메모리

GIMIAS
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GIMIAS GUI에는 멀티모달 바이오메디컬 이미지와 신호 네비게이션 툴의 멀티슬라이스 뷰가 포함되어 있습니다.
안정된 릴리스
1.5.r4 / 2012년 10월, 9년 전(2012-10년)
기입처C++
운영 체제Windows, Linux
유형과학적 시각화 및 이미지 컴퓨팅
면허증.BSD 스타일의
웹 사이트gimias.org

GIMIAS는 바이오메디컬 이미지 컴퓨팅과 시뮬레이션에 초점을 맞춘 워크플로우 지향 환경입니다.오픈 소스 프레임워크는 플러그인을 통해 확장할 수 있으며 연구 및 임상 소프트웨어 프로토타입을 구축하는 데 중점을 두고 있습니다.Gimias는 심장 영상 및 시뮬레이션, 혈관 조영 영상 및 시뮬레이션, 신경학[1][2] 분야에서 임상 프로토타입을 개발하는 데 사용되어 왔습니다.

GIMIAS는 cvREMod, euHeart 또는 VPH NoE와 [3]같은 여러 국가 및 국제 프로젝트에서 자금을 조달하고 있습니다.

GIMIAS에 대해서

GIMIAS는 의료 이미지 분석 및 시뮬레이션을 위한 Graphical Interface의 약자입니다.GIMIAS는 이미지, 메시 및 신호에 대한 모든 주요 데이터 IO, 시각화 및 상호작용 기능을 갖춘 그래픽 사용자 인터페이스를 제공합니다.GIMIAS의 특징은 다음과 같습니다.

  • DICOM 브라우저 및 PACS 연결
  • 다양한 이미징 모드 지원
  • 2D 및 3D 생물의학 데이터 시각화: 다중 평면 재구성, Ortho 슬라이스 뷰, 다중 슬라이스 뷰, 볼륨 렌더링, X선 렌더링, 최대 강도 투영
  • DICOM, vtk, stl, Nifty, Analyze 등 여러 입력 및 출력 형식입니다.
  • 동영상 컨트롤: 재생, 일시 중지, 속도 컨트롤
  • 다중 데이터 객체: 2D DICOM 이미지, 3D 이미지, 표면 메시, 볼륨 메시, 신호 또는 주석
  • 이미지 및 표면 메쉬 주석: 랜드마크, 측정 및 관심 영역
  • 사용자가 환자 데이터에서 환자 [4]치료에 유용한 정보로 이동할 수 있도록 도와주는 임상 워크플로우 탐색입니다.
  • 영상 분할, 메시 조작 및 신호 [5]탐색을 위한 기타 추가 도구.

GIMIAS는 개발자가 동적으로 로드 및 결합할 수 있는 다양한 플러그인을 사용하여 자체 의료 애플리케이션을 만들 수 있는 개발 프레임워크입니다.GIMIAS에서 개발된 프로토타입은 최종 사용자가 실제 시나리오와 [6]초기 개발 단계에서 실제 데이터를 사용하여 검증할 수 있습니다.

C++ 언어를 사용하여 개발되었으며 플러그인 아키텍처를 갖추고 있으며 표준 CMake 도구를 사용하여 크로스 플랫폼이 가능합니다.CSnake 툴을 사용하여 새로운 라이브러리를 통합할 수 있으며 VTK, ITK, MITK, BOOST 및 wxWidgets 등의 공통 오픈 소스 라이브러리를 기반으로 합니다.플러그인은 새로운 처리 컴포넌트, 툴바나 윈도 등의 GUI 컴포넌트, 새로운 데이터 처리 타입 또는 새로운 렌더링 [7]라이브러리를 추가하는 프레임워크를 확장할 수 있습니다.

GIMIAS는 간단한 DLL, 3D 슬라이서 호환 명령줄 플러그인 또는 맞춤형 그래픽 인터페이스를 갖춘 보다 복잡한 GIMIAS 플러그인 등 여러 유형의 플러그인을 지원합니다.자동화된 GUI 생성과 확장 가능한 데이터 객체 모델을 통해 플러그인을 다른 프레임워크와 공유할 수 있으며 상호 운용성을 강화할 수 있습니다.

이 소프트웨어는 Windows 및 Linux, 64비트 및 [8]32비트에서 사용할 수 있습니다.

역사

오픈 소스 프레임워크의 초기 버전은 2009년 말까지 공개되었다(GIMIAS 0.6.15는 2009년 [9]10월에 공개되었다).

2010년에는 워크플로우 매니저, 3D 슬라이서 플러그인 호환성, 시그널 뷰어, 커스터마이즈 가능한 뷰와 같은 더 많은 기능을 제공함으로써 오픈 소스 프레임워크 자체를 강화하기 위해 더 많은 노력을 기울였습니다.GIMIAS 버전 0.8.1, 1.0.0, 1.1.0 및 1.2.0이 올해 출시되었습니다.

GIMIAS 팀은 다음과 같이 협력하고 있습니다.

  • cmgui team: GIMIAS 소프트웨어[10][11] 플랫폼에서 임시 cmgui API를 사용해 봅니다.
  • CTK[12] 그룹
  • B3C 그룹(MAF)[13]

GIMIAS는 가상 생리 [14]인간에서 사용되는 도구 중 하나입니다.

