합성구조

Synthetic rescue

인공 구조(합성 회복이나 합성 가능성 때 치명적인 표현형 구조되[1][2])은, 특정한 약물 또는 다른 유전자 돌연변이의 존재로 인해 imparied에 민감하고 경쟁력 없는은 휴대하게 될 때 원본 돌연변이 두번째 돌연변이를 지닌 d에 유전적 상호 작용을 말한다ifferent유전자[1]두 번째 돌연변이는 기능상실 돌연변이(knockout과 동일) 또는 기능상실 돌연변이일 수 있다.[2]null

합성구조는 잠재적으로 유전자 치료를 위해 이용될 수 있지만, 또한 상호작용에 관련된 유전자의 기능에 대한 정보를 제공한다.

유전적 억제 유형

복용량 매개 억제

용량 매개 억제란 돌연변이 표현형의 억제가 두 번째 억제 유전자의 과잉 발현에 의해 매개될 때 발생한다.이것은 초기 돌연변이가 단백질-단백질 상호작용을 불안정하게 하고 상호 작용하는 단백질의 과다표현이 초기 돌연변이의 부정적 영향을 우회할 때 발생할 수 있다.null

상호작용 매개 억제

상호작용 매개 억제 작용은 단백질 복합체의 성분의 유해한 돌연변이가 복합체를 불안정하게 할 때 발생한다.단백질 복합체의 다른 성분의 보상 돌연변이는 두 단백질 사이의 상호작용을 다시 설정함으로써 해로운 표현형을 억제할 수 있다.다단백질 복합체의 3차원 구조에 밀접하게 위치한 두 개의 잔류물에서 유해 돌연변이와 억제 돌연변이가 발생하는 것이 보통이다.이와 같이, 이러한 종류의 억제는 관련된 단백질의 분자 구조에 대한 간접적인 정보를 제공한다.null

이론적 예측의 실험적 관찰

유전자 녹아웃의 유해한 영향이 분리하여 고려할 때 또한 유해한 추가 유전적 동요에 의해 완화되는 가장 강력한 형태의 합성구조는 대사망에 의해 매개되는 유전자 상호작용에 대해 이론적으로 모델링되고 예측되었다.[1]이러한 강력한 형태의 합성 구조는 최근 두 사카로미스 세레비시아의 실험에서 관찰되고 있다.[3]그리고 대장균.[4]환자 생존 분석은 또한 합성 구조와 다른 유형의 상호작용을 예측하는 것으로 나타났다.[5]null

tRNA 매개 억제

유전자 억제는 돌연변이가 그들의 해독 순서를 바꿀 때 tRNA 유전자에 의해 매개될 수 있다.예를 들어, 성장하는 폴리펩타이드 체인에 코돈 TCA의 인식과 그에 상응하는 세린 삽입을 위해 지정된 tRNA는 변이되어 TAA 정지 코돈을 인식하고 폴리펩타이드 체인의 종료 대신 세린 삽입을 촉진할 수 있다.이것은 특히 난센스 돌연변이(TCA >TAA)가 부분적으로 완성된 폴리펩타이드로 이어지거나 난센스 매개 붕괴에 의한 mRNA의 분해로 이어져 유전자의 발현을 막는 경우에 유용할 수 있다.tRNA 유전자의 중복성은 그러한 돌연변이가 TCA 코돈이 세린을 지정할 때 세린의 정상적인 삽입을 방해하지 않도록 한다.null

참고 항목

참조

  1. ^ a b c Motter, Adilson E; Gulbahce, Natali; Almaas, Eivind; Barabási, Albert-László (2008). "Predicting synthetic rescues in metabolic networks". Molecular Systems Biology. 4: 168. arXiv:0803.0962. doi:10.1038/msb.2008.1. ISSN 1744-4292. PMC 2267730. PMID 18277384.
  2. ^ a b Puddu, F.; Oelschlaegel, T; Guerini, I; Geisler, NJ; Niu, H; Herzog, M; Salguero, I; Ochoa-Montaño, B; Viré, E; Sung, P; Adams, DJ; Keane, TM; Jackson, SP (2015). "Synthetic viability genomic screening defines Sae2 function in DNA repair". EMBO Journal. 34 (11): 1509–1522. doi:10.15252/embj.201590973. PMC 4474527. PMID 25899817.
  3. ^ S. H., Hyland P. B., Mahadevan K의 합성 구조는 NADPH 생성을 메타베이스의 사카로마이오스 세레비시아에 있는 대사물 과잉 생산에 결합한다.Eng. 43, 64 (2017)
  4. ^ Wytock T. P. 외 연구진, 다양한 대장균 대사 돌연변이의 실험적 진화는 성장률의 수렴적응을 위한 유전자 위치, PLoS Genetics 14(3), e1007284(2018)를 식별한다.
  5. ^ Magen, A (2019). "Beyond Synthetic Lethality: Charting the Landscape of Pairwise Gene Expression States Associated with Survival in Cancer". Cell Reports. 28 (4): P938–948.E6. doi:10.1016/j.celrep.2019.06.067. PMC 8261641. PMID 31340155.