U5 스플라이소솜 RNA

U5 spliceosomal RNA
U5 스플라이소솜 RNA
RF00020.jpg
U5의 2차 구조 및 시퀀스 보존 예측
식별자
기호U5
RfamRF00020
기타자료
RNA형유전자; snRNA; 스플라이싱
도메인에우카리오타
바둑GO:0000351 GO:0000353 GO:0005682 GO:0046540
그렇게SO:0000395
PDB 구조PDBe

U5 snRNA는 스플라이소솜의 성분으로 RNA 스플라이싱에 참여하는 작은 핵 RNA(snRNA)이다.그것은 스플라이소솜에서 가장 크고 가장 보존된 단백질인 Prp8, 스플라이소솜 활성화에 필요한 헬리코아제인 Brr2, Snu114, 그리고 7Sm 단백질을 포함한 여러 단백질과 연관시켜 U5 snRNP(소형 핵 리보뉴클레오프로틴)를 형성한다.[1]U5 snRNA는 스플라이소솜의 활성 부위로 투영되는 동축적으로 쌓인 나선 시리즈를 형성한다.[2][3]이 일련의 나선들을 덮는 루프 1은 스플라이싱의 두 화학 반응 동안 5'-엑손과 4-5 베이스 쌍을 형성한다.[4][5]이러한 상호작용은 스플라이싱, 외향적 레깅의 2단계에서 특히 중요한 것으로 보인다.[6]

참조

  1. ^ Stevens SW, Barta I, Ge HY, Moore RE, Young MK, Lee TD, Abelson J (November 2001). "Biochemical and genetic analyses of the U5, U6, and U4/U6 x U5 small nuclear ribonucleoproteins from Saccharomyces cerevisiae". RNA. 7 (11): 1543–53. PMC 1370197. PMID 11720284.
  2. ^ Nguyen TH, Galej WP, Bai XC, Savva CG, Newman AJ, Scheres SH, Nagai K (July 2015). "The architecture of the spliceosomal U4/U6.U5 tri-snRNP". Nature. 523 (7558): 47–52. Bibcode:2015Natur.523...47N. doi:10.1038/nature14548. PMC 4536768. PMID 26106855.
  3. ^ Yan C, Hang J, Wan R, Huang M, Wong CC, Shi Y (September 2015). "Structure of a yeast spliceosome at 3.6-angstrom resolution". Science. 349 (6253): 1182–91. Bibcode:2015Sci...349.1182Y. doi:10.1126/science.aac7629. PMID 26292707. S2CID 22194712.
  4. ^ Newman AJ, Norman C (February 1992). "U5 snRNA interacts with exon sequences at 5' and 3' splice sites". Cell. 68 (4): 743–54. doi:10.1016/0092-8674(92)90149-7. PMID 1739979. S2CID 3328508.
  5. ^ Sontheimer EJ, Steitz JA (December 1993). "The U5 and U6 small nuclear RNAs as active site components of the spliceosome". Science. 262 (5142): 1989–96. Bibcode:1993Sci...262.1989S. doi:10.1126/science.8266094. PMID 8266094.
  6. ^ O'Keefe RT, Norman C, Newman AJ (August 1996). "The invariant U5 snRNA loop 1 sequence is dispensable for the first catalytic step of pre-mRNA splicing in yeast". Cell. 86 (4): 679–89. doi:10.1016/s0092-8674(00)80140-3. PMID 8752221. S2CID 17484887.

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외부 링크


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