레구메 정보 시스템

레구메 정보 시스템(LIS)은 레구메 사육자와 연구자를 위한 레구메 과학 포털로 미국 농무부의 농업 연구 서비스에서 설립 및 지원한다.레구메 정보 시스템의 임무는 "레구미에서 발견과 농작물 개선을 촉진하는 것"이며, 특히 농작물의 수확량, 영양적 가치, 그리고 기본적인 레구메 과학에 대한 우리의 이해도를 향상시키는 것이다.null

레구메 정보 시스템 개발은 국립 게놈자원센터(NCGR)와 아이오와 주립대 USDA-ARS가 합작한 사업이다.2014년에 LIS에 대한 개발 노력은 comparative-legumes.org 도메인에서 legumeinfo.org으로 바뀌었다.비교레거스 사이트는 Ruby on Rails 프레임워크와 Legume을 사용하여 개발되었다.정보 사이트는 트립탈 콘텐츠 관리 시스템을 이용하여 개발된다.null

고아종 연구의 중추로서의 참조종

LIS에서 취해진 근본적인 접근방식은 참조 종을 위해 개발된 보다 광범위한 지식을 활용하여 고아 종에 대한 연구를 용이하게 하는 것이다.예를 들어, 동기화 및 국소 유사성의 사용은 특성 추론의 근거를 제공한다.null

참조종

LIS는 가능한 한 종을 식별하기 위해 유니프로트 유기체 연상제를 사용한다는 점에 유의한다.null

현재의 레구메 참조종(모델 유기체라고도 함)은 다음과 같다.

• 글리신 맥스(소이빈), 글리마
• 연꽃자포니쿠스(lotus), LOTJA
• Medicago trumcatula(바렐 메디컬), MEDTR
• 위상낭콩, PHAVU

고아종

LIS에서 대표되는 고아 종은 다음과 같다.

• 아라키스 두라넨시스(야생 땅콩), ARADU
• Arachis ipaensis(야생 땅콩), ARAIP
• 아라키스 하이포게아(피넛), ARAHY
• Cajanus cajan (피곤 pea), CAJCA
• Chamaecrista passiculata(partidge pea), CHAFS
• CICAR, Cicer arrietinum (chickpea), CICAR
• 렌즈 컬리나리스(렌틸), LENCU
• Lupinus albus(흰색 루핀), LUPAL
• 루피누스 앙구스티폴리오스(나래잎 루팡), 루판
• Medicago sativa (alfa), MEDSA
• 피섬새티붐(가든페아), 피사
• 트라이폴륨 프라텐스(빨간 클로버), TRIPR
• 트라이폴륨 리펜스(흰 클로버), TRIRE
• 비시아 파바(파바콩), VICFA
• 비그나 앵글리스(adzuki bean), VIGAN
• Vigna unguiculata(cowpea), VIGUN

참고 항목

• 콩과류
• 펄스

외부 링크

• Regume Information System의 홈 페이지.
• Gonzales, MD; Gajendran, K; Farmer, AD; Archuleta, E; Beavis, WD (2007). "Leveraging model legume information to find candidate genes for soybean sudden death syndrome using the legume information system". Plant Bioinformatics. Methods in Molecular Biology. Vol. 406. pp. 245–59. doi:10.1007/978-1-59745-535-0_11. ISBN 978-1-58829-653-5. PMID 18287696.
• Gonzales, M. D.; Archuleta, E; Farmer, A; Gajendran, K; Grant, D; Shoemaker, R; Beavis, WD; Waugh, ME (2004). "The Legume Information System (LIS): An integrated information resource for comparative legume biology". Nucleic Acids Research. 33 (Database issue): D660–5. doi:10.1093/nar/gki128. PMC 540082. PMID 15608283.
• Dash, S.; Campbell, J.D.; Cannon, E.K.S.; Cleary, A.M.; Huang, W.; Kalberr, S.R.; Karingula, V.; Rice, A.G.; Singh, J.; Umale, P.;몇 주 동안, N.T.; 윌키, AP.; 파머스, AP.; 캐넌, S.B. (2016)Regume 정보 시스템(LegumeInfo.org): Regume 제품군 Nucleic Acids Research 44(Database 문제):D1181-D1188. doi:10.1093/nar/gkv1159 PMC4702835