임상 프로토타입

  • AngioLab은 GIMIAS 프레임워크 내에서 개발된 소프트웨어 도구이며 뇌동맥류 통합 관리를 위한 보다 야심찬 파이프라인의 일부입니다.Angio Lab에는 현재 혈관 분할, 혈관 형태학 가상 스텐트 및 가상 혈관 조영의 4가지 플러그인이 포함되어 있습니다.2009년 12월 23명의 임상의가 AngioLab에 대한 평가 설문지를 작성했다.이 활동은 스페인 바르셀로나 폼페우 파브라 대학에서 열린 제2회 유럽최소침습신경혈관치료학회(ESMINT) 교육 과정 중 열린 교육 과정의 일부였다.Automated Morphological Analysis(혈관형태학 플러그인)와 Endovicular Treature Planning(Stenting 플러그인)이 평가되었습니다.일반적으로 이러한 도구에 의해 제공되는 결과는 임상 [15][16]분야에서 관련성이 있고 새로운 요구로 간주되었다.
  • CardioLab:GIMIAS용 CardioLab 제품군을 사용하면 의료 영상에서 심근 질환의 특성화 및 정량화, CRT([17]심장 재동기 치료) 계획에 이르기까지 전체 워크플로우를 수행할 수 있습니다.
  • FocusDET: 난치성 부분 간질에서 간질 유발 포치의 정확한 위치 파악은 치료제로서 수술의 가능성을 뇌전증하는 데 필수적이다.ICTal 및 Inter-ICTal SPECT 영상과 SISCOM 방법론을 사용하는 MRI를 사용하여 간질 유발 포커스를 찾기 위해 특정 소프트웨어 패키지가 개발되었습니다.FocusDET는 GIMIAS [18]설비를 사용하여 개발되었습니다.
  • QuantiDopa는 도파민 작동 [19]시스템의 신경전달 SPECT 연구에서 선조체 흡수에 대한 반자동 정량화를 수행할 수 있는 소프트웨어입니다.

레퍼런스

  1. ^ I. Larrabide, P. Omedas, Y. Marteli, X. Planes, M. Niever, J. A.Moya, C.부타코프, R. 세바스티안, O. 카마라, M. 드 크레인, B.Bijnens, A.F. Frangi, GIMIAS: 연구 도구 및 임상 프로토타입을 효율적으로 개발하기 위한 오픈 소스 프레임워크, 417-426, 2009.
  2. ^ "VPH Requirements and Technology Assessment Exercise". Virtual Physiological Human Network of Excellence. p. 95. Archived from the original on 2011-07-20.
  3. ^ "cvREMOD web site". Archived from the original on 2010-05-30.
  4. ^ ahc. "I do imaging".
  5. ^ P. Omedas; Y. Martelli; I. Larrabide; B. H. Bijnens; A. F. Frangi. "Advance Tool for Visualization of Multi-modal and Multi-scale Cardiac Data" (PDF). UPF. p. 42. Archived from the original (PDF) on 2011-06-15.
  6. ^ "GIMIAS Home Page". Archived from the original on 2011-07-20.
  7. ^ GIMIAS Team. "GIMIAS architecture". slideshare.
  8. ^ Hamza Emadeen Mousa. "GIMIAS Medical Image Analysis and Simulation Solution for Windows and Linux". goomedic.
  9. ^ GIMIAS Team. "GIMIAS on SourceForge". SourceForge.
  10. ^ "CMGUI and Data Fusion". Virtual Physiological Human Network of Excellence. p. 30. Archived from the original on 2011-07-20.
  11. ^ "Introduction to cmgui". Auckland Bioengineering Institute.
  12. ^ "CTK-Hackfest-May-2010".
  13. ^ "B3C collaboration" (PDF). Archived from the original (PDF) on 2011-07-25.
  14. ^ "Virtual Physiological Human". Archived from the original on 2011-05-07.
  15. ^ M.C. 빌라-우리올, I. 라라비드, J.M. 포조, H. 보구노비치, P. 오메다스, V. 바르바리토, L. 카로테누토, C.리코빈, X. 플레인, Y. 마르텔리, A.J. 기어스, A.F.Frangi, AngioLab: 뇌내 동맥류 환자 고유 관리를 위한 통합 기술, 제32회 의학 및 생물학 학회(EMBS), 아르헨티나 부에노스아이레스, 2010년
  16. ^ "GIMIAS toolchain for aneurysm rupture". vph-noe. Archived from the original on 2011-07-20.
  17. ^ "Building a pipeline for in-silico modelling of cardiac resynchronization therapy". vph-noe. p. 11. Archived from the original on 2011-07-20.
  18. ^ B. Martí; Ó. Esteban; X. Planes; P. Omedas; G. Wollny; A. Cot; X. Setoain; A. Frangi; M. Ledesma-Carbayo; J. Pavia (2009). "FocusDET: A software tool to locate epileptogenic foci in intractable partial epilepsy". ENAM.[영구 데드링크]
  19. ^ "VPH2010 Conference Presentation Schedule". vph-noe. Archived from the original on 2011-07-20.

외부 링크