IF 소프트웨어
WHAT IF software| 원본 작성자 | 게르트 빈즈, 크리스 샌더, 볼프강 캅시 |
|---|---|
| 개발자 | 그루닝언 대학교 EMBL, 하이델베르크; CMBI, Radboud University Nijmegen; Radboud University Nijmegen 의료 센터(Radboudumc) WHAT IF Foundation |
| 초기 릴리즈 | 1987년 12월 6일 전) |
| 안정적 해제 | 6.0 / 2016; 전( |
| 기록 위치 | 포트란, C, 오픈GL |
| 운영 체제 | 리눅스 |
| 플랫폼 | x86 |
| 다음에서 사용 가능 | 영어 |
| 유형 | 분자 모델링 |
| 면허증 | 학업을 위한 독점 쉐어웨어 |
| 웹사이트 | swift |
왓 IF는 다양한 컴퓨터(실리코) 고분자 구조 연구 분야에서 사용되는 컴퓨터 프로그램이다.소프트웨어는 작고 큰 분자, 단백질, 핵산, 그리고 이들의 상호작용을 표시, 조작, 분석할 수 있는 유연한 환경을 제공한다.[1][2]
역사
WHAT IF 소프트웨어의 첫 버전은 Gert Vynez에 의해 1987년 네덜란드 Groningen 대학교에서 개발되었다.[2]개발의 대부분은 1989-2000년 독일 하이델베르크의 유럽 분자생물학연구소(EMBL)에서 발생했다.다른 기여자들로는 크리스 샌더와 볼프강 캅쉬가 있다.[3]2000년에 이 소프트웨어의 정비는 네덜란드 니메겐에 있는 분자 및 생체 분자 정보학 센터(CMBI)로 옮겨졌다.[1]사내에서 사용하거나 웹 기반 자원으로 사용할 수 있다.[4]2022년[update] 2월 현재 WHAT IF를 기술한 원본 논문은 4000회 이상 인용되었다.
소프트웨어
What IF는 작은 분자, 단백질, 핵산 및 이들의 상호작용을 표시, 조작 및 분석할 수 있는 유연한 환경을 제공한다.한 가지 주목할 만한 용도는 PDB(Protental Data Bank) 파일에서 수백만 개의 오류(흔히 작지만 때로는 치명적인 오류)를 탐지하는 것이었다.[5]IF는 또한 다음을 위한 환경을 제공한다: 단백질 3차 구조와 2차 구조물의 동질학적 모델링, 특히 PDB에 축적된 단백질 구조 검증, 단백질 구조 수정, 고분자와 그 상호작용 파트너(예: 지질, 약물, 이온, 물) 시각화, 매크로몰레쿠 조작쌍방향으로
WHAT IF는 YASARA와 Jmol을 포함한 몇 가지 다른 생물정보학 소프트웨어 패키지와 호환된다.[1]
참고 항목
외부 링크
참조
- ^ a b c "WHAT IF homepage". Retrieved 21 February 2022.
- ^ a b Vriend, G (March 1990). "WHAT IF: a molecular modeling and drug design program". Journal of Molecular Graphics. 8 (1): 52–6, 29. doi:10.1016/0263-7855(90)80070-v. PMID 2268628.
- ^ "WHAT IF - Who are we". Retrieved 11 August 2015.
- ^ Rodriguez, R; Chinea, G; Lopez, N; Pons, T; Vriend, G (1998). "Homology modeling, model and software evaluation: three related resources". Bioinformatics. 14 (6): 523–8. doi:10.1093/bioinformatics/14.6.523. PMID 9694991.
- ^ Hooft, RW; Vriend, G; Sander, C; Abola, EE (23 May 1996). "Errors in protein structures". Nature. 381 (6580): 272. doi:10.1038/381272a0. PMID 8692262.
