Lar1

Lar1

LAR1('Licen-Associated Rhizobiales 1')은 [1]지의류와 직접 관련되어 가장 자주 발견되는 균류(Hyphomicrobiales, 이전의 Rhizobiales)목의 특정 세균 계통을 말한다.

이 혈통은 현재 녹색-조류 광합성 파트너(시아노박테리아 파트너와 반대)와 레카노로균류(다른 균류 그룹은 아직 조사되지 않았지만)의 곰팡이 파트너를 가진 이끼와 관련이 있는 것으로 알려져 있다.이 혈통은 특별히 테스트된 모든 녹색 조류 지의류(모두 북미산)와 관련하여 문서화되어 있으며, 남극 [2]지의류에서 파생된 시퀀스 라이브러리에서도 발견되었다.이 혈통이 차지하는 특정한 생태적 틈새들은 녹색 조류 지의류 탈리에 풍부하지만 다른 환경에서는 더 드문 특정 영양소에 의존할 수 있다는 것을 보여준다.

질소 고정

LAR1 계통은 현재 실험실에서 배양되지 않은 상태로 남아 있기 때문에 16S rRNA 유전자 배열만을 기반으로 정의되어 있다.배양에 대한 저항에도 불구하고, 정황 증거를 통해 적어도 하나의 잠재적으로 중요한 대사 기능을 추론할 수 있다: 질소 고정.질소는 모든 생물학적 시스템에 의해 성장에 필요하지만, 일반적으로 높은 활성화 에너지 때문에 생물학적으로 접근하기 어렵기 때문에, 많은 진핵생물들은 질소 고정(디질소 가스를 쉽게 [3]동화되는 분자 형태로 변환)이 가능한 특수 박테리아와 관계를 확립했다.

많은 이끼들은 영양분이 극히 부족한 환경에서 자라며 [4]생존하기 위해 충분한 분자 질소를 공급하기 위해 질소를 고정하는 박테리아에 의존할 수 있다.녹색 조류 지의류와 연관된 미생물들이 질소를 [5][6][7][8]풍부하게 고정시킬 수 있는 잠재력을 가지고 있다는 것이 수많은 연구자들에 의해 입증되었다.

그러나 이러한 연구의 거의 대부분은 배양 기반 방법에만 의존하여 가장 풍부하거나 중요한 질소 고정제가 무엇인지에 대한 부정확한 그림을 제공할 수 있다.이끼에 대한 독립적인 연구는 질소 고정과 관련된 1차 유전자인 nifH의 존재를 검출하기 위해 배양 없는 기술을 사용했으며 LAR1 [1][9]혈통과 동일한 계통발생학적 친화성을 공유하는 배열을 밝혀냈다.

그러나 환경 시료에서 발견되는 세균의 다양성, 박테리아에서 수평 유전자 이동이 일어나는 빈도, 생리학적 연구 부족으로 인해 이 배양되지 않은 계통의 대사 활성에 대한 결정적인 진술은 현 시점에서 불가능하다.

레퍼런스

  1. ^ a b Hodkinson BP, Lutzoni F (2009). "A microbiotic survey of lichen-associated bacteria reveals a new lineage from the Rhizobiales" (PDF). Symbiosis. 49 (3): 163–180. doi:10.1007/s13199-009-0049-3. S2CID 4129219. Archived from the original (PDF) on 2012-10-17. Retrieved 2009-12-09.
  2. ^ De la Torre JR, Goebel BM, Friedmann EI, Pace, NR (2003). "Microbial Diversity of Cryptoendolithic Communities from the McMurdo Dry Valleys, Antarctica". Applied and Environmental Microbiology. 69 (7): 3858–3867. doi:10.1128/AEM.69.7.3858-3867.2003. PMC 165166. PMID 12839754.{{cite journal}}: CS1 maint: 여러 이름: 작성자 목록(링크)
  3. ^ Cabello P, Roldán MD, Moreno-Vivián C (November 2004). "Nitrate reduction and the nitrogen cycle in archaea". Microbiology. 150 (Pt 11): 3527–46. doi:10.1099/mic.0.27303-0. PMID 15528644.
  4. ^ Brodo, IM (1973). "Substrate ecology". In: The Lichens. Ahmadjihan V, Hale ME, Eds. Academic Press, New York and London: 401–441.
  5. ^ Henckel, P. A.; T. T. Plotnikova (1973). "[Nitrogen-fixing bacteria in lichens]". Izvestiya Akademii Nauk SSSR. Seriya Biologicheskaya (in Russian). 6: 807–813.
  6. ^ Krasil’nikov NA (1949). "Is Azotobacter present in lichens?". Mikrobiologiia. 18: 3.
  7. ^ Lambright, DD Kapustka, LA (1981). "The association of N2-fixing bacteria with Dermatocarpon miniatum and Lepraria sp". Botanical Society of America: Miscellaneous Serial Publication. 160: 5.{{cite journal}}: CS1 maint: 여러 이름: 작성자 목록(링크)
  8. ^ Liba CM, Ferrara FI, Manfio GP, Fantinatti-Garboggini F, Albuquerque RC, Pavan C, Ramos PL, Moreira CA, Barbosa HR (2006). "Nitrogen-fixing chemo-organotrophic bacteria isolated from cyanobacteria-deprived lichens and their ability to solubilize phosphate and to release amino acids and phytohormones". Journal of Applied Microbiology. 101 (5): 1076–1086. doi:10.1111/j.1365-2672.2006.03010.x. PMID 17040231.
  9. ^ Grube M, Cardinale M, Vieira de Castro J, Müller H, Berg G (2009). "Species-specific structural and functional diversity of bacterial communities in lichen symbiosis". The ISME Journal. 3 (9): 1105–1115. doi:10.1038/ismej.2009.63. PMID 19554038.