소핵소 RNA유래 마이크로RNA

Small nucleolar RNA-derived microRNA

분자생물학에서, 작은 핵소형 RNA는 작은 핵소형 RNA(snoRNA)에서 파생된 마이크로RNA(miRNA)이다.마이크로RNA는 일반적으로 프리미RNA로 알려진 전구체에서 파생되며, 이러한 프리미RNA는 파샤 및 드로샤 단백질에 의해 프리미RNA 전구체에서 인식되고 분리된다.그러나 일부 마이크로RNA, 미르톤은 파샤와 드로샤를 우회하는 다른 경로를 통해 인트론에서 파생되는 것으로 알려져 있다.일부 마이크로 RNA는 또한 작은 핵소체 RNA에서 파생된 것으로 알려져 있다.

검출

작은 핵소형 RNA 유도 마이크로RNA는 2008년에 처음 기술되었다.원생 장내 기생충 Giardia lamblia는 pri-miRNA에서 miRNA 전 분열에 관여하는 Drosha 단백질이 결핍되어 있다.그러나 miRNA 처리 단백질 다이서는 [1]Giardia에서 발견된다.Giardia lamblia snoRNA GlsR17에서 다이서로 26 뉴클레오티드 RNA miR2를 처리한다.MiR2는 변종 표면 [2]단백질의 발현을 조절할 수 있는 마이크로RNA이다.

또한 2008년 다이서에 의해 작은 RNA가 인간의 작은 카잘 신체 특이적 RNA인 SCARNA15에서 분리된 것이 발견되었다.이 작은 RNA는 마이크로RNA로 기능하는 것으로 밝혀졌으며, 잠재적인 마이크로RNA는 몇몇 다른 인간의 snoRNA에서도 확인되었다.[3]

Giardia snoRNA유래 miRNA

Giardia lamblia는 최소 20개의 [4]snoRNA를 생성합니다.SnoRNA는 rRNA의 변형을 유도하고 표적 [5]RNA에 상보적인 10~21개의 뉴클레오티드 영역을 포함한다. Giardia lamblia snoRNA 중 5개는 rRNA에 상보성이 없으므로 다른 기능을 가질 [4]수 있음을 의미한다.마이크로RNA는 Giardia lamblia의 5개의 박스 C/D snoRNA에서 파생됩니다.

  • microRNA miR2는 snoRNA GlsR17에서 파생되며 변종 표면[2] 단백질의 발현을 조절할 수 있다.
  • microRNA miR3는 snoRNA GlsR16에서[2] 파생됩니다.
  • microRNA miR5는 snoRNA GlsR2에서 파생됩니다.MiR5는 4개의 키나아제 및 3개의 변종 표면 단백질을 포함한 여러 다른 유전자의 발현을 조절할 수 있다.변종 표면 단백질은 miR2에[6] 의해 잠재적으로 조절되는 단백질과 다르다.
  • microRNA miR6는 snoRNA GlsR1에서 파생됩니다.이 miRNA의 예측 대상 부위는 변이 표면 단백질을[7] 포함한다.
  • microRNA miR10은 snoRNA GlsR8에서 파생됩니다.이 miRNA의 예측 대상 부위는 변이 표면 단백질을[7] 포함한다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Macrae IJ, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks AN, Cande WZ, et al. (2006). "Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer". Science. 311 (5758): 195–198. Bibcode:2006Sci...311..195M. doi:10.1126/science.1121638. PMID 16410517. S2CID 23785494.
  2. ^ a b c Saraiya AA, Wang CC (2008). "snoRNA, a novel precursor of microRNA in Giardia lamblia". PLOS Pathog. 4 (11): e1000224. doi:10.1371/journal.ppat.1000224. PMC 2583053. PMID 19043559.
  3. ^ Ender C, Krek A, Friedländer MR, Beitzinger M, Weinmann L, Chen W, et al. (2008). "A human snoRNA with microRNA-like functions". Mol Cell. 32 (4): 519–528. doi:10.1016/j.molcel.2008.10.017. PMID 19026782.
  4. ^ a b Yang CY, Zhou H, Luo J, Qu LH (2005). "Identification of 20 snoRNA-like RNAs from the primitive eukaryote, Giardia lamblia". Biochem Biophys Res Commun. 328 (4): 1224–1231. doi:10.1016/j.bbrc.2005.01.077. PMID 15708007.
  5. ^ Kiss-László Z, Henry Y, Kiss T (1998). "Sequence and structural elements of methylation guide snoRNAs essential for site-specific ribose methylation of pre-rRNA". EMBO J. 17 (3): 797–807. doi:10.1093/emboj/17.3.797. PMC 1170428. PMID 9451004.
  6. ^ Li W, Saraiya AA, Wang CC (2011). "Gene regulation in Giardia lambia involves a putative microRNA derived from a small nucleolar RNA". PLOS Negl Trop Dis. 5 (10): e1338. doi:10.1371/journal.pntd.0001338. PMC 3196473. PMID 22028939.
  7. ^ a b Li W, Saraiya AA, Wang CC (2012). "The profile of snoRNA-derived microRNAs that regulate expression of variant surface proteins in Giardia lamblia". Cell Microbiol. 14 (9): 1455–1473. doi:10.1111/j.1462-5822.2012.01811.x. PMC 3422372. PMID 22568619.