecular Polytomies". Molecular Phylogenetics and Evolution. 19 (1): 114–120. doi:10.1006/mpev.2000.0897. ISSN 1055-7903. PMID 11286496.
- ^ "Reading trees: Phylogenetic pitchforks". University of California at Berkeley. Retrieved 6 November 2016.
- ^ "Reading trees: Phylogenetic pitchforks". evolution.berkeley.edu. Retrieved 2020-03-27.
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