Neurolex
NeuroLex |
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|---|---|
| 내용 | |
| 묘사 | 시멘틱 위키의 신경과학 용어 동적 사전 |
| 데이터형 발동. | 신경과학 |
| 연락 | |
| 작가들 | 메리안 마르톤, 스티븐 라슨 외 |
| 접근 | |
| 웹 사이트 | https://scicrunch.org/scicrunch/interlex/dashboard |
| 여러가지 종류의 | |
| 면허증. |  Creative Commons Attribution 3.0 미리포트 라이선스 |
NeuroLex는 신경과학 [1]개념의 사전입니다.시멘틱 미디어 위키를 사용하여 시멘틱 위키로 구성되어 있습니다.NeuroLex는 NeuroScience Information Framework 프로젝트에서 지원됩니다.
개요
NeuroLex는 NIF와 같은 정보 시스템이 분산된 리소스 간에 발생하는 데이터를 보다 쉽게 검색 및 통합할 수 있도록 신경과학자의 작업 커뮤니케이션 방식을 개선하는 것을 목적으로 합니다.신경과학에서 데이터 통합의 큰 걸림돌 중 하나는 데이터베이스 및 기타 문헌에서 일관되지 않은 용어 사용입니다.예를 들어, 세 개의 데이터베이스가 피질에서 발현되는 유전자에 대한 정보를 가지고 있지만, 모두 대뇌 피질의 다른 정의를 사용한다면, 그것들을 쉽게 비교할 수 없다.
신경과학 정보 프레임워크 내에서의 이용
NIF를 사용하면 오픈 소스 네트워크 환경을 통해 전 세계 공공 연구 데이터와 도구에 대한 검색 및 액세스를 할 수 있습니다.NIH의 신경과학 연구 [2]청사진의 자금 지원을 받는 NIF를 통해 과학자와 학생은 실험, 임상 및 번역 신경과학 데이터베이스에서 지식 기반, 지도 및 유전자/유전자원에 이르기까지 기존의 경계를 넘어서는 글로벌 신경과학 웹 자원을 발견할 수 있습니다.
NIF는 신경과학에 관련된 보다 집중적인 리소스 집합, 필드에 맞춘 검색 전략 및 웹 검색 엔진에서 전통적으로 "숨겨진" 컨텐츠에 대한 액세스를 제공합니다.프레임워크는 신경과학 데이터베이스 목록으로, 생물의학 용어 통합 시스템(NeuroLex)에 주석을 달고 통합됩니다.NIF는 생물학적 구조의 여러 척도와 생물학적 기능의 여러 수준에 걸쳐 개념 기반 쿼리를 지원하므로 결과를 더 쉽게 검색하고 이해할 수 있습니다.
NIF의 일부로서 신경과학 정보와 데이터의 다양한 소스에 대한 검색 인터페이스가 제공됩니다.이 검색을 보다 효과적으로 하기 위해, NIF는 신경과학 개념을 범주 계층으로 구성하는데 도움을 주는 온톨로지를 구축하고 있다. 예를 들어 뉴런은 세포라고 말한다.이를 통해 사용자는 보다 효과적인 검색을 수행하고 반환되는 정보를 정리하고 이해할 수 있습니다.그러나 이 활동의 중요한 부가적인 부분은 데이터를 설명하는 데 사용되는 모든 용어를 명확하게 정의하는 것입니다.
콘텐츠
NeuroLex의 초기 엔트리는 이전의 어휘 BIRNLex를 포함하는 NIFSTD 온톨로지로부터 구축되었다.그것은 현재 전체 해부학, 신경계의 세포, 세포하 구조, 질병, 기능 및 기술을 포괄하는 개념을 포함하고 있다.NIF는 더 많은 콘텐츠를 추가하고 거기에 있는 것을 수정하기 위해 커뮤니티의 입력을 요구하고 있다.
「 」를 참조해 주세요.
