호세 V. 로페즈

Jose V. Lopez
호세 V. 로페즈
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학력
모교조지아 공대
플로리다 주립 대학교
조지 메이슨 대학교
논문(1995)
박사 어드바이저스티븐 J. 오브라이언
영향찰스 다윈, 앨런 왓츠, 헨리 데이비드 소로/월든, 린 마굴리스, 벤자민 프랭클린
학술적인 일
기관스미스소니언 협회
하버브런치 해양학 협회
주요 관심사진화, 유전체학, 공생, 계통학 미생물학,
주목할 만한 아이디어미토콘드리아 DNA 전이

호세 V. 로페즈는 미국계 필리핀인 분자생물학자이다.그는 2007년부터 Dania Beach FL에 있는 Nova Southistn University(NSU)[1]에서 생물학과 교수로 재직하고 있습니다.Lopez는 Global Perpetchimal Genomics Alliance(GIGA) 과학자들의 공동체를 설립하고 Porifera Tree of Life and Earth Microbiom Projects에 참여했습니다.

교육

로페즈는 조지아 [citation needed]공과대학에서 학사 학위를 취득했다.그 후, 플로리다 주립 대학에서[citation needed] 분자 생물학에 초점을 맞춘 이학 석사 학위를 취득하고, 페어팩스에 있는 조지 메이슨 대학에서 환경 생물학 및 공공 정책 박사 학위를 취득했습니다.그의 박사학위 논문은 고양이의 핵에 대한 미토콘드리아 DNA의 전이를 특징짓는 것과 NUMT(핵미토콘드리아 DNA)를 일반적인 진화 유전체 [2]현상으로 명명하는 것을 포함했다.후속 연구는 공생과 해양생물학 연구에 분자 유전학을 적용하는 것을 포함했다(예: 산호와 스폰지).

직업

로페즈는 파나마 스미스소니언 열대연구소의 Orbicella(옛 몬타스트레이아) 고리형 산호 형제종 콤플렉스, Ft Pierc의 하버브런치 해양연구소 셜리 퐁포니와의 해양 스폰지 유전학 등 박사 후 예약에 분자 진화 훈련을 적용했다.e.[citation needed] 후자는 그가 Johnson Sea-Link 잠수 기술을 사용하여 심해 해면과 산호를 조사할 수 있도록 했다.로페즈의 해양 스폰지 연구는 체인지시즈 [3]TV의 사우스플로리다 PBS 다큐멘터리 "스폰지: 그들은 바다에서 가장 나이가 많은 동물인가?"에 실렸다.NSU의 Halmos College of Natural Sciences and Oceanography에 있는 동안, 그의 연구실은 해양 무척추동물-미생물 공생,[4] 미생물 생태학,[5][6] 유전학, 법의학, 석유 노출 생물의 메타게노믹스, 보존 유전학[7] 및 계통학/유전학에서 다양한 특정 질문에 대처하기 위해 유전학 도구를 적용했습니다.로페즈는 해양생물학자 트레이시 T가 이끄는 멕시코만의 딥 펠라직 네크톤 다이내믹스(DEPEND) 컨소시엄의 일원이었다.Deepwater Horizon 기름 유출 사고 이후 멕시코만에서 먹이 거미줄과 원양 미생물의 분포를 더 잘 이해하기 위해 Sutton.로페즈는 2008년부터 유전 저널의 부편집장으로 재직하고 있다.2018년에는 NSU 총장의 우수교수상을 수상했다.[8]

Lopez는 해양 및 수중 무척추동물의 [9]유전체학에 대한 연구와 학생 훈련을 촉진하기 위해 Global Peppetchimal Genomics Alliance(GIGA)를 공동 설립했습니다.유전학자 스티븐 오브라이언과 초기 협의를 거쳐 2013년 [10]Genetomes10K라는 첫 번째 전체 게놈 배열 프로젝트의 성공을 보고 로페즈는 GIGA를 결성했습니다.이것은 주로 그 개념을 지지하는 무척추동물 생물학자들의 다양한 커뮤니티에 접근하는 것을 포함했다.미국 유전학 협회가 처녀 워크숍을 위한 자금 지원을 제공했습니다.GIGA는 주로 수생동물에 초점을 맞추고 있지만, 대형 무척추동물 컨소시엄인 곤충5K(i5K)[11]와 유사한 문제(상대적으로 접근이 불가능한 작은 개체, 염기서열 분석을 위한 낮은 입력 DNA)가 있다.GIGA와 i5K는 현재 150만 개의 진핵생물의 전체 게놈 배열을 분석하기 위해 2018년 12월에 시작된 지구 바이오 유전자 프로젝트(EBP)[12]의 일환으로 "네트워크 네트워크"를 구성하는 데 도움을 주고 있습니다.

잘 알려진 [13]공생 외에도, 로페즈는 처음에 스폰지 마이크로바이옴이 필터 공급원이기 때문에 스폰지 마이크로바이옴이 가까운 바닷물 환경에서 지역사회를 위한 지표가 될 수 있다는 가설을 세웠다.이 가설은 나중에 부분적으로만 옳다는 것이 입증되었습니다(스펀지의 높은 미생물량과 낮은 미생물량 분류 - HMA, LMA 참조). 많은 스펀지 종이 자신의 적응된 공생체를 가지고 있다는 증거가 증가하고 있습니다.그럼에도 불구하고, 로페즈는 Woese의 혁명에서 생겨난 배양에 의존하지 않는 분자 도구를 rRNA 기반의 박테리아 [14]체계학에서 적용했다.결국 분자 기반 식별은 수질을 예측하는 지표, 가능한 법의학적 도구로서의 인간의 피부 마이크로바이옴, 장수에 대한 잠재적인 마이크로바이옴 효과를 테스트하기 위한 Myotis batt의 배설물, 그리고 플로리다의 Okechobe 호수 유역까지 확장되었습니다.

