팁 데이트

Tip dating

팁 데이트분자 데이트에 사용되는 기술로, 시간 보정된 계통생성 나무를 추론할 수 있다. 그것의 정의적 특징은 진화 나무의 내부 노드에 나이 제한을 적용해야 하는 전통적인 '노드 데이트' 방법과 대조적으로, 분석을 위한 시간 정보를 제공하기 위해 표본의 나이를 사용한다는 것이다.

팁 데이트에서 형태학적 데이터와 분자 데이터를 함께 분석하여 라인 간 진화 관계(나무 위상)와 차이 시간(노드 시간)을 추정한다. 이 접근법은 '총증거 데이트'라고도 한다. 그러나 팁 데이트는 형태학적 문자만 구성하거나 분자 문자만 구성되는 데이터 세트(예: 고대 DNA 샘플 또는 연속적으로 샘플링된 바이러스를 포함하는 데이터 세트)를 분석하는 데도 사용할 수 있다.

팁 데이팅은 베이시안 계통학 소프트웨어에서 구현되어 왔으며 일반적으로 진화를 위해 화석화된 생사 모델을 이용한다. 이것은 화석과 현존하는 세자분화, 소멸, 표본추출을 가능하게 하는 다양화의 모델이다.

이 유망한 방법은 아직 완전히 성숙되지 않았으며, 그 결과를 해석할 때 고려해야 할 여러 가지 가능한 편견이나 바람직하지 않은 행동이 있다.[1]

참조

  1. ^ Luo, Arong; Duchêne, David A.; Zhang, Chi; Zhu, Chao-Dong; Ho, Simon (2019). "A Simulation-Based Evaluation of Tip-Dating Under the Fossilized Birth-Death Process". Systematic Biology. doi:10.1093/sysbio/syz038.