포시다
Phosida | |
|---|---|
| 내용 | |
| 설명 | 변환 후 수정 데이터베이스. |
| 연락처 | |
| 리서치센터 | Max-Planck-Institute for 생화학 |
| 실험실 | 프로테오믹스 및 신호 전달학과 |
| 작가들 | 플로리안 그나드 |
| 1차 인용 | Gnad & al. (2011년)[1] |
| 출시일자 | 2009 |
| 접근 | |
| 웹사이트 | http://www.phosida.com |
PHOsphorylation SIte DAtabase PHOSIDA는 질량 분광 기술을 기반으로 다양한 종에서 식별된 생체 인산염에 대한 수천 개의 높은 신뢰도를 통합한다.각 인산염에 대해 PHOSIDA는 일치하는 키나아제 모티브, 예측된 이차 구조, 보존 패턴 및 자극에 대한 동적 규제 또는 키나아제 억제와 같은 다른 치료법을 나열한다.사람, 효모 등 진핵생물부터 대장균, 락토코커스 락티스 등 박테리아까지 다양한 생물의 인산단백질을 포함한다.심지어 고고학적 유기체의 인지질, 즉 할로박테리움 살리나륨도 이용할 수 있다.대표적으로 계통생식수(Phylogenetic Tree)를 덮고 있는 유기체에서 확인된 인산단백질의 통합은 적시에 보존과 진화보존을 포함한 세계적 관점에서 인산화 사건을 조사할 수 있게 한다.[1]
게다가 PHOSIDA는 지지 벡터 기계에 기초하여 인산염도 예측한다.
참조
- ^ a b Gnad, Florian; Gunawardena Jeremy; Mann Matthias (Jan 2011). "PHOSIDA 2011: the posttranslational modification database". Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D253-60. doi:10.1093/nar/gkq1159. PMC 3013726. PMID 21081558.