사생활

로페즈의 부모는 필리핀 대학 졸업생, 임상 병리학자 에르네스토 G.와 로사리오 로페즈로 이들은 뉴욕에서 [15]처음 만났다.그는 플랜테이션 [citation needed]FL의 에이미 도일과 결혼했다.

레퍼런스

  1. ^ "Halmos College of Natural Sciences and Oceanography at NSU". cnso.nova.edu. Retrieved 2019-03-01.
  2. ^ Lopez, J. V.; Yuhki, N.; Masuda, R.; Modi, W.; O'Brien, S. J. (1994). "Numt, a recent transfer and tandem amplification of mitochondrial DNA to the nuclear genome of the domestic cat". Journal of Molecular Evolution. 39 (2): 174–90. doi:10.1007/BF00163806 (inactive 28 February 2022). PMID 7932781.{{cite journal}}: CS1 유지 : 2022년 2월 현재 DOI 비활성화 (링크)
  3. ^ "ChangingSeas.TV Sponge documentary (episode 801)". www.changingseas.tv/.
  4. ^ Thomas, Torsten (2016). "The Global Sponge Microbiome: Symbiosis Insights Derived From A Basal Metazoan Phylum". Nature Communications. 7 (11870): 11870. doi:10.1038/ncomms11870. PMC 4912640. PMID 27306690.
  5. ^ Campbell, Alexandra; Fleisher, Jay; Sinigalliano, Christopher; White, James; Lopez, Jose (2015). "Dynamics of marine bacterial community diversity of the coastal waters of the reefs, inlets, and wastewater outfalls of Southeast Florida". MicrobiologyOpen. 4 (3): 390–408. doi:10.1002/mbo3.245. PMC 4475383. PMID 25740409.
  6. ^ O'Connell, Lauren; Gao, Song; Fleisher, Jay; Lopez, Jose (2018). "Fine Grained Compositional Analysis of Port Everglades Inlet Microbiome Using High Throughput DNA Sequencing". PeerJ. 6: e4671. doi:10.7717/peerj.4671. PMC 5947159. PMID 29761039.
  7. ^ Lopez, Jose; Kamel, Bishoy; Medina, Monica; Collins, Timothy; Baums, Illiana (2019). "Multiple Facets of Marine Invertebrate Conservation Genomics. Annual Review of Animal Biosciences". Annual Review of Animal Biosciences. 7: 473–497. doi:10.1146/annurev-animal-020518-115034. PMID 30485758. S2CID 54103492.
  8. ^ "Halmos Faculty Wins President's Distinguished Professor of the Year NSU Newsroom". nsunews.nova.edu. Retrieved 2022-04-02.
  9. ^ GIGA Community of Scientists; Bracken-Grissom, H.; Collins, A. G.; Collins, T.; Crandall, K.; Distel, D.; Dunn, C.; Giribet, G.; Haddock, S.; Knowlton, N.; Martindale, M.; Medina, M.; Messing, C.; O'Brien, S. J.; Paulay, G.; Putnam, N.; Ravasi, T.; Rouse, G. W.; Ryan, J. F.; Schulze, A.; Wörheide, G.; Adamska, M.; Bailly, X.; Breinholt, J.; Browne, W. E.; Diaz, M. C.; Evans, N.; Flot, J. F.; Fogarty, N.; et al. (2014). "The Global Invertebrate Genomics Alliance (GIGA): Developing Community Resources to Study Diverse Invertebrate Genomes". Journal of Heredity. 105 (1): 1–18. doi:10.1093/jhered/est084. PMC 4072906. PMID 24336862.
  10. ^ Koepfli, Klaus-Peter; Paten, Benedict; Genome 10K Community of Scientists (2015). "The Genome 10K Project: a way forward". Annu. Rev. Anim. Biosci. 3 (5): 57–111. doi:10.1146/annurev-animal-090414-014900. PMC 5837290. PMID 25689317.
  11. ^ i5K Consortium. (2013). "The i5K Initiative: advancing arthropod genomics for knowledge, human health, agriculture, and the environment". Journal of Heredity. 104 (5): 595–600. doi:10.1093/jhered/est050. PMC 4046820. PMID 23940263.
  12. ^ Lewin, Harris; Robinson, Gene; Kress, John; Baker, William (2018). "Earth BioGenome Project: Sequencing life for the future of life". Proceedings of the National Academy of Sciences. 115 (17): 4325–4333. doi:10.1073/pnas.1720115115. PMC 5924910. PMID 29686065.
  13. ^ Wilkinson, Clive (1987). "Significance of microbial symbionts in sponge evolution and ecology". Symbiosis.
  14. ^ Pace, Norm (1997). "A molecular view of microbial diversity and the biosphere". Science. 276 (5313): 734–740. doi:10.1126/science.276.5313.734. PMID 9115194.
  15. ^ Nancy Wiltsie (24 September 1961). "Filipino tradition followed at Quedding-Lopez wedding". Binghamton Sun-Bulletin.

외부 링크