DNA메틸화I(DDM1)의 감소

Decrease in DNA Methylation I (DDM1)

DDM1, 감소된 DNA 메틸화 I은 DNA 메틸화를 촉진하는 뉴클레오솜 리모델링제를 코드하는 식물 유전자이다.DDM1 유전자는 Arabidopsis Thaliana와 옥수수에 광범위하게 기술되어 왔다.이 단백질은 SWI2/SNF2 염색질 리모델링 [1]단백질과 유사한 것으로 기술되었다.

DNA 메틸화는 주로 트랜스포저블 요소([2]TE)에서 발생하기 때문에 DDM1은 TE를 소음화하는 데 중요한 기능인 것으로 생각된다.

아라비도시스탈리아나(A.Thaliana)

DDM1은 고도로 헤테로크로마틴 전이성 요소에서 [3]DNA 메틸화에 필요하다.따라서 DDM1은 종종 전이성 요소를 침묵시키지만 아라비도시스 탈리아나의 돌연변이는 배아에 [3]치명적이지 않다.또한 DDM1 돌연변이는 살리실산 생산과 [4]헤테로시스 사이의 후생유전적 연결로 설명되었다.탈리아나는 DDM1 유전자의 단일 사본을 가지고 있다.

옥수수

DDM1은 옥수수에서 더 탐사되고 있다.A. 탈리아나와 달리, 옥수수는 두 개의 유전자 복제: CHR101과 CHR106을 [5]가지고 있다.옥수수에서 DDM1의 이중 돌연변이는 배아에 치명적이다.그러나 다른 연구들은 헤테로 접합체 돌연변이를 사용하고 있다.옥수수 게놈은 80% 트랜스포존이기[6] 때문에 DDM1 기능은 매우 중요합니다.

레퍼런스

  1. ^ Cho, Eun Ju; Choi, Seung Hee; Kim, Ji Hong; Kim, Ji Eun; Lee, Min Hee; Chung, Byung Yeoup; Woo, Hye Ryun; Kim, Jin-Hong; Candela, Hector (11 January 2016). "A Mutation in Plant-Specific SWI2/SNF2-Like Chromatin-Remodeling Proteins, DRD1 and DDM1, Delays Leaf Senescence in Arabidopsis thaliana". PLOS ONE. 11 (1): e0146826. doi:10.1371/journal.pone.0146826. PMC 4709239. PMID 26752684.
  2. ^ Law, Julie A.; Jacobsen, Steven E. (March 2010). "Establishing, maintaining and modifying DNA methylation patterns in plants and animals". Nature Reviews Genetics. 11 (3): 204–220. doi:10.1038/nrg2719. ISSN 1471-0056. PMC 3034103. PMID 20142834.
  3. ^ a b Zemach, Assaf; Kim, M. Yvonne; Hsieh, Ping-Hung; Coleman-Derr, Devin; Eshed-Williams, Leor; Thao, Ka; Harmer, Stacey L.; Zilberman, Daniel (March 2013). "The Arabidopsis Nucleosome Remodeler DDM1 Allows DNA Methyltransferases to Access H1-Containing Heterochromatin". Cell. 153 (1): 193–205. doi:10.1016/j.cell.2013.02.033. PMC 4035305. PMID 23540698.
  4. ^ Zhang, Qingzhu; Li, Yanqiang; Xu, Tao; Srivastava, Ashish Kumar; Wang, Dong; Zeng, Liang; Yang, Lan; He, Li; Zhang, Heng (December 2016). "The chromatin remodeler DDM1 promotes hybrid vigor by regulating salicylic acid metabolism". Cell Discovery. 2 (1): 16027. doi:10.1038/celldisc.2016.27. ISSN 2056-5968. PMC 4977722. PMID 27551435.
  5. ^ Li, Qing; Eichten, Steven R.; Hermanson, Peter J.; Zaunbrecher, Virginia M.; Song, Jawon; Wendt, Jennifer; Rosenbaum, Heidi; Madzima, Thelma F.; Sloan, Amy E. (December 2014). "Genetic Perturbation of the Maize Methylome". The Plant Cell. 26 (12): 4602–4616. doi:10.1105/tpc.114.133140. ISSN 1040-4651. PMC 4311211. PMID 25527708.
  6. ^ Schnable, P. S.; Ware, D.; Fulton, R. S.; Stein, J. C.; Wei, F.; Pasternak, S.; Liang, C.; Zhang, J.; Fulton, L. (2009-11-20). "The B73 Maize Genome: Complexity, Diversity, and Dynamics". Science. 326 (5956): 1112–1115. doi:10.1126/science.1178534. ISSN 0036-8075. PMID 19965430. S2CID 21433160.