주 및 참고 자료
- ^ 이 문서의 첫 번째 내용은 Creative Commons Attribution License에 따라 라이선스가 부여된 NeuroLex 프로젝트에서 수정되었습니다.
- ^ 신경과학 연구를 위한 NIH 청사진은 신경과학 연구를 지원하는 16개 NIH 연구소, 센터 및 사무실 간의 협력적인 노력입니다.자원과 전문지식을 통합함으로써 이 청사진은 기초연구와 임상연구 모두에서 신경과학자를 지원하는 새로운 도구, 훈련 기회 및 기타 자원의 개발을 지원합니다.Wayback Machine에서 아카이브된 Blueprint 2009-01-30에 대한 자세한 내용을 읽어 보십시오.
추가 정보
NIF는 2008년 9월에 발행된 Neuro Informatics의 특별호에 실렸다.
- Bug WJ, Ascoli GA, Grethe JS, Gupta A, Fennema-Notestine C, Laird AR, Larson SD, Rubin D, Shepherd GM, Turner JA, Martone ME (September 2008). "The NIFSTD and BIRNLex vocabularies: building comprehensive ontologies for neuroscience". Neuroinformatics. 6 (3): 175–94. doi:10.1007/s12021-008-9032-z. PMC 2743139. PMID 18975148. Archived from the original on February 12, 2009.
- Gardner D, Akil H, Ascoli GA, Bowden DM, Bug W, Donohue DE, Goldberg DH, Grafstein B, Grethe JS, Gupta A, Halavi M, Kennedy DN, Marenco L, Martone ME, Miller PL, Müller HM, Robert A, Shepherd GM, Sternberg PW, Van Essen DC, Williams RW (September 2008). "The neuroscience information framework: a data and knowledge environment for neuroscience". Neuroinformatics. 6 (3): 149–60. doi:10.1007/s12021-008-9024-z. PMC 2661130. PMID 18946742.
- Gardner D, Goldberg DH, Grafstein B, Robert A, Gardner EP (September 2008). "Terminology for neuroscience data discovery: multi-tree syntax and investigator-derived semantics". Neuroinformatics. 6 (3): 161–74. doi:10.1007/s12021-008-9029-7. PMC 2663521. PMID 18958630.
- Gupta A, Bug W, Marenco L, Qian X, Condit C, Rangarajan A, Müller HM, Miller PL, Sanders B, Grethe JS, Astakhov V, Shepherd G, Sternberg PW, Martone ME (September 2008). "Federated access to heterogeneous information resources in the Neuroscience Information Framework (NIF)". Neuroinformatics. 6 (3): 205–17. doi:10.1007/s12021-008-9033-y. PMC 2689790. PMID 18958629.
- Halavi M, Polavaram S, Donohue DE, Hamilton G, Hoyt J, Smith KP, Ascoli GA (September 2008). "NeuroMorpho.Org implementation of digital neuroscience: dense coverage and integration with the NIF". Neuroinformatics. 6 (3): 241–52. doi:10.1007/s12021-008-9030-1. PMC 2655120. PMID 18949582.
- Marenco L, Ascoli GA, Martone ME, Shepherd GM, Miller PL (September 2008). "The NIF LinkOut broker: a web resource to facilitate federated data integration using NCBI identifiers". Neuroinformatics. 6 (3): 219–27. doi:10.1007/s12021-008-9025-y. PMC 2704600. PMID 18975149.
- Marenco L, Li Y, Martone ME, Sternberg PW, Shepherd GM, Miller PL (September 2008). "Issues in the design of a pilot concept-based query interface for the neuroinformatics information framework". Neuroinformatics. 6 (3): 229–39. doi:10.1007/s12021-008-9035-9. PMC 2664632. PMID 18953674.
- Müller HM, Rangarajan A, Teal TK, Sternberg PW (September 2008). "Textpresso for neuroscience: searching the full text of thousands of neuroscience research papers". Neuroinformatics. 6 (3): 195–204. doi:10.1007/s12021-008-9031-0. PMC 2666735. PMID 18949581.
