VTS1

Vts1
VTS1
Vts1P SRE Recognition SAM domain.jpg
Vts1p-SRE [1]복합체의 결정 구조.
식별자
기호.VTS1
PF07647
SCOP21 b0x / SCOPe / SUPFAM

Vts1은 RNA 결합 멸균 알파 모티브([2][3]SAM) 도메인을 가진 전사 후 조절기입니다.그 단백질은 사카로미세스 세레비시아에와 몇몇 진핵생물에서 발견된다.사카로미세스에서 Vts1은 소포 운반과 [4][5]포자영향을 미칩니다.

상호 작용

Vts1과 상호작용하는 RNA 영역의 2차 구조 모티브

SAM 도메인을 통한 단백질-단백질 상호작용은 신호 전달과 같은 다른 조절 활동에 참여한다.그러한 도메인을 가진 단백질은 또한 Smaug 반응 요소(SRE)[6]와 유사한 형태의 RNA 구조를 인식하고 상호작용하는 것으로 나타났다.Vts1은 헤어핀 [7]루프에 CUGC가 있는 RNA 타깃에 결합합니다.

레퍼런스

  1. ^ Philip E Johnson & Logan W Donaldson (Jan 2006). "SRNA recognition by the Vts1p SAM domain". Nature Structural & Molecular Biology. 13 (1): 177–178. doi:10.1038/nsmb1039. PMID 16429155. S2CID 9561521.
  2. ^ Bork P, Ponting CP, Hofmann K, Schultz J (1997). "SAM as a protein interaction domain involved in developmental regulation". Protein Sci. 6 (1): 249–253. doi:10.1002/pro.5560060128. PMC 2143507. PMID 9007998.
  3. ^ Florian C Oberstrass, Albert Lee, Richard Stefl, Michael Janis, Guillaume Chanfreau & Frédéric H-T Allain (Jan 2006). "Shape-specific recognition in the structure of the Vts1p SAM domain with RNA". Nature Structural & Molecular Biology. 13 (2): 160–167. doi:10.1038/nsmb1038. PMID 16429156. S2CID 15416866.{{cite journal}}: CS1 maint: 여러 이름: 작성자 목록(링크)
  4. ^ Adam M. Deutschbauer, Roy M. Williams, Angela M. Chu, and Ronald W. Davis (November 2002). "Parallel phenotypic analysis of sporulation and postgermination growth in Saccharomyce scerevisiae". PNAS. 99 (24): 15530–15535. Bibcode:2002PNAS...9915530D. doi:10.1073/pnas.202604399. PMC 137751. PMID 12432101.{{cite journal}}: CS1 maint: 여러 이름: 작성자 목록(링크)
  5. ^ Meik Dilcher, Beate Köhler and Gabriele Fischer von Mollard (September 2001). "Genetic Interactions with the Yeast Q-SNARE VTI1 Reveal Novel Functions for the R-SNARE YKT6". The Journal of Biological Chemistry. 276 (37): 34537–34544. doi:10.1074/jbc.M101551200. PMID 11445562.
  6. ^ Traci M Tanaka Hall (2003). "SAM breaks its stereotype". Nature Structural & Molecular Biology. 10 (9): 677–679. doi:10.1038/nsb0903-677. PMID 12942139. S2CID 9072100.
  7. ^ Florian C Oberstrass, Albert Lee, Richard Stefl, Michael Janis, Guillaume Chanfreau and Frédéric H-T Allain (January 2006). "Shape-specific recognition in the structure of the Vts1p SAM domain with RNA". Nature Structural & Molecular Biology. 13 (2): 160–167. doi:10.1038/nsmb1038. PMID 16429156. S2CID 15416866.{{cite journal}}: CS1 maint: 여러 이름: 작성자 목록(링크)