cAMP 수용체 단백질

cAMP receptor protein
C반응성 단백질과 혼동해서는안 된다.
CAMP수용체단백질
1i5z.jpg
대장균 순환 AMP 수용체 단백질의 구조
식별자
기호CRP
Alt. 기호캡
엔씨비유전자947867
PDB1I5Z
RefSeqNP_417816.1
유니프로트P0ACJ8

cAMP 수용체 단백질(CRP, CATabolite 활성제 단백질이라고도 함)은 박테리아 내 조절 단백질이다.CRP 단백질은 cAMP를 결합시킨다. cAMP는 CRP가 통제하는 유전자의 촉진자 내 특정 DNA 사이트에 단단히 결합할 수 있는 순응적 변화를 일으킨다.[1][2]그런 다음 CRP는 RNA 중합효소와의 직접 단백질-단백질 상호작용을 통해 전사를 활성화한다.[1][2]

CRP에 의해 조절된 유전자는 갈락토오스, 구연산염, 또는 PEP 그룹 변환 시스템과 같은 에너지 대사에 주로 관여한다.[3][4]대장균에서는 주기성 AMP 수용체 단백질(CRP)이 100개 이상의 유전자의 전사를 조절할 수 있다.

CRP를 활성화하기 위한 신호는 주기적 AMP의 결합이다. cAMP를 CRP로 결합하면 N단자 cAMP 바인딩 영역에서 단백질의 C단자 영역으로 장거리 신호 전도가 이루어지며, 이는 DNA의 특정 시퀀스와의 상호작용을 담당한다.[5]

"클래스 I" CRP 의존적 프로모터에서는 CRP가 핵심 프로모터 요소의 업스트림에 위치한 DNA 사이트에 결합하고, CRP의 "활성화 영역 1"과 RNA 중합효소 알파 소단위 C-단자 영역 사이의 단백질-단백질 상호작용을 통해 전사를 활성화한다.[1][2][6]"클래스 II" CRP 의존적 촉진자에서 CRP는 촉진자 -35 원소와 중첩되는 DNA 사이트에 결합하고 (1) CRP의 "활성화 영역 1"과 RNA 중합효소 알파 소단위 C-단말 영역 사이의 상호작용, (2) "활성화 영역 2 o" 사이의 상호작용을 통해 전사를 활성화한다.f CRP 및 RNA 중합효소 알파 서브유닛의 N단자 영역.[1][2]"클래스 III" CRP 종속 프로모터에서는 CRP가 하나 이상의 "공동활성화제" 단백질과 함께 기능한다.[1][2]

대부분의 CRP 의존적 프로모터에서는 CRP와 RNA 중합효소 사이의 단백질-단백질 상호작용이 촉진자에 대한 RNA 중합효소의 결합을 돕는 "채취" 메커니즘을 통해 주로 또는 독점적으로 전사를 활성화한다.[1]

참조

  1. ^ a b c d e f Busby S., Ebright RH. (1999). "Transcription activation by catabolite activator protein (CAP)". J. Mol. Biol. 293 (2): 199–213. doi:10.1006/jmbi.1999.3161. PMID 10550204.
  2. ^ a b c d e Lawson CL, Swigon D, Murakami KS, Darst SA, Berman HM, Ebright RH (2004). "Catabolite activator protein: DNA binding and transcription activation". Curr. Opin. Struct. Biol. 14 (1): 10–20. doi:10.1016/j.sbi.2004.01.012. PMC 2765107. PMID 15102444.
  3. ^ Weickert MJ, Adhya S (1993). "The galactose regulon of Escherichia coli". Mol. Microbiol. 10 (2): 245–51. doi:10.1111/j.1365-2958.1993.tb01950.x. PMID 7934815. S2CID 6872903.
  4. ^ Bott M (1997). "Anaerobic citrate metabolism and its regulation in enterobacteria". Arch. Microbiol. 167 (2–3): 78–88. doi:10.1007/s002030050419. PMID 9133329. S2CID 22913073.
  5. ^ Popovych, N.; Tzeng, S. -R.; Tonelli, M.; Ebright, R. H.; Kalodimos, C. G. (2009). "Structural basis for cAMP-mediated allosteric control of the catabolite activator protein". Proceedings of the National Academy of Sciences. 106 (17): 6927–6932. doi:10.1073/pnas.0900595106. PMC 2678429. PMID 19359484.
  6. ^ Hudson, B. P.; Quispe, J.; Lara-Gonzalez, S.; Kim, Y.; Berman, H. M.; Arnold, E.; Ebright, R. H.; Lawson, C. L. (2009). "Three-dimensional EM structure of an intact activator-dependent transcription initiation complex". Proceedings of the National Academy of Sciences. 106 (47): 19830–19835. doi:10.1073/pnas.0908782106. PMC 2775702. PMID 19903